《科學(xué)》:近70000個(gè)細(xì)胞測(cè)序 人類首個(gè)腎臟免疫細(xì)胞圖譜問世
最新一期《科學(xué)》雜志上,刊登了人類細(xì)胞圖譜(Human Cell Atlas)的一項(xiàng)新進(jìn)展。
來(lái)自英國(guó)多家研究機(jī)構(gòu)的科學(xué)家,合作展示了人類第一份腎臟免疫細(xì)胞圖譜。研究者對(duì)來(lái)自胚胎和成年個(gè)體的近70000個(gè)腎臟細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序,在此基礎(chǔ)上繪制出腎臟內(nèi)的免疫細(xì)胞群。這份全面的細(xì)胞普查將為腎臟相關(guān)疾病的診斷和治療提供依據(jù)。
腎臟位于腰部?jī)蓚?cè)后方,對(duì)過濾血液具有重要作用。一對(duì)腎臟每分鐘可過濾約半杯血液,清除其中的廢物和多余的水,使其以尿液的形式排出體外。腎臟維持了血液中水、鹽和礦物質(zhì)的健康平衡,才能使人體其他部位的神經(jīng)、肌肉以及各種組織正常工作。
人有一對(duì)腎(圖片來(lái)源:參考資料[3])
當(dāng)腎臟受損無(wú)法正常過濾血液時(shí),會(huì)逐漸喪失功能,引發(fā)慢性腎病。相關(guān)數(shù)據(jù)顯示,全球超過8.5億人患有慢性腎病,通常由糖尿病、高血壓和復(fù)發(fā)性感染引起。慢性腎臟疾病可以發(fā)展為腎衰竭,如果沒有透析或腎移植,將危及生命。
在應(yīng)對(duì)腎臟組織損傷時(shí),免疫系統(tǒng)發(fā)揮著重要作用,可我們對(duì)腎臟內(nèi)的作用機(jī)理卻所知甚少。因此,構(gòu)建腎臟免疫細(xì)胞圖譜,可以幫助我們更好地理解慢性腎臟疾病是怎么發(fā)生和發(fā)展的,還可以知道為什么在腎移植時(shí)會(huì)發(fā)生排斥反應(yīng),最終造福人類的健康。
腎的解剖結(jié)構(gòu),腎單位(nephron)是其基本功能單位(圖片來(lái)源:參考資料[1])
為了構(gòu)建這份圖譜,研究人員分別研究了胎兒、兒童和成人的腎臟組織,繪制出不同生命發(fā)育階段、腎臟特定區(qū)域存在的免疫細(xì)胞類型。
研究者一共分析了將近70000個(gè)細(xì)胞,采用單細(xì)胞RNA測(cè)序,了解每個(gè)細(xì)胞中處于激活狀態(tài)的基因,并查明存在的免疫細(xì)胞類型。
“我們?cè)谀I臟不同區(qū)域繪制出不同類型免疫細(xì)胞的分布,”共同通訊作者、惠康桑格研究所(Wellcome Sanger Institute)、劍橋大學(xué)的Menna Clatworthy教授介紹,“在靠近尿液通過輸尿管離開腎臟的位置,我們看到一個(gè)強(qiáng)大的免疫防護(hù)區(qū),可以抵抗尿路感染。了解健康腎臟中不同的細(xì)胞如何抵御疾病,對(duì)于應(yīng)對(duì)慢性腎病的發(fā)展和確定新療法十分重要。”
對(duì)成熟腎細(xì)胞的類型分析,其中紅色表示不同的免疫細(xì)胞(圖片來(lái)源:參考資料[1])
而對(duì)胚胎不同時(shí)期的分析發(fā)現(xiàn),正在發(fā)育的腎臟里,最早建立的細(xì)胞群是巨噬細(xì)胞。隨著年齡的增長(zhǎng),這類可以吞噬有害細(xì)菌和病毒的大個(gè)頭白細(xì)胞仍會(huì)留在腎臟中,發(fā)揮著保護(hù)人體免受感染的重要作用。
此外,胚胎發(fā)育時(shí)期,腎臟里幾乎沒有活躍的免疫細(xì)胞,與“胎兒相對(duì)來(lái)說(shuō)無(wú)菌”的觀點(diǎn)一致。我們?cè)诔錾鷷r(shí)和出生后遇到細(xì)菌等外源微生物,才促使免疫系統(tǒng)不斷發(fā)展。
胚胎不同發(fā)育時(shí)期的腎細(xì)胞類型分析(圖片來(lái)源:參考資料[1])
“我們創(chuàng)建了首份地圖,顯示腎臟免疫系統(tǒng)在生命早期如何發(fā)育,以及隨著進(jìn)入成年如何變化。”該研究的共同通訊作者、紐卡斯?fàn)柎髮W(xué)(Newcastle University)的Muzlifah Haniffa教授說(shuō),“我們?cè)谔幱诎l(fā)育階段的腎臟中找到了最早的細(xì)胞類型,這些一生都在腎臟內(nèi)的巨噬細(xì)胞對(duì)保護(hù)我們抵抗感染非常重要。”
在另一位共同主要作者、劍橋大學(xué)的Sam Behjati博士看來(lái):“這份腎臟細(xì)胞圖譜提供了一個(gè)新的窗口讓我們了解兒童腎臟疾病,包括兒童腎癌,是怎么發(fā)生的。研究者能由此探究疾病相關(guān)的基本問題,比如為什么有些病人對(duì)治療有反應(yīng)、有些病人卻沒有?!?/p>
人類細(xì)胞圖譜計(jì)劃的聯(lián)席主席Sarah Teichmann博士也是這項(xiàng)研究的主要作者之一,她指出:“人類腎臟圖譜的繪制使我們離人類細(xì)胞圖譜的產(chǎn)生又近了一步。”在這個(gè)全球合作的項(xiàng)目中,研究人員希望最終制出一張包含人體37萬(wàn)億細(xì)胞的“谷歌地圖”?!拔覀儗l(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞類型,揭示細(xì)胞如何隨年齡變化,了解我們?nèi)绾嗡ダ?、為什么?huì)衰老,以及生病時(shí)會(huì)發(fā)生什么。人類細(xì)胞圖譜將是一個(gè)免費(fèi)的在線資源,任何人都可以使用。”
參考資料
[1] Benjamin J. Stewart et al. (2019). Spatiotemporal immune zonation of the human kidney. Science, DOI 10.1126/science.aat5031
[2] Human kidney map charts our growing immune defense. Retrieved 26-SEP-2019, from https://www.sanger.ac.uk/news/view/human-kidney-map-charts-our-growing-immune-defence
[3] Your Kidneys & How They Work. Retrieved 26-Sep-2019, from https://www.niddk.nih.gov/health-information/kidney-disease/kidneys-how-they-work
來(lái)源:學(xué)術(shù)經(jīng)緯


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