4月28日，國際重要學術(shù)期刊《病毒學期刊》（Journal of Virology）在線發(fā)表了中國科學院上海巴斯德研究所崔杰研究組題為“Multiple infiltration and cross-species transmission of foamy viruses across Paleozoic to Cenozoic era”的最新研究成果。

　　病毒無法形成化石，因而難以了解它們在大時間尺度下的進化規(guī)律。然而，隨著“分子化石”內(nèi)源性逆轉(zhuǎn)錄病毒的發(fā)現(xiàn)和分析技術(shù)的提升，使得探索病毒的原始狀態(tài)以及和宿主的相互作用成為了可能。泡沫病毒（foamy viruses）是可以感染人和其他動物的復雜逆轉(zhuǎn)錄病毒，具有突變速率低、基因組相對穩(wěn)定等特點，是研究病毒-宿主共進化的最佳模型。

　　逆轉(zhuǎn)錄病毒和泡沫病毒元件的無根系統(tǒng)發(fā)育樹：使用病毒的逆轉(zhuǎn)錄蛋白結(jié)構(gòu)域（reverse transcriptase，RT）進行繪制。泡沫病毒（FVs）、內(nèi)源性泡沫病毒（EFVs）和轉(zhuǎn)錄的泡沫病毒（exFVs）的宿主信息用彩色陰影表示，新鑒定的病毒元件用加粗的紅色字體表示。

　　崔杰團隊在兩棲動物中發(fā)現(xiàn)了6個譜系的412個泡沫病毒，顯著增加了已知的兩棲動物泡沫病毒數(shù)量。其中，無足目動物的泡沫病毒與其宿主保持著共同進化的進化模式，其病毒整合時間可以追溯到古生代。而無尾目動物的泡沫病毒似乎來自于新生代時期的一次病毒跨宿主傳播事件。此外，該團隊還報道了一種蠑螈（有尾目）整合有3個不同譜系的泡沫病毒，代表著泡沫病毒對宿主的多重感染特征。通過改進高通量轉(zhuǎn)錄組分析策略，該團隊鑒定出了泡沫病毒主要基因的完整轉(zhuǎn)錄，展示了內(nèi)源性泡沫病毒外源化表達的可能性。這些發(fā)現(xiàn)極大地拓展了人們對于新病毒發(fā)現(xiàn)及復雜逆轉(zhuǎn)錄病毒宏觀進化的理解。

　　科研助理陳毅聰和碩士研究生張譽譯為本文的共同第一作者，崔杰研究員為本文的通訊作者。該研究得到國家自然科學基金等項目的資助。

　　文章鏈接：https://jvi.asm.org/content/early/2021/04/22/JVI.00484-21

來源：中國科學院上海巴斯德研究所