清華大學醫(yī)學院丁強聯(lián)手北京市生物結構前沿研究中心王新泉團隊合作揭示新冠病毒刺突蛋白Y453F突變增強對水貂ACE2結合的分子機制
目前, 由新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)感染引起的新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)疫情仍然在全球蔓延。隨著疫情的持續(xù),新冠病毒基因組也在不斷發(fā)生變異。2020年4月份起,在歐洲多個水貂養(yǎng)殖場中都發(fā)現(xiàn)新冠病毒從人傳播到水貂,并在水貂中大范圍傳播。2020年10月開始,陸續(xù)發(fā)現(xiàn)病毒在水貂中發(fā)生變異,且變異病毒從水貂傳播到人,這是第一次被明確報道的病毒從動物傳播到人的病例1。其中,在丹麥發(fā)現(xiàn)來源于水貂的突變毒株“Cluster 5”在刺突蛋白(spike, S)上有多個氨基酸突變,包括1)Δ69-70HV,第69和70位組氨酸和纈氨酸的缺失;2)Y453F;3)I692V和4)M1229I 2,3。病毒S蛋白和細胞受體ACE2結合,從而介導病毒進入細胞,該步驟是治療性中和抗體以及預防性疫苗發(fā)揮作用的重要靶點4,5。因此“Cluster 5”突變株在S的突變的生物學功能是什么,突變是否改變病毒和水貂ACE2的相互作用,以及這些突變是否會對疫苗的保護效果造成挑戰(zhàn)等重要問題亟待回答。
丁強課題組之前的研究表明,野生型病毒刺突蛋白和水貂ACE2的結合能否非常弱,提示野生型病毒不能高效地感染水貂6。因此,他們提出猜想“Cluster 5”突變株在S的突變是病毒在水貂感染過程中產(chǎn)生的適應性突變,使得Cluster 5獲得在水貂中高效傳播和感染的能力,從而造成在水貂群體中大范圍的感染。為了證明以上猜想,研究人員制備了野生型S蛋白以及攜帶以上不同突變的系列S蛋白,分別測定其和水貂ACE2和人ACE2蛋白的結合能力,研究結果表明水貂ACE2與野生型S蛋白的結合不能被檢測到,但與含有Y453F突變的S蛋白有較強結合,同時研究者還發(fā)現(xiàn)Y453F突變也增強了對人ACE2的結合。研究者還利用假病毒系統(tǒng)進一步證實了以上結果,并且解析了水貂ACE2與含有Y453F突變RBD的復合物結構,進一步揭示了Y453F突變增強與水貂ACE2相互作用的機制。以上研究結果在分子水平上揭示“Cluster 5”在水貂群體中造成大流行,以及病毒能夠從水貂傳播到人,并能進一步造成人際傳播的原因。
接下來,研究者利用假病毒系統(tǒng)評估Cluster 5突變株對新冠康復者血清的敏感性,發(fā)現(xiàn)Cluster 5對康復者血清的中和效果具有一定的抵抗,提示變異病毒對疫苗的有效性構成一定的風險。但是,重組可溶性人ACE2蛋白仍可有效地阻斷突變病毒的入侵,該結果提示了重組可溶性ACE2可以作為應對突變毒株的有效方案。

2. Munnink B B O, Sikkema R S, Nieuwenhuijse D F, et al. Transmission of SARS-CoV-2 on mink farms between humans and mink and back to humans[J]. Science, 2021, 371(6525): 172-177.
3. Hoffmann M, Zhang L, Krüger N, et al. SARS-CoV-2 mutations acquired in mink reduce antibody-mediated neutralization[J]. Cell reports, 2021, 35(3): 109017.
4. Lan J, Ge J, Yu J, et al. Structure of the SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain bound to the ACE2 receptor[J]. Nature, 2020, 581(7807): 215-220.
5. Wang P, Nair M S, Liu L, et al. Antibody resistance of SARS-CoV-2 variants B. 1.351 and B. 1.1. 7[J]. Nature, 2021, 593(7857): 130-135.
6. Liu Y, Hu G, Wang Y, et al. Functional and genetic analysis of viral receptor ACE2 orthologs reveals a broad potential host range of SARS-CoV-2[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2021, 118(12).
來源:北京生物結構前沿研究中心


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