如您所知，近年來，以基因組科學為代表的研究工作和技術(shù)平臺先后獲得各項資助，如國家863計劃、973計劃、中國科學院知識創(chuàng)新工程、國家重大攻關(guān)項目、自然科學基金等。為了輔助廣大科研工作者掌握高通量測序技術(shù)原理、實驗設(shè)計以及后期數(shù)據(jù)分析技能，我中心特舉辦此“實用生物信息學研討班”。

主辦單位：北京市計算中心有限公司

協(xié)辦單位：

北京市基因測序與功能分析工程技術(shù)研究中心

云計算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點實驗室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓基地

北京市大數(shù)據(jù)教學實踐基地

舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓

課程安排：2022年4月18日-22日（周一–周五）上午9:30-11:30 下午13:30-17:00

時間 主題 授課內(nèi)容 備注
第一天

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 組學及生物信息學概述 1、組學研究概述（基因組學，轉(zhuǎn)錄組學，表觀組學，蛋白質(zhì)組學，代謝組學及相關(guān)技術(shù)介紹）
2、實驗設(shè)計及測序原理
3、生物信息學背景知識介紹		 理論
Linux服務(wù)器使用入門 4、掌握Linux系統(tǒng)下的常用命令（重點講解）
5、掌握linux環(huán)境下軟件的安裝使用
6、了解shell腳本的編寫		 實操
R語言入門 7、R語言簡介
8、R語言安裝及配置
9、R語言數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
10、R語言數(shù)據(jù)處理
11、R語言繪圖		 理論+實操
第二天

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 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實例 12、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展前沿動態(tài)
13、轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例及應(yīng)用熱點
14、常用的轉(zhuǎn)錄組實驗設(shè)計及測序建庫技術(shù)		 理論
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實例 15、轉(zhuǎn)錄組分析方法介紹 理論
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實例（上機操作） 16、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準備和軟件介紹及安裝
17、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對（重點講解）
18、表達量估計和分析（重點講解）		 理論+
實操
第三天 基因組重測序與數(shù)據(jù)分析 19、講解基因組重測序的概念、目的與應(yīng)用
20、結(jié)合實例講解其原理、類據(jù)類型與格式、操作流程、軟件等相關(guān)知識		 理論
基因組重測序數(shù)據(jù)分析實例（上機操作） 21、對二代測序數(shù)據(jù)的解讀
22、數(shù)據(jù)質(zhì)量控制及數(shù)據(jù)過濾
23、使用BWA和Samtools進行數(shù)據(jù)比對并對比對結(jié)果進行可視化（重點講解）
24、尋找SNP和Indel并進行注釋（重點講解）
25、尋找結(jié)構(gòu)變異并對變異進行注釋（重點講解）		 理論+
實操
第四天

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 microRNA測序與數(shù)據(jù)分析 26、microRNA的定義、應(yīng)用和發(fā)展
27、microRNA的生物學過程
28、microRNA研究的實驗設(shè)計及測序原理		 理論
microRNA測序與數(shù)據(jù)分析 29、microRNA測序數(shù)據(jù)分析軟件（重點講解）
30、microRNA目前的挑戰(zhàn)以及將來的研究前景
31、microRNA測序數(shù)據(jù)分析案例展示（重點講解）
32、近期文獻		 理論
microRNA數(shù)據(jù)分析實例（上機操作） 33、microRNA測序數(shù)據(jù)預處理（重點講解）
34、測序數(shù)據(jù)長度分布計算
35、microRNA的預測（重點講解）
36、microRNA堿基偏好性計算
37、microRNA靶標基因預測，結(jié)果提取、統(tǒng)計（重點講解）		 理論+
實操
第五天 10×單細胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析原理 38、單細胞測序技術(shù)研究現(xiàn)狀及應(yīng)用
39、單細胞轉(zhuǎn)錄組實驗設(shè)計及建庫測序原理（重點介紹10x genomics）
40、空間轉(zhuǎn)錄組實驗設(shè)計及建庫測序原理		 理論
10×單細胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析流程上機操作 41、10×單細胞軟件Cellranger處理測序原始數(shù)據(jù)實操
42、R包Seurat細胞分群、umap、t-sne、marker基因篩選實操		 實操
蛋白結(jié)構(gòu)與互作分析 43、PyMol ??44、Cytoscape 實操

注：內(nèi)容以實際發(fā)生為準；若調(diào)，會提前通知。

【報名費用】

注冊費：5400元/人（含當期聽課費、資料費、證書費、考試費（如有））。培訓期間，食宿自理。

提供當期視頻回放以供復習使用（羽林學院平臺）。

開具增值稅發(fā)票，提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書等相關(guān)材料。

【報名優(yōu)惠政策】

1、3人以上團體報名每人可減少300元；

2、4+1團報，可免費贈送一個名額；

3、上面優(yōu)惠政策不能同時享受，只能享受其中一種；

老學員參加及推薦學員參加均可額外優(yōu)惠200元。

培訓以收到學員培訓費為成功報名，培訓座位按收到費用先后順序安排。

【付費方式】

現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款、現(xiàn)場刷卡

單位全稱：北京市計算中心有限公司

賬號：0200151819100023937

開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行

（匯款信息備注：“生物計算——您的姓名”,個人匯款請備注單位名稱）

注：款項支出后，請?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員，方便核實到賬、開具發(fā)票。

【咨詢請聯(lián)系】

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