如您所知，近年來，以基因組科學(xué)為代表的研究工作和技術(shù)平臺先后獲得各項(xiàng)資助，如國家863計(jì)劃、973計(jì)劃、中國科學(xué)院知識創(chuàng)新工程、國家重大攻關(guān)項(xiàng)目、自然科學(xué)基金等。為了輔助廣大科研工作者掌握高通量測序技術(shù)原理、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)以及后期數(shù)據(jù)分析技能，我中心特舉辦此“實(shí)用生物信息學(xué)研討班”。

主辦單位：北京市計(jì)算中心有限公司

協(xié)辦單位：

北京市基因測序與功能分析工程技術(shù)研究中心

云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地

北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實(shí)踐基地

舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓

課程安排：2022年4月18日-22日（周一–周五）上午9:30-11:30 下午13:30-17:00

時(shí)間 主題 授課內(nèi)容 備注
第一天

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 組學(xué)及生物信息學(xué)概述 1、組學(xué)研究概述（基因組學(xué)，轉(zhuǎn)錄組學(xué)，表觀組學(xué)，蛋白質(zhì)組學(xué)，代謝組學(xué)及相關(guān)技術(shù)介紹）
2、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測序原理
3、生物信息學(xué)背景知識介紹		 理論
Linux服務(wù)器使用入門 4、掌握Linux系統(tǒng)下的常用命令（重點(diǎn)講解）
5、掌握linux環(huán)境下軟件的安裝使用
6、了解shell腳本的編寫		 實(shí)操
R語言入門 7、R語言簡介
8、R語言安裝及配置
9、R語言數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
10、R語言數(shù)據(jù)處理
11、R語言繪圖		 理論+實(shí)操
第二天

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 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實(shí)例 12、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展前沿動(dòng)態(tài)
13、轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例及應(yīng)用熱點(diǎn)
14、常用的轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測序建庫技術(shù)		 理論
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實(shí)例 15、轉(zhuǎn)錄組分析方法介紹 理論
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實(shí)例（上機(jī)操作） 16、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和軟件介紹及安裝
17、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對（重點(diǎn)講解）
18、表達(dá)量估計(jì)和分析（重點(diǎn)講解）		 理論+
實(shí)操
第三天 基因組重測序與數(shù)據(jù)分析 19、講解基因組重測序的概念、目的與應(yīng)用
20、結(jié)合實(shí)例講解其原理、類據(jù)類型與格式、操作流程、軟件等相關(guān)知識		 理論
基因組重測序數(shù)據(jù)分析實(shí)例（上機(jī)操作） 21、對二代測序數(shù)據(jù)的解讀
22、數(shù)據(jù)質(zhì)量控制及數(shù)據(jù)過濾
23、使用BWA和Samtools進(jìn)行數(shù)據(jù)比對并對比對結(jié)果進(jìn)行可視化（重點(diǎn)講解）
24、尋找SNP和Indel并進(jìn)行注釋（重點(diǎn)講解）
25、尋找結(jié)構(gòu)變異并對變異進(jìn)行注釋（重點(diǎn)講解）		 理論+
實(shí)操
第四天

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 microRNA測序與數(shù)據(jù)分析 26、microRNA的定義、應(yīng)用和發(fā)展
27、microRNA的生物學(xué)過程
28、microRNA研究的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測序原理		 理論
microRNA測序與數(shù)據(jù)分析 29、microRNA測序數(shù)據(jù)分析軟件（重點(diǎn)講解）
30、microRNA目前的挑戰(zhàn)以及將來的研究前景
31、microRNA測序數(shù)據(jù)分析案例展示（重點(diǎn)講解）
32、近期文獻(xiàn)		 理論
microRNA數(shù)據(jù)分析實(shí)例（上機(jī)操作） 33、microRNA測序數(shù)據(jù)預(yù)處理（重點(diǎn)講解）
34、測序數(shù)據(jù)長度分布計(jì)算
35、microRNA的預(yù)測（重點(diǎn)講解）
36、microRNA堿基偏好性計(jì)算
37、microRNA靶標(biāo)基因預(yù)測，結(jié)果提取、統(tǒng)計(jì)（重點(diǎn)講解）		 理論+
實(shí)操
第五天 10×單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析原理 38、單細(xì)胞測序技術(shù)研究現(xiàn)狀及應(yīng)用
39、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及建庫測序原理（重點(diǎn)介紹10x genomics）
40、空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及建庫測序原理		 理論
10×單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析流程上機(jī)操作 41、10×單細(xì)胞軟件Cellranger處理測序原始數(shù)據(jù)實(shí)操
42、R包Seurat細(xì)胞分群、umap、t-sne、marker基因篩選實(shí)操		 實(shí)操
蛋白結(jié)構(gòu)與互作分析 43、PyMol ??44、Cytoscape 實(shí)操

注：內(nèi)容以實(shí)際發(fā)生為準(zhǔn)；若調(diào)，會提前通知。

【報(bào)名費(fèi)用】

注冊費(fèi)：5400元/人（含當(dāng)期聽課費(fèi)、資料費(fèi)、證書費(fèi)、考試費(fèi)（如有））。培訓(xùn)期間，食宿自理。

提供當(dāng)期視頻回放以供復(fù)習(xí)使用（羽林學(xué)院平臺）。

開具增值稅發(fā)票，提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書等相關(guān)材料。

【報(bào)名優(yōu)惠政策】

1、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少300元；

2、4+1團(tuán)報(bào)，可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額；

3、上面優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受，只能享受其中一種；

老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。

培訓(xùn)以收到學(xué)員培訓(xùn)費(fèi)為成功報(bào)名，培訓(xùn)座位按收到費(fèi)用先后順序安排。

【付費(fèi)方式】

現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款、現(xiàn)場刷卡

單位全稱：北京市計(jì)算中心有限公司

賬號：0200151819100023937

開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行

（匯款信息備注：“生物計(jì)算——您的姓名”,個(gè)人匯款請備注單位名稱）

注：款項(xiàng)支出后，請?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員，方便核實(shí)到賬、開具發(fā)票。

【咨詢請聯(lián)系】

QQ號：659230635

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