微生物組學(xué)數(shù)據(jù)分析與挖掘?qū)崙?zhàn)班

微生物存在于世界的各個(gè)角落，在醫(yī)療健康、環(huán)境治理、農(nóng)業(yè)種植、工業(yè)生產(chǎn)等諸多領(lǐng)域發(fā)揮著舉足輕重的作用。近年來(lái)，隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，對(duì)于微生物組學(xué)的研究持續(xù)火熱，微生物存在于世界的各個(gè)角落，在醫(yī)療健康、環(huán)境治理、農(nóng)業(yè)種植、工業(yè)生產(chǎn)等諸多領(lǐng)域發(fā)揮著舉足輕重的作用。成為了科研工作者必不可少的研究技術(shù)。然而，對(duì)技能的要求也是越來(lái)越高，尤其在數(shù)據(jù)庫(kù)建立、編程語(yǔ)言開發(fā)、繪圖工具使用技巧及算法模型選擇成為廣大科研工作者面臨的具體問(wèn)題。

本次生信培訓(xùn)班分為四個(gè)階段

1、掌握必備的基礎(chǔ)知識(shí)

如微生物組研究現(xiàn)狀與應(yīng)用、分析流程、方案設(shè)計(jì)以及Linux的常用操作和軟件安裝等。

2、掌握16S以及宏基因組數(shù)據(jù)分析結(jié)果及應(yīng)用

深度剖析16S與宏基因組建庫(kù)測(cè)序原理及分析結(jié)果解讀，深度詮釋各個(gè)分析結(jié)果。

3、手把手帶你進(jìn)行微生物組學(xué)數(shù)據(jù)的分析

包括微生物多樣性測(cè)序數(shù)據(jù)處理和宏基因組數(shù)據(jù)分析，如原始數(shù)據(jù)的質(zhì)控和拼接、OTU聚類、物種注釋、宏基因組數(shù)據(jù)的組裝、基因預(yù)測(cè)以及基于物種豐度、功能豐度表進(jìn)行的有效信息的統(tǒng)計(jì)分析。

4、深度體驗(yàn)微生物組大數(shù)據(jù)挖掘的奧秘

基于豐富的項(xiàng)目分析經(jīng)驗(yàn)，針對(duì)不同研究目的，提供專業(yè)性分析方案及數(shù)據(jù)深度挖掘思路，并通過(guò)不同軟件進(jìn)行結(jié)果可視化。

主辦單位：北京市計(jì)算中心有限公司

協(xié)辦單位：

北京市基因測(cè)序與功能分析工程技術(shù)研究中心

云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地

北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實(shí)踐基地

舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)北科產(chǎn)業(yè)3號(hào)樓

課程安排：2022年5月11日-13日（周三–周五） 上午9:30-11:30 ?下午13:30-17:00

時(shí)間 主題 授課內(nèi)容 備注
第一天 微生物組學(xué)研究現(xiàn)狀及應(yīng)用 1、微生物組學(xué)研究現(xiàn)狀及應(yīng)用
2、微生物組實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測(cè)序原理
3、生物信息學(xué)背景知識(shí)介紹		 理論
微生物組學(xué)數(shù)據(jù)分析上機(jī)基礎(chǔ) 4、Linux常用命令使用和上機(jī)操作
5、Linux環(huán)境下軟件安裝		 理論+
實(shí)操
微生物多樣性數(shù)據(jù)分析 6、質(zhì)控流程：雙端序列合并、提取barcode、質(zhì)控、樣品拆分、切除引物
7、生成OTU：序列格式轉(zhuǎn)換、去冗余、聚類生成OTU
8、OTU篩選：嵌合體生成原理及去除方法、篩選細(xì)菌/真菌序列、生成代表性序列和OUT表
9、物種注釋及進(jìn)化樹構(gòu)建
10、常用Alpha多樣性指數(shù)計(jì)算
11、常用Beta多樣性距離矩陣計(jì)算
12、統(tǒng)計(jì)分析
（1）箱線圖展示Alpha多樣性及組間比較統(tǒng)計(jì)
（2）散點(diǎn)圖展示樣品及組間主坐軸分析(PCA/PCoA/NMDS)
（3）樣品與組間相關(guān)分析，并用熱圖可視化結(jié)果		 演示+
實(shí)操
第二天 宏基因組數(shù)據(jù)分析與結(jié)果解讀 13、宏基因組分析基本策略
14、數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估
15、數(shù)據(jù)質(zhì)量過(guò)濾
16、宿主污染過(guò)濾
17、數(shù)據(jù)組裝		 理論
宏基因組數(shù)據(jù)分析與結(jié)果解讀 18、基因預(yù)測(cè)
19、物種注釋（MEGAN、Krona）
20、功能注釋（KEGG、eggNOG）
21、統(tǒng)計(jì)分析
（1）樣本聚類分析（物種、功能、基因）
（2）差異分析（物種、功能、基因）		 演示+
實(shí)操
第三天 數(shù)據(jù)挖掘與可視化實(shí)現(xiàn) 22、R繪圖功能在微生物組學(xué)信息分析中的應(yīng)用
韋恩圖、花瓣圖、散點(diǎn)圖、熱圖、盒形圖（箱線圖）等		 演示+
實(shí)操
數(shù)據(jù)挖掘與可視化實(shí)現(xiàn) 23、網(wǎng)絡(luò)分析（MENA、Igraph、Cytoscape） 實(shí)操
數(shù)據(jù)挖掘與可視化實(shí)現(xiàn) 24、差異物種分析LEfSe分析
25、KEGG和COG預(yù)測(cè)分析
26、PIRUSt預(yù)測(cè)及STAMP
27、進(jìn)化分析ITOL		 演示+
實(shí)操

注：內(nèi)容以實(shí)際發(fā)生為準(zhǔn)；若調(diào)，會(huì)提前通知。

【報(bào)名費(fèi)用】

注冊(cè)費(fèi)：4200元/人（含當(dāng)期聽課費(fèi)、資料費(fèi)、證書費(fèi)、考試費(fèi)（如有））。培訓(xùn)期間，食宿自理。

提供當(dāng)期視頻回放以供復(fù)習(xí)使用（羽林學(xué)院平臺(tái)）。

開具增值稅發(fā)票，提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書等相關(guān)材料。

【報(bào)名優(yōu)惠政策】

1、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少300元；

2、4+1團(tuán)報(bào)，可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額；

3、上面優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受，只能享受其中一種；

老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。

培訓(xùn)以收到學(xué)員培訓(xùn)費(fèi)為成功報(bào)名，培訓(xùn)座位按收到費(fèi)用先后順序安排。

【付費(fèi)方式】

現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款、現(xiàn)場(chǎng)刷卡

單位全稱：北京市計(jì)算中心有限公司

賬號(hào)：0200151819100023937

開戶銀行：中國(guó)工商銀行股份有限公司北京永豐支行

（匯款信息備注：“生物計(jì)算——您的姓名”,個(gè)人匯款請(qǐng)備注單位名稱）

注：款項(xiàng)支出后，請(qǐng)?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員，方便核實(shí)到賬、開具發(fā)票。

【咨詢請(qǐng)聯(lián)系】

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