至今我們已舉辦60期，每期近百人，學員遍布全國30余個省市。每次研習班都有近30%教授、研究員等高級職稱技術(shù)人員參加。他們中有一些帶著課題或問題前來交流和聯(lián)系；也有的通過研習班建立了協(xié)作關(guān)系，共同申請課題，發(fā)表論文，其中不少優(yōu)秀研究成果，已在SCI期刊上發(fā)表。

一、培訓班上課內(nèi)容

上課內(nèi)容涵蓋“基因組學—蛋白質(zhì)組學—系統(tǒng)生物學”的研究方法、技術(shù)思路、前沿進展及其在各生物學科中的應用。

核心課程包括：

1. 基因組的比較研究? ? （于軍?研究員）

2. 大規(guī)模測序方法及應用、微生物基因組學、基因組學與精準醫(yī)學（胡松年研究員）

3. 系統(tǒng)生物學導論及高通量分析技術(shù)應用（楊軍?教授）

4. 系統(tǒng)生物學建模分析（陳銘?教授）

5.?比較基因組學應用（徐建紅 教授）

6.??動植物基因組進化 （張亮生 教授）

7.? 遺傳學在疑難未診斷疾病中的應用（俞曉敏 研究員）

8.??基因組學在醫(yī)學中的應用（周青? 研究員）

二、培訓班上機內(nèi)容

本研習班上機實習課采用 “跟我學”方式，學習實踐各類基礎(chǔ)生物信息學軟件，每人一臺PC機跟著大屏幕一步步學會基因組、蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析的基本方法。

主要內(nèi)容如下：

實習一：基因組數(shù)據(jù)注釋和功能分析

通過序列比對工具BLAST的學習，了解基因功能注釋的原理；介紹多序列聯(lián)配工具ClustalX及分子進化分析軟件MEGA4，掌握系統(tǒng)發(fā)生樹繪制的基本方法，認識基因復制在進化上的功能；學習基因序列分析常用的數(shù)據(jù)庫和軟件。

實習二：轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析

介紹轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的基本流程及其原理；通過對tophat、cufflinks、R等轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析工具的介紹及演示，了解基于二代測序數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)錄組分析流程及常用分析方法；利用kegg、GOstat、DAVID等在線工具挖掘轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的生物學意義。

實習三：蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能分析

從數(shù)據(jù)庫搜索感興趣的蛋白質(zhì)氨基酸序列開始，接著對蛋白質(zhì)基本理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)、和三維空間結(jié)構(gòu)和序列模體進行分析，預測目標蛋白的生物功能。

實習四：蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析

使用X！Tandem、Mascot、Sequest等軟件鑒定蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)，將質(zhì)譜結(jié)果匹配到蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫鑒定蛋白；使用TPP軟件包進行統(tǒng)計學分析和優(yōu)化檢索結(jié)果練習。

實習五：系統(tǒng)生物學軟件實習—–網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)顯示與分析

利用Cytoscape系統(tǒng)生物學分析軟件，分析蛋白－蛋白相互作用，展示分子網(wǎng)絡系統(tǒng)，并與基因表達等數(shù)據(jù)整合。