北京大學生命科學學院伊成器和合作者報道tRNA-m1A修飾調(diào)控CD4+T細胞功能的新機制
2022年9月22日,上海交通大學醫(yī)學院李華兵研究員、北京大學生命科學學院伊成器教授、陸軍軍醫(yī)大學吳玉章教授和耶魯大學醫(yī)學院Richard A. Flavell教授團隊合作在Nature Immunology上發(fā)表了題為“tRNA-m1A modification promotes T cell expansion via efficient MYC protein synthesis”的研究論文,該研究揭示了m1A修飾催化酶TRMT61A通過催化新合成tRNA第58位腺嘌呤的1-甲基腺嘌呤(m1A)修飾,加速CD4+T細胞激活后多種關鍵蛋白的翻譯,保證CD4+T細胞的迅速免疫應答。該研究首次詳細地闡明了CD4+T細胞功能改變過程中tRNA化學修飾控制細胞內(nèi)翻譯的分子機制。
論文截圖
T細胞在免疫反應中發(fā)揮核心作用。當受抗原刺激時,處于靜息狀態(tài)的T細胞快速激活,大量增殖分化。免疫激活是免疫反應中非常重要的一步,之前的研究集中于探究轉(zhuǎn)錄調(diào)控在T細胞激活過程中的作用[1]。鑒于T細胞激活在短時間內(nèi)快速發(fā)生,轉(zhuǎn)錄調(diào)控不能及時滿足T細胞大量合成蛋白的需求,因此翻譯效率的調(diào)控可能也發(fā)揮重要作用。
tRNA在翻譯過程中發(fā)揮著重要作用。除了tRNA豐度之外,tRNA上的化學修飾可以通過穩(wěn)定tRNA結(jié)構(gòu),幫助tRNA進行codon識別等途徑影響翻譯過程。其中,m1A是tRNA上豐度最高最保守的一種修飾,由TRMT6/TRMT61A復合物進行修飾,tRNA-m1A修飾可以增強翻譯起始和延伸[2]。伊成器課題組在2017年建立了m1A修飾位點的單堿基分辨率鑒定技術[3]。
該研究首先觀察到T細胞激活過程中蛋白質(zhì)翻譯相關通路上調(diào),不同的tRNA也表現(xiàn)出不同時間點上調(diào)的動態(tài)表達模式,tRNA-m1A58修飾酶TRMT6/TRMT61A在激活過程中也上調(diào)。作者利用Trmt61a條件性敲除小鼠,證明在體內(nèi)、體外條件下,Trmt61a缺失時T細胞激活免疫功能受損,T細胞增殖能力顯著降低。同時,發(fā)現(xiàn)Trmt61a缺失導致T細胞中大部分tRNA的m1A58修飾顯著減少,導致T細胞激活后多種關鍵蛋白的翻譯受阻,特別是轉(zhuǎn)錄因子MYC。MYC蛋白翻譯效率的降低使T細胞激活后的快速克隆擴增受阻。
作者隨后探究了Trmt61a調(diào)控翻譯的特異性。通過對RiboTag-seq、tRNA-seq、tRNA-m1A-seq的多組學聯(lián)合分析,研究人員發(fā)現(xiàn)翻譯效率下調(diào)的基因(如Myc)有tRNA codon使用偏好性,更偏好使用在激活早期高表達的tRNA,而這部分tRNA又是Trmt61a缺失高度敏感的tRNA。
該研究第一次將tRNA修飾與T細胞的功能變化連接起來,并系統(tǒng)性地探究了原代T細胞擴增過程中控制翻譯的具體機制,表明tRNA的使用及其修飾可以對蛋白表達和細胞功能帶來顯著改變。這項研究表明TRMT61A介導的tRNA-m1A58修飾作為CD4+T細胞增殖調(diào)控的新型“翻譯檢查點”,將為改善CD4+T細胞介導的炎癥應答及增強腫瘤免疫治療效果提供新的RNA表觀遺傳策略。
TRMT61A介導的tRNA-m1A58修飾是CD4+T細胞激活增殖調(diào)控的“翻譯檢查點”
上海交通大學醫(yī)學院劉永波博士、周靜副研究員和碩士研究生施金彤,北京大學生命科學學院已出站博士后李笑雨(現(xiàn)為浙江大學醫(yī)學院研究員)、博士研究生張曉婷為本論文的共同第一作者,李華兵、伊成器、吳玉章及Richard A. Flavell為該文的共同通訊作者。
參考文獻:
1.Kaech, S. M. & Cui, W. Transcriptional control of effector and memory CD8+ T cell differentiation. Nat Rev Immuno?l12, 749–761 (2012).
2.Liu, F. et al. ALKBH1-Mediated tRNA Demethylation Regulates Translation. Cell?167, 816-828.e16 (2016).
3. Li, X. et al. Base-Resolution Mapping Reveals Distinct m1A Methylome in Nuclear- and Mitochondrial-Encoded Transcripts. Mol. Cell 68, 993-1005.e16 (2017).
來源:北京大學


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