微生物存在于世界的各個角落，在醫(yī)療健康、環(huán)境治理、農(nóng)業(yè)種植、工業(yè)生產(chǎn)等諸多領(lǐng)域發(fā)揮著舉足輕重的作用。近年來，隨著測序技術(shù)的發(fā)展，對于微生物組學的研究持續(xù)火熱，微生物存在于世界的各個角落，在醫(yī)療健康、環(huán)境治理、農(nóng)業(yè)種植、工業(yè)生產(chǎn)等諸多領(lǐng)域發(fā)揮著舉足輕重的作用。成為了科研工作者必不可少的研究技術(shù)。然而，對技能的要求也是越來越高，尤其在數(shù)據(jù)庫建立、編程語言開發(fā)、繪圖工具使用技巧及算法模型選擇成為廣大科研工作者面臨的具體問題。

本次生信培訓班分為四個階段

1、掌握必備的基礎(chǔ)知識

如微生物組研究現(xiàn)狀與應(yīng)用、分析流程、方案設(shè)計以及Linux的常用操作和軟件安裝等。

2、掌握16S以及宏基因組數(shù)據(jù)分析結(jié)果及應(yīng)用

深度剖析16S與宏基因組建庫測序原理及分析結(jié)果解讀，深度詮釋各個分析結(jié)果。

3、手把手帶你進行微生物組學數(shù)據(jù)的分析

包括微生物多樣性測序數(shù)據(jù)處理和宏基因組數(shù)據(jù)分析，如原始數(shù)據(jù)的質(zhì)控和拼接、OTU聚類、物種注釋、宏基因組數(shù)據(jù)的組裝、基因預測以及基于物種豐度、功能豐度表進行的有效信息的統(tǒng)計分析。

4、深度體驗微生物組大數(shù)據(jù)挖掘的奧秘

基于豐富的項目分析經(jīng)驗，針對不同研究目的，提供專業(yè)性分析方案及數(shù)據(jù)深度挖掘思路，并通過不同軟件進行結(jié)果可視化。

主辦單位：北京市計算中心有限公司

協(xié)辦單位：

北京市基因測序與功能分析工程技術(shù)研究中心

云計算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點實驗室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓基地

北京市大數(shù)據(jù)教學實踐基地

支持單位：肽度TIMEDOO

舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓

課程安排：2022.11.30-2022.12.2 ?上9:30-11:30 ?下13:30-17:00

日期 主題 內(nèi)容 備注
第一天 微生物組學研究現(xiàn)狀及應(yīng)用 1、微生物組學研究現(xiàn)狀及應(yīng)用

2、微生物組實驗設(shè)計及測序原理

3、生物信息學背景知識分享

 理論
微生物組學數(shù)據(jù)分析上機基礎(chǔ) 1、Linux常用命令使用和上機操作

2、Linux環(huán)境下軟件安裝

 理論+

上機操作
微生物多樣性數(shù)據(jù)分析 1、質(zhì)控流程：雙端序列合并、提取barcode、質(zhì)控、樣品拆分、切除引物

2、生成OTU：序列格式轉(zhuǎn)換、去冗余、聚類生成OTU

3、OTU篩選：嵌合體生成原理及去除方法、篩選細菌/真菌序列、生成代表性序列和OUT表

4、物種注釋及進化樹構(gòu)建

5、常用Alpha多樣性指數(shù)計算

6、常用Beta多樣性距離矩陣計算

7、統(tǒng)計分析

7.1、箱線圖展示Alpha多樣性及組間比較統(tǒng)計

7.2、散點圖展示樣品及組間主坐軸分析(PCA/PCoA/NMDS)

7.3、樣品與組間相關(guān)分析，并用熱圖可視化結(jié)果

 演示+

上機操作
第二天 宏基因組數(shù)據(jù)分析與結(jié)果解讀 1、宏基因組分析基本策略

2、數(shù)據(jù)質(zhì)量評估

3、數(shù)據(jù)質(zhì)量過濾

4、宿主污染過濾

5、數(shù)據(jù)組裝

 理論
1、基因預測

2、物種注釋（MEGAN、Krona）

3、功能注釋（KEGG、eggNOG）

4、統(tǒng)計分析

4.1、樣本聚類分析（物種、功能、基因）

4.2、差異分析（物種、功能、基因）

 演示+

上機操作
第三天 數(shù)據(jù)挖掘與可視化實現(xiàn) 1、R繪圖功能在微生物組學信息分析中的應(yīng)用

韋恩圖、花瓣圖、散點圖、熱圖、盒形圖（箱線圖）等

 演示+

上機操作
1、網(wǎng)絡(luò)分析（MENA、Igraph、Cytoscape） 上機操作
1、差異物種分析LEfSe分析

2、KEGG和COG預測分析

3、PIRUSt預測及STAMP

4、進化分析ITOL

 演示+

上機操作

注：內(nèi)容以實際發(fā)生為準；若調(diào)，會提前通知。

【報名費用】

注冊費：4200元/人（含當期聽課費、資料費、證書費、考試費（如有））。

提供當期視頻回放以供復習使用（羽林學院平臺）。

開具增值稅發(fā)票，提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書等相關(guān)材料。

【報名優(yōu)惠政策】

1、3人以上團體報名每人可減少300元；

2、4+1團報，可免費贈送一個名額；

3、上面優(yōu)惠政策不能同時享受，只能享受其中一種；

老學員參加及推薦學員參加均可額外優(yōu)惠200元。

【付費方式】

手機銀行或電子銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款等

單位全稱：北京市計算中心有限公司

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注：款項支出后，請?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員，方便核實到賬、開具發(fā)票。

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