近日，2022傳染病移動(dòng)監(jiān)測(cè)應(yīng)急演練在中國(guó)疾病預(yù)防控制中心昌平園區(qū)圓滿完成。此次演練由中國(guó)疾病預(yù)防控制中心衛(wèi)生應(yīng)急中心、實(shí)驗(yàn)室管理處、以及傳染病預(yù)防控制所共同組織，旨在演練并評(píng)測(cè)移動(dòng)實(shí)驗(yàn)室開展傳染病監(jiān)測(cè)和病原檢測(cè)的能力，探索移動(dòng)式高等級(jí)生物安全實(shí)驗(yàn)室開展自然疫源性傳染病野外監(jiān)測(cè)、病原快速篩查、現(xiàn)場(chǎng)基因測(cè)序和分析研判的工作模式。
圖：6輛移動(dòng)式實(shí)驗(yàn)室出發(fā)應(yīng)急演練
在為期4天的演練中，華大智造數(shù)字化樣本制備系統(tǒng)DNBelab-D4與小型化基因測(cè)序儀DNBSEQ-E25強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合，小巧便攜、隨到隨測(cè)的性能助力演練隊(duì)員針對(duì)野外采集的鼠類樣本順利完成了鼠疫和炭疽的應(yīng)急快速檢測(cè)和測(cè)序檢測(cè)。DNBelab-D4與DNBSEQ-E25大小相當(dāng)，30厘米見方，插電即可搭配使用。DNBelab-D4開創(chuàng)性地實(shí)現(xiàn)“一卡建庫，集成定量”，DNBSEQ-E25測(cè)序速度快、操作簡(jiǎn)易，大大降低了基因測(cè)序儀的使用門檻。兩款產(chǎn)品組合能夠?qū)崿F(xiàn)快速部署并快速處置突發(fā)性的單個(gè)或少量樣本，滿足野外環(huán)境移動(dòng)檢測(cè)的緊急測(cè)序場(chǎng)景需求，真正做到了上山下海、開箱即用。圖：演練隊(duì)員在移動(dòng)測(cè)序車內(nèi)開展樣本宏基因組測(cè)序及分析
2022傳染病移動(dòng)監(jiān)測(cè)應(yīng)急演練的圓滿完成也是CLOSS模型的又一次成功實(shí)踐。CLOSS為Co-Localization of Sampling and Sequencing的縮寫，CLOSS模型由中疾控移動(dòng)實(shí)驗(yàn)室監(jiān)測(cè)專家團(tuán)隊(duì)提出，是指在開展野外環(huán)境病原體檢測(cè)中，利用移動(dòng)測(cè)序車在現(xiàn)場(chǎng)點(diǎn)完成采樣和測(cè)序工作，并且是通過高通量宏基因組測(cè)序技術(shù)，在野外就地對(duì)野生動(dòng)物攜帶病原體進(jìn)行檢測(cè)，通過移動(dòng)實(shí)驗(yàn)室的轉(zhuǎn)移開展多點(diǎn)連續(xù)監(jiān)測(cè)，從而擴(kuò)大監(jiān)測(cè)面，能夠?qū)Χ喾N病原體及其環(huán)境分布情況進(jìn)行調(diào)查。
圖：CLOSS模型野外采樣、基因組測(cè)序及病原檢測(cè)流程
CLOSS模型通過建立移動(dòng)實(shí)驗(yàn)室，可以實(shí)現(xiàn)流動(dòng)監(jiān)測(cè)，在采樣地直接開始檢測(cè)，節(jié)省時(shí)間，避免樣品運(yùn)輸帶來的生物安全問題，擴(kuò)大監(jiān)測(cè)覆蓋度；且在移動(dòng)監(jiān)測(cè)中開展高通量宏基因組測(cè)序，可以實(shí)行病原一網(wǎng)打盡式的檢測(cè)，突破目前檢測(cè)中僅針對(duì)固定病原檢測(cè)、缺乏多病原篩查和整體數(shù)據(jù)的限制。華大智造DE高通量測(cè)序產(chǎn)品組合（DNBelab-D4+DNBSEQ E系列測(cè)序儀）小型便攜、準(zhǔn)確度高、速度快、操作簡(jiǎn)易，完美匹配在移動(dòng)監(jiān)測(cè)中開展高通量宏基因組測(cè)序的場(chǎng)景需求。2021年9月，中國(guó)疾病預(yù)防控制中心聯(lián)合內(nèi)蒙古疾病預(yù)防控制中心，在內(nèi)蒙古自治區(qū)組織了首次傳染病移動(dòng)監(jiān)測(cè)應(yīng)急演練。該演練是CLOSS模型的首次成功實(shí)踐，也是華大智造DE高通量測(cè)序產(chǎn)品組合首次助力高通量宏基因組測(cè)序移動(dòng)快速部署的成功嘗試。在該演練對(duì)嚙齒類動(dòng)物體內(nèi)的鼠疫耶爾森菌進(jìn)行病原學(xué)調(diào)查的過程中：采用傳統(tǒng)的調(diào)查技術(shù)，調(diào)查團(tuán)隊(duì)并沒有在嚙齒類動(dòng)物樣本中檢測(cè)到鼠疫耶爾森菌；但對(duì)兩例嚙齒類動(dòng)物樣本進(jìn)行宏基因組高通量測(cè)序后，在這兩例樣本中都發(fā)現(xiàn)了巴爾通體序列。并且，通過實(shí)時(shí)熒光PCR的方法進(jìn)行了進(jìn)一步的驗(yàn)證，確定了巴爾通體的存在。憑借便攜、易用、快捷的高通量測(cè)序儀，疾控專家們首次完成了在野外通過高通量宏基因組測(cè)序?qū)σ吧鷦?dòng)物攜帶病原體的調(diào)查，實(shí)現(xiàn)了針對(duì)自然疫源性傳染病病原菌的野外環(huán)境中測(cè)序監(jiān)測(cè)。調(diào)查團(tuán)隊(duì)表示，“華大智造DE高通量測(cè)序產(chǎn)品組合便攜靈活的特點(diǎn)，很適合傳染病暴發(fā)事件的快速基因測(cè)序和應(yīng)急處置的需求?！?/strong>經(jīng)過多次演練及成功實(shí)踐，CLOSS模型未來計(jì)劃整合進(jìn)國(guó)家致病菌識(shí)別網(wǎng)，在多個(gè)網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)（也就是多地野外環(huán)境中）實(shí)現(xiàn)對(duì)野外病原菌流行情況的實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)和調(diào)查，可做為致病菌識(shí)別網(wǎng)監(jiān)測(cè)中深入野外的靈活觸角，是對(duì)疫情監(jiān)測(cè)多點(diǎn)觸發(fā)的有效補(bǔ)充。病原學(xué)監(jiān)測(cè)預(yù)警離不開先進(jìn)技術(shù)、核心工具的助力。華大智造致力于成為“生命科技核心工具締造者”，憑借多年的行業(yè)深耕與技術(shù)積累，形成了病原微生物測(cè)序一站式產(chǎn)品組合。該組合可滿足病原微生物全基因組測(cè)序、靶向測(cè)序和宏基因組測(cè)序全流程、不同應(yīng)用場(chǎng)景的需求，為病原微生物的監(jiān)測(cè)和預(yù)警提供國(guó)產(chǎn)化核心工具，保障國(guó)家生物安全、守護(hù)人民健康。
圖：華大智造病原微生物測(cè)序一站式產(chǎn)品組合
參考文獻(xiàn)：
[1]?Xin Lu, Yao Peng, Yuanyuan Geng, Hongqun Zhao, Xiaona Shen, Dongmei Li, Zhenpeng Li, Liang Localization of Sampling and Sequencing for Zoonotic Pathogen Identification in the Field Monitoring Using Mobile Laboratories[J]. China CDC Weekly, 2022, 4(12): 259-263. doi: 10.46234/ccdcw2022.059
編輯：周敏
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