2023.8.23-25|轉(zhuǎn)錄組學(xué)專題實(shí)戰(zhàn)班
近年來，隨著高通量測(cè)序技術(shù)的迅猛發(fā)展，轉(zhuǎn)錄組研究從以前的微陣列技術(shù)，SAGE及MPSS技術(shù)的低通量模式切換至RNA-seq的高通量模式。轉(zhuǎn)錄組學(xué)作為一個(gè)伴隨高通量測(cè)序技術(shù)率先發(fā)展起來的技術(shù)開始在生物學(xué)前沿研究中得到了廣泛的應(yīng)用。RNA-seq對(duì)于真核生物的基因表達(dá)調(diào)控，癌癥等疾病的發(fā)生機(jī)制和新治療方案確定，遺傳育種等眾多方面的研究具有不可估量的潛力。為了輔助廣大科研工作者掌握轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序技術(shù)原理、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)以及后期數(shù)據(jù)分析技能，舉辦“轉(zhuǎn)錄組學(xué)”專題實(shí)戰(zhàn)班。歡迎報(bào)名參加。更多消息可關(guān)注“生信會(huì)議”公眾號(hào)，會(huì)給您帶來更多驚喜！
主辦單位：北京市計(jì)算中心有限公司
協(xié)辦單位：
北京市基因測(cè)序與功能分析工程技術(shù)研究中心
云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地
北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實(shí)踐基地
支持單位：
肽度TIMEDOO
舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)北科產(chǎn)業(yè)3號(hào)樓
課程安排：2023年8月23-25日（周三-周五）??上9:30-11:30 下13:30-17:00
| 日期 | 主題 | 內(nèi)容 | 備注 |
| 第一天 | 轉(zhuǎn)錄組學(xué)前沿概述及測(cè)序原理 | 1.轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展前沿動(dòng)態(tài)
2.轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例及應(yīng)用熱點(diǎn) 3.常用的轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測(cè)序建庫技術(shù) 4.單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù) 5.轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程及技術(shù)細(xì)節(jié) |
理論 |
| Linux服務(wù)器使用入門 | 1.掌握Linux系統(tǒng)下的常用命令（重點(diǎn)講解）
2.掌握Linux環(huán)境下軟件的安裝使用 3.了解Shell腳本的編寫 |
上機(jī)操作 | |
| 第二天 | 轉(zhuǎn)錄組分析方法 | 1.差異表達(dá)基因的功能分析（重點(diǎn)講解） | 理論 |
| De novo轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析上機(jī)實(shí)踐 | 1.原始測(cè)序數(shù)據(jù)的檢測(cè)和預(yù)處理（重點(diǎn)講解）
2.使用Trinity拼接轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)（重點(diǎn)講解） 3.原始數(shù)據(jù)與拼接轉(zhuǎn)錄本的比對(duì)（重點(diǎn)講解） 4.表達(dá)量統(tǒng)計(jì)和差異表達(dá)分析（重點(diǎn)講解） 5.使用blast對(duì)轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行功能注釋（重點(diǎn)講解） 6.尋找轉(zhuǎn)錄本的ORF，翻譯蛋白質(zhì)序列 7.轉(zhuǎn)錄因子注釋 |
上機(jī)操作 | |
| Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
上機(jī)實(shí)踐（一） |
1.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和軟件介紹
2.使用HISAT進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對(duì)（重點(diǎn)講解） 3.用IGV查看比對(duì)結(jié)果 4.使用cufflinks進(jìn)行表達(dá)量估計(jì)和分析（重點(diǎn)講解） 5.使用samtools檢測(cè)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的突變（重點(diǎn)講解） |
上機(jī)操作 | |
| 第三天 | Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 | 1.lncRNA的定義、應(yīng)用和發(fā)展
2.lncRNA的生物學(xué)過程 3.lncRNA研究的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測(cè)序原理 4.lncRNA測(cè)序分析結(jié)果解讀 |
理論 |
| Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
上機(jī)實(shí)踐（二） |
1.利用tophat和cufflinks組合，預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)錄本
2.使用CNCI預(yù)測(cè)新的lncRNA轉(zhuǎn)錄本（重點(diǎn)講解） 3.使用LncTar軟件預(yù)測(cè)lncRNA調(diào)控的靶基因（重點(diǎn)講解） |
理論+
上機(jī)操作 |
|
| microRNA測(cè)序與數(shù)據(jù)分析 | 1.microRNA的定義、應(yīng)用和發(fā)展
2.microRNA的生物學(xué)過程 3.microRNA研究的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測(cè)序原理 |
理論 | |
| microRNA測(cè)序與數(shù)據(jù)分析（包含上機(jī)實(shí)踐） | 1.microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析軟件（重點(diǎn)講解）
2.microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)預(yù)處理（重點(diǎn)講解） 3.microRNA的預(yù)測(cè)（重點(diǎn)講解） 4.microRNA靶標(biāo)基因預(yù)測(cè)，結(jié)果提取、統(tǒng)計(jì)（重點(diǎn)講解） |
理論+
上機(jī)操作 |
注：內(nèi)容以實(shí)際發(fā)生為準(zhǔn)；若調(diào)，會(huì)提前通知。
【報(bào)名費(fèi)用】
【報(bào)名優(yōu)惠政策】
1、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少300元；
2、4+1團(tuán)報(bào)，可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額；
3、上面優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受，只能享受其中一種；
老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。
【掃碼報(bào)名】
【咨詢請(qǐng)聯(lián)系】
【注】開課前一周會(huì)發(fā)送郵件通知；若未接到郵件通知，請(qǐng)電話咨詢。
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