歡迎各位來(lái)到“circRNA研究報(bào)道匯總”欄目，本期共收集最新發(fā)布的circRNA文獻(xiàn)16篇，下面我們一起來(lái)看看circRNA研究有哪些新進(jìn)展。

1、綜述：circRNA生物起源、功能及研究挑戰(zhàn)

論文標(biāo)題：The Biogenesis, Functions, and Challenges of Circular RNAs.

雜志：Mol Cell?影響因子：14.248

通訊作者單位：上海中科院

上海中科院楊力，陳玲玲教授在Molecular cell雜志上發(fā)表了最新circRNA研究綜述文章，主要匯總了circRNA形成機(jī)制、功能和目前研究挑戰(zhàn)等方面內(nèi)容。CircRNA往往同宿主基因（host gene）來(lái)源于同一轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物，相當(dāng)一部分文章報(bào)道了circRNA與host gene間的相關(guān)性，但具體機(jī)制還需更多研究。CircRNA與宿主mRNA序列高度一致，僅接頭位置序列不同，這給circRNA的檢測(cè)技術(shù)帶來(lái)了相當(dāng)?shù)碾y度。如跨接頭設(shè)計(jì)PCR引物，定量鑒定circRNA分子；siRNA和ASO（反義核苷酸）對(duì)circRNA進(jìn)行敲低，circRNA過(guò)表達(dá)載體構(gòu)建，病毒包裝；FISH探針檢測(cè)circRNA亞細(xì)胞定位等，circRNA的這些研究技術(shù)都有提升的空間，該綜述的具體解讀見(jiàn)本官網(wǎng)文章：楊力陳玲玲教授Molecular Cell雜志發(fā)表長(zhǎng)篇circRNA綜述。

2、circFBLIM1競(jìng)爭(zhēng)性吸附miR-346來(lái)促進(jìn)肝細(xì)胞癌的發(fā)展

論文標(biāo)題：circFBLIM1 act as a ceRNA to promote hepatocellular cancer progression by sponging miR-346.

雜志：J Exp Clin Cancer Res?影響因子：6.217

通訊作者單位：中南大學(xué)湘雅醫(yī)院

肝癌是一種常見(jiàn)的惡性疾病。據(jù)估計(jì)，2012年全世界有778500個(gè)新病例和745 500例肝癌死亡病例。大部分原發(fā)性肝癌是肝細(xì)胞癌（HCC），往往在晚期才能被診斷出來(lái)，治療手段是手術(shù)切除或肝移植，盡管手術(shù)不斷改善，但預(yù)后任然很差。因此深入理解肝癌發(fā)病機(jī)制，獲得新肝癌治療靶標(biāo)一直是科學(xué)家探索的方向，circRNA在眾多生理功能和疾病發(fā)生發(fā)展過(guò)程起著重要作用。本文從circRNA角度出發(fā)，挖掘circRNA在肝癌中的作用機(jī)制。研究者通過(guò)circRNA微陣列芯片篩選肝癌組織中的差異表達(dá)circRNA，并經(jīng)過(guò)qRT-PCR驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)circFBLIM1在肝癌中異常高表達(dá)，進(jìn)一步細(xì)胞功能研究表明circFBLIM1可促進(jìn)肝癌細(xì)胞增殖和侵襲，抑制凋亡。敲低circFBLIM1則細(xì)胞表現(xiàn)出抑癌表征，說(shuō)明circFBLIM1在肝癌中可能起癌基因角色。進(jìn)一步分子機(jī)制研究，luciferase報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)表明circFBLIM1可競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-346，而miR-346下游的靶基因正是circFBLIM1的宿主基因FBLIM1，因此研究結(jié)果表明circFBLIM1通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性吸附miR-346，上調(diào)其自身宿主基因FBLIM1的表達(dá)，進(jìn)而促進(jìn)肝癌的發(fā)展，由此circFBLIM1可作為肝癌診斷治療的潛在靶標(biāo)。

圖注：circFBLIM1通過(guò)ceRNA 機(jī)制（miR-346）調(diào)控FBLIM1

A:qPCR和WB檢測(cè)FBLIM1在HCC細(xì)胞中的表達(dá)水平；

B：qPCR檢測(cè)circFBLIM1在50例HCC組織和癌旁組織的表達(dá)情況，顯著高表達(dá)；

C：生物信息預(yù)測(cè)miR-346結(jié)合FBLIM1的?3’UTR；

D：luciferase報(bào)告基因分析顯示miR-346可直接結(jié)合調(diào)控FBLIM1；

E：HCC細(xì)胞中轉(zhuǎn)染miR-346后，qPCR檢測(cè)FBLIM1的表達(dá)；

F：siRNA干擾FBLIM1后，qPCR檢測(cè)miR-346表達(dá)水平（上調(diào)）；

G&H： HCC細(xì)胞轉(zhuǎn)染NC, si-circFBLIM1 或si-circFBLIM1 +miR-346 LNA后，qCPR檢測(cè)FBLIM1或circFBLIM1的表達(dá)；

i： HCC細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-NC, miR-346 或miR-346+si-circFBLIM1后，CCK8檢測(cè)細(xì)胞增殖能力；

J：HCC細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-NC, miR-346 或miR-346+si-circFBLIM1后，細(xì)胞凋亡情況檢測(cè)。

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3、CircRNA8924通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合MiR-518d-5p/519-5p家族調(diào)節(jié)CBX8的表達(dá)進(jìn)而促進(jìn)子宮頸癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲

論文標(biāo)題：CircRNA8924 Promotes Cervical Cancer Cell Proliferation, Migration and Invasion by Competitively Binding to MiR-518d-5p /519-5p Family and Modulating the ex pression of CBX8

雜志：cell Physiol Biochem.?影響因子：5.5

通訊作者單位：遼寧省腫瘤醫(yī)院

宮頸癌（Cervical cancer，CC）是世界上最常見(jiàn)的婦科癌癥，并且已經(jīng)證明持續(xù)感染高危型人乳頭瘤病毒（HR-HPV）是其宮頸癌組織發(fā)生和發(fā)展的重要致病因素。 隨著近年來(lái)HPV疫苗的廣泛應(yīng)用，宮頸癌的一級(jí)預(yù)防已在一定程度上得到實(shí)現(xiàn)，其發(fā)病率和死亡率在許多發(fā)達(dá)國(guó)家得到有效控制。 然而，較高的HPV感染率始終伴隨著相對(duì)較低的CC發(fā)病率，這不僅使CC篩查和一級(jí)預(yù)防成為衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)學(xué)的沉重經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)，而且暗示CC中的個(gè)體遺傳差異和其他重要因素。因此，必須探索CC的確切發(fā)病機(jī)制，并找到全新的診斷標(biāo)志物作為潛在的治療靶點(diǎn)。近年來(lái)，circRNA成為疾病研究的熱點(diǎn)， 與具有傳統(tǒng)線性結(jié)構(gòu)的miRNA和lncRNA不同，circRNA是共價(jià)閉合的連續(xù)環(huán)。由于缺乏3’，5’末端和poly A尾，circRNAs可以避免外切核酸酶和RNase R的降解作用。與線性RNA相比，circRNA更保守和穩(wěn)定，并顯示細(xì)胞特異性，組織特異性和階段性。

在該研究中，研究者使用人circRNA微陣列篩選CC組織和配對(duì)的癌旁正常組織，結(jié)果顯示circRNA8924是顯著上調(diào)。 CircRNA8924（DeepBase）也稱為hsa_circ_0141539（circBase），來(lái)源于Clorf116基因的外顯子，位于chr1：2072008388-207201024。通過(guò)生物信息學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)miR-519a-5p，miR-519c-5p和miR-518e-5p與circRNA8924的具有較強(qiáng)的結(jié)合位點(diǎn)。這些miRNA屬于miR-518d-5p / 519-5p家族，并且大多數(shù)家族成員具有相同的核苷酸序列，僅有1或2個(gè)核苷酸差別。miR-518d-5p / 519-5p家族其中一些成員已在腫瘤中報(bào)道。最近的研究表明，miR-526a在肝癌組織中的低表達(dá)可以靶向PAK7的調(diào)節(jié)。 miR-526a的過(guò)表達(dá)顯著抑制HCC細(xì)胞Huh7和HepG2的增殖，遷移，侵襲和異位種植。然而，miR-518d-5p / 519-5p家族在CC中的表達(dá)和機(jī)制尚不清楚。該研究首次證明了circRNA8924在CC的腫瘤發(fā)生中的重要作用，并揭示其作為ceRNA的功能，通過(guò)海綿miR-518-d-5p / 519-5p調(diào)節(jié)CBX8的表達(dá)。

圖注：宮頸癌中circRNA8924與miR-519a-5P表達(dá)相關(guān)性研究

A：qPCR檢測(cè)miR-519a-5p在宮頸癌組織標(biāo)本（n=33）中顯著低表達(dá)；

B：circRNA8924與miR-519a-5P在宮頸癌組織中的表達(dá)水平顯著負(fù)相關(guān)；

C：circRNA8924與miR-519a-5P結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè)及突變位點(diǎn)示意圖；

D：luciferase報(bào)告基因證明circRNA8924與miR-519a-5P可直接結(jié)合；

E：shRNA敲低circRNA8924后，qPCR檢測(cè)miR-519a-5p的表達(dá)水平升高；

4、circ2Disease：人工編輯的經(jīng)過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的人類疾病circRNAs的數(shù)據(jù)庫(kù)?

論文標(biāo)題：Circ2Disease: a manually curated database of experimentally validated circRNAs in human disease

雜志：Sci Rep.??影響因子：4.122

通訊作者單位：浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院

環(huán)狀RNA（circRNAs）是一類新的RNA分子，在人類疾病中發(fā)揮著重要作用。越來(lái)越多的circRNA被證明具有生物學(xué)功能，所以很有必要整合相關(guān)信息以促進(jìn)人類疾病中circRNA功能和分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究。Circ2Disease數(shù)據(jù)庫(kù)包含233個(gè)circRNA和54個(gè)人類疾病，以及273條人工整理的疾病-circRNA關(guān)聯(lián)記錄，120個(gè)circRNA-疾病關(guān)聯(lián)具有較強(qiáng)的實(shí)驗(yàn)證據(jù)。每個(gè)關(guān)聯(lián)包括circRNA名稱，疾病名稱，表達(dá)模式，實(shí)驗(yàn)方法，circRNA-疾病關(guān)系的簡(jiǎn)要功能描述，以及其他詳細(xì)信息。經(jīng)過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的miRNA可能被這些circRNA及其驗(yàn)證目標(biāo)“吸附”，也被整合進(jìn)circRNA分子網(wǎng)絡(luò)。Circ2Disease提供用戶友好的界面，便于瀏覽，搜索，分析網(wǎng)絡(luò)和下載數(shù)據(jù)。Circ2Disease將顯著提高我們對(duì)疾病中circRNA失調(diào)的理解，并且是研究circRNA在人類疾病中的轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)作用的有用資源。

Circ2Disease數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)址：http://www.disease-ontology.org/

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文獻(xiàn)列表：

文 | circRNA 吉賽生物

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