美國科學(xué)院院士Joseph PUGLISI教授重磅加盟CNAF2018-肽度TIMEDOO
CNAF2018大會組委會最新公布,全球著名結(jié)構(gòu)生物學(xué)大咖、美國科學(xué)院院士Joseph PUGLISI教授確定重磅加盟中國核酸國際論壇(CNAF2018)并將作為論壇的特邀報(bào)告嘉賓之一。論壇期間11月15日13:50-14:35Dr. PUGLISI將為與會者帶來極富啟發(fā)性的特邀報(bào)告:“How mRNA controls the dynamics of translation”。據(jù)小編了解到,報(bào)告將分享他如何運(yùn)用有效的分子生物物理學(xué)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)、物理化學(xué)和生物化學(xué)研究工具或技術(shù)(如單分子方法、冷凍電鏡、核磁共振等)揭示RNA的構(gòu)象、功能、機(jī)制及相互作用,其本人表示將同與會者分享其最新的突破性成果,非常令人期待!
? 特邀報(bào)告嘉賓簡介??
美國科學(xué)院院士Joseph PUGLISI教授重磅加盟CNAF2018-肽度TIMEDOO
Joseph (Jody) PUGLISI美國科學(xué)院院士斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院全球著名結(jié)構(gòu)生物學(xué)教授
Dr. PUGLISI教授現(xiàn)為美國斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院結(jié)構(gòu)生物學(xué)教授,美國科學(xué)院院士,斯坦福磁共振實(shí)驗(yàn)室負(fù)責(zé)人。1989年獲得加州大學(xué)伯克利分校生物物理化學(xué)博士學(xué)位。他已發(fā)表近200篇科學(xué)研究論文,其中在Cell,Nature,Science三大國際頂級期刊已發(fā)表近20篇重磅學(xué)術(shù)成果。目前他還是PNAS、EMBO reports編委會成員,擔(dān)任Biophysical Journal、Structure編輯,本人并曾獲NIH優(yōu)異獎(jiǎng)。
? 研究領(lǐng)域??
Dr. Puglisi實(shí)驗(yàn)室主要致力于研究RNA在細(xì)胞過程和疾病中的機(jī)制和作用。研究目標(biāo)是通過分子生物物理學(xué)、結(jié)構(gòu)生物學(xué)、物理化學(xué)和生物化學(xué)等工具來研究RNA構(gòu)象、功能和機(jī)制的動態(tài)相互作用。采用核磁共振波譜、x射線結(jié)晶學(xué)和冷凍電鏡等結(jié)構(gòu)分析方法,將結(jié)構(gòu)視圖與單分子水平上的實(shí)時(shí)動力學(xué)相結(jié)合。將結(jié)構(gòu)、動力學(xué)和功能統(tǒng)一起來,最終尋找到新的治療策略以及靶向涉及RNA的過程。
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“What is the role of RNA in cellular processes and disease?”
Dr. PUGLISI教授目前研究方向:
1、翻譯起始、延伸、終止和再循環(huán)的基本機(jī)制
Dr. Puglisi實(shí)驗(yàn)室正在研究細(xì)菌中翻譯起始、延伸和終止/再循環(huán)的基本步驟,開發(fā)了單分子方法來實(shí)時(shí)跟蹤核糖體組成和構(gòu)象,跟蹤IF2調(diào)節(jié)的起始動力學(xué),tRNA選擇如何發(fā)生,肽鍵形成如何導(dǎo)致核糖體構(gòu)象變化,以及EF-G結(jié)合和 GTP水解如何導(dǎo)致易位和有效的核糖體構(gòu)象變化。最后,繪制了亞基終止和循環(huán)發(fā)生的構(gòu)象路徑。目的是建立一個(gè)連貫的蛋白質(zhì)合成動力學(xué)機(jī)制。
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2、RNA修飾、RNA結(jié)構(gòu)以及新生肽和蛋白質(zhì)誘導(dǎo)的核糖體停滯
蛋白質(zhì)合成不是連續(xù)和有規(guī)律的,而是包括延伸過程中的暫停和停滯。單分子熒光可以直接監(jiān)測延伸動力學(xué)。Dr. Puglisi實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)證明,延伸暫停的發(fā)生是由于mRNA修飾(m6A)、二級結(jié)構(gòu)(發(fā)夾)和核糖體出口通道中的新生肽相互作用。暫停狀態(tài)的性質(zhì)和持續(xù)時(shí)間因tRNA結(jié)合或核糖體運(yùn)動中的阻斷而不同。Dr. Puglisi實(shí)驗(yàn)室將繼續(xù)探索在翻譯延伸過程中mRNA序列、修飾、結(jié)構(gòu)和蛋白質(zhì)折疊之間顯著的相互作用。
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3、重編碼事件,包括移碼和框內(nèi)跳譯
翻譯重編碼(其中核糖體在延伸過程中改變了閱讀框)仍然是關(guān)注的焦點(diǎn)。Dr. Puglisi實(shí)驗(yàn)室使用單分子方法來跟蹤-1和+1移碼和翻譯框內(nèi)跳譯,其中核糖體跳過>50nt的mRNA。結(jié)果表明,在旋轉(zhuǎn)、預(yù)易位狀態(tài)下的翻譯暫停的時(shí)間是由EF-G驅(qū)動的重編碼的前奏。
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4、藥物-核糖體相互作用和機(jī)制
許多抗生素靶向核糖體,直接結(jié)合功能重要部位。Dr. Puglisi實(shí)驗(yàn)室對藥物-核糖體相互作用有著長期的興趣,可以追溯到20世紀(jì)90年代對氨基糖苷類-核糖體相互作用的核磁共振研究。目前,Dr. Puglisi實(shí)驗(yàn)室正在探索藥物結(jié)合如何破壞核糖體動力學(xué),以全面或密碼子特異性方式擾亂能量景觀。藥物-核糖體相互作用是如何在治療上靶向RNA過程的模型。
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5、真核生物翻譯起始機(jī)制-5’末端識別、讀取、啟動密碼子識別
真核生物中的翻譯起始是一個(gè)復(fù)雜的過程,涉及到>10個(gè)起始因子,必須識別5’帽結(jié)構(gòu),組裝40S核糖體起始復(fù)合物,然后掃描到起始密碼子;在開始密碼子識別時(shí),催化60S亞基連接以產(chǎn)生可延伸的80S核糖體。Dr. Puglisi實(shí)驗(yàn)室正在使用單分子和結(jié)構(gòu)方法來探索翻譯起始的動態(tài)途徑,作為描述調(diào)控機(jī)制的基礎(chǔ)。
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6、HCV IRES介導(dǎo)的翻譯起始
盡管現(xiàn)存有一些治療方法,但丙型肝炎病毒(HCV)仍然是全球主要的健康問題。HCV是一種正義RNA病毒,其基因組在病毒進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)后被翻譯。 HCV在其5’基因組區(qū)域中使用結(jié)構(gòu)化RNA元件來規(guī)避宿主cap依賴性翻譯,并通過一個(gè)起始因子子集直接結(jié)合40S亞基來啟動。Dr. Puglisi實(shí)驗(yàn)室正在應(yīng)用結(jié)構(gòu)和單分子方法來了解HCV IRES如何指導(dǎo)人類細(xì)胞中的翻譯起始。
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7、3’末端翻譯調(diào)控
翻譯控制通常通過mRNA的3’非翻譯區(qū)中的蛋白質(zhì)-RNA或RNA-RNA相互作用發(fā)生。目前的翻譯模型表明,3’末端的因子與mRNA的5’末端的起始復(fù)合物相互作用,以控制起始的速率和效率。Dr. Puglisi實(shí)驗(yàn)室正在探索各種mRNA中這種遠(yuǎn)程通訊的機(jī)制基礎(chǔ)。
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8、翻譯過程在人類疾病中的作用
蛋白質(zhì)的錯(cuò)誤翻譯是許多疾病的基礎(chǔ)。例如,在ALS中,基因C9orf72中的三聯(lián)體重復(fù)擴(kuò)增已經(jīng)顯示出引起疾病。盡管在正常未翻譯的區(qū)域中,這些重復(fù)被翻譯,導(dǎo)致有毒的蛋白質(zhì)聚集。Dr. Puglisi實(shí)驗(yàn)室正在研究這些重復(fù)序列的“重復(fù)相關(guān)非AUG”翻譯機(jī)制,以驗(yàn)證這些產(chǎn)物是由不需要起始密碼子的IRES樣途徑產(chǎn)生的假設(shè)。疾病中的許多其他過程涉及翻譯缺陷,是治療干預(yù)的潛在靶標(biāo)。
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9、單分子方法
為了探究RNA過程的動力學(xué),需要新的方法。最初使用核磁共振波譜來探測RNA結(jié)構(gòu)和功能。在過去十年中,通過結(jié)合核糖體遺傳學(xué)和生物化學(xué)、新型納米結(jié)構(gòu)(ZMW)和儀器(改良的PacBioRS)以及改進(jìn)染料光物理行為,開發(fā)了單分子方法。Dr. Puglisi實(shí)驗(yàn)室將繼續(xù)為實(shí)現(xiàn)復(fù)雜生物系統(tǒng)的實(shí)時(shí)分子電影開發(fā)新的方法。
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? 主要代表性文章??
[1] Larsen K P, Mathiharan Y K, Kappel K, et al. Architecture of an HIV-1 reverse transcriptase initiation complex[J]. Nature, 2018, 557(7703): 118.[2] Choi J, Grosely R, Prabhakar A, et al. How Messenger RNA and Nascent Chain Sequences Regulate Translation Elongation[J]. Annual review of biochemistry, 2018, 87: 421-449.[3] Choi J, Indrisiunaite G, DeMirci H, et al. 2′-O-methylation in mRNA disrupts tRNA decoding during translation elongation[J]. Nature structural & molecular biology, 2018, 25(3): 208.[4] Choi J, Puglisi J D. Three tRNAs on the ribosome slow translation elongation[J]. PNAS, 2017: 201719592.

[5] Choi J, Ieong K W, Demirci H, et al. N 6-methyladenosine in mRNA disrupts tRNA selection and translation-elongation dynamics[J]. Nature structural & molecular biology, 2016, 23(2): 110.

[6] Siprashvili Z, Webster D E, Johnston D, et al. The noncoding RNAs SNORD50A and SNORD50B bind K-Ras and are recurrently deleted in human cancer[J]. Nature genetics, 2016, 48(1): 53.

[7] Chen J, Coakley A, O’Connor M, et al. Coupling of mRNA structure rearrangement to ribosome movement during bypassing of non-coding regions[J]. Cell, 2015, 163(5): 1267-1280.

[8] Puglisi J D. Synthetic biology: Ribosomal ties that bind[J]. Nature, 2015, 524(7563): 45.

[9] Puglisi J D. The delicate dance of translation and folding[J]. Science, 2015, 348(6233): 399-400.

[10] Tsai A, Petrov A, Marshall R A, et al. Heterogeneous pathways and timing of factor departure during translation initiation[J]. Nature, 2012, 487(7407): 390.

? Dr. PUGLISI教授所獲的榮譽(yù)獎(jiǎng)項(xiàng)??
Member, National Academy of Sciences (2014)Merit Award, NIH (2011)NIH Director’s Transformative R01 (T-R01) Program Award, NIH (2011)Alfred P. Sloan Research Fellow, Alfred P. Sloan Research Foundation (1997)

David and Lucille Packard Fellow, David and Lucille Packard Fellowship in Science and Engineering (1994-99)

Teacher Scholar, Camille and Henry Dreyfus Teacher Scholar Award (1993)

對于目前正在從事RNA及相關(guān)結(jié)構(gòu)生物學(xué)及功能組學(xué)研究的小伙伴們格外關(guān)注Dr. PUGLISI教授此次的中國之行,目前已收到來自北京、上海、廣州、西安、重慶等高校的有關(guān)課題組報(bào)名前來參會。更多論壇信息或報(bào)名優(yōu)惠,請致電CNAF2018會務(wù)組,我們將竭誠為您服務(wù)!
關(guān)于中國核酸國際論壇(CNAF2018)
會議時(shí)間: 2018年11月15日-11月16日會議地點(diǎn): 廣州翡翠皇冠假日酒店(科學(xué)城)會議官網(wǎng): https://www.cnaf.org.cn/
參會注冊:
電腦版注冊:https://www.cnaf.org.cn/cnaf/register/手機(jī)版注冊:https://c.eqxiu.com/s/Lu1hdSAD

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