杜克大學(xué):開發(fā)智能顯微鏡學(xué)習(xí)診斷傳染病,準(zhǔn)確率達(dá)90%-肽度TIMEDOO

TIMEDOO肽度(微信號(hào):Time-doo)獲悉,有經(jīng)驗(yàn)的科研人士往往比新手更有效地使用自己行業(yè)的工具,比如細(xì)胞學(xué)家,他們知道如何設(shè)置設(shè)備的參數(shù),讓顯微鏡可以產(chǎn)生清晰的圖像,令到評(píng)估細(xì)胞變得更具一致性和準(zhǔn)確度。
現(xiàn)在杜克大學(xué)(Duke University)的研究人員賦予了顯微鏡智能調(diào)整其設(shè)置的能力,包括光線角度、顏色和圖案,以便在對(duì)健康和瘧疾感染的紅血球進(jìn)行分類時(shí)獲得最佳結(jié)果。因?yàn)樵撓到y(tǒng)解決的是數(shù)碼相機(jī)的功能,而不是人眼,因此讓顯微鏡的功能表現(xiàn)令人驚喜。

杜克大學(xué):開發(fā)智能顯微鏡學(xué)習(xí)診斷傳染病,準(zhǔn)確率達(dá)90%-肽度TIMEDOO

首席研究員Roarke Horstmeyer說:“標(biāo)準(zhǔn)顯微鏡用來自四面八方的相同數(shù)量的光照射樣品,幾百年來,照明已經(jīng)為人眼進(jìn)行了優(yōu)化?!薄暗怯?jì)算機(jī)可以看到人類看不到的東西。所以我們不僅重新設(shè)計(jì)了硬件,提供了多種照明選擇,還允許顯微鏡為自動(dòng)優(yōu)化照明。”

在此之前,其他研究小組,包括杜克大學(xué)的一些研究小組,已經(jīng)開發(fā)了計(jì)算機(jī)視覺算法,可以對(duì)感染了導(dǎo)致瘧疾的惡性瘧原蟲的細(xì)胞進(jìn)行分類。雖然有效,但它們?nèi)匀蝗狈εR床診斷所需的一致性與準(zhǔn)確性。

這個(gè)研究小組現(xiàn)在已經(jīng)教會(huì)了一臺(tái)計(jì)算機(jī)如何智能調(diào)整顯微鏡系統(tǒng)的各種參數(shù),并使用深度學(xué)習(xí)分類算法為其提供動(dòng)力,以至于它擊敗了經(jīng)驗(yàn)豐富的醫(yī)生和以前開發(fā)的瘧疾分類自動(dòng)化系統(tǒng)。

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與傳統(tǒng)顯微鏡(上)相比,新顯微鏡(下)產(chǎn)生的紅細(xì)胞圖像包含更多噪音,但由于光照條件,瘧疾寄生蟲被明亮的斑塊照亮。

新的成像系統(tǒng)使用一種新型的光源,從側(cè)面和下方包圍樣品。計(jì)算機(jī)可以改變這個(gè)碗燈燈具中的打開或關(guān)閉哪些LED燈,以及哪些顏色的使用。電腦顯示了數(shù)百個(gè)感染瘧疾病原體的紅血球樣本和健康細(xì)胞。該系統(tǒng)被用于調(diào)整照明,以便查看哪些設(shè)置在對(duì)單元進(jìn)行分類時(shí)效果最好。經(jīng)過機(jī)器訓(xùn)練后,該系統(tǒng)的準(zhǔn)確率達(dá)到約為90%,而醫(yī)生和現(xiàn)有的其他學(xué)習(xí)算法系統(tǒng)準(zhǔn)確率僅為75%。
該技術(shù)還可以應(yīng)用于其他診斷成像任務(wù),有機(jī)會(huì)實(shí)現(xiàn)醫(yī)院病理實(shí)驗(yàn)室整個(gè)過程的自動(dòng)化。

更多信息請(qǐng)參考 Biomedical Optics Express: Learned sensing: jointly optimized microscope hardware for accurate image classification

編輯|周新思