歡迎各位來到“circRNA研究報(bào)道匯總”欄目，本期從pubmed中檢索收集最新發(fā)布的circRNA文獻(xiàn)28篇，下面我們一起來看看circRNA研究有哪些新進(jìn)展。

1、?來自胃癌外泌體的circRNA通過靶向miR-133/PRDM16途徑促進(jìn)白色脂肪褐變

文獻(xiàn)標(biāo)題：Exosomal circRNA derived from gastric tumor promotes white adipose browning by targeting the miR-133/PRDM16 pathway

期刊：Int J Cancer. 影響因子：7.36

通訊作者單位：天津醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院

癌癥相關(guān)的惡病質(zhì)是一種代謝綜合征，其特征在于脂肪和骨骼肌的消耗紊亂，并伴有體重減輕和全身性炎癥。癌癥惡病質(zhì)的治療選擇是有限的，并且分子機(jī)制仍然知之甚少。環(huán)狀RNA（circRNA）是一種新的內(nèi)源性RNA家族，已被發(fā)現(xiàn)廣泛參與調(diào)節(jié)哺乳動物的基因表達(dá)。外泌體是源自細(xì)胞的小囊泡，并且最近的研究表明circRNA在外泌體中穩(wěn)定存在。然而，關(guān)于circRNA在外泌體中的生物學(xué)作用知之甚少。在這項(xiàng)研究中，我們發(fā)現(xiàn)在胃癌（GC）血漿外泌體中的circRNAs具有特異性表達(dá)特征，并且ciRS-133與GC患者中白色脂肪組織（WAT）的褐變相關(guān)。源自GC細(xì)胞的外泌體將ciRS-133遞送到前脂肪細(xì)胞中，通過激活PRDM16和抑制miR-133促進(jìn)前脂肪細(xì)胞分化成棕色樣細(xì)胞。此外，ciRS-133的敲低減少了腫瘤移植小鼠的癌癥惡病質(zhì)，減少了氧氣消耗和產(chǎn)熱。因此，外泌體遞送的circRNA參與WAT褐變并在癌癥相關(guān)的惡病質(zhì)中起關(guān)鍵作用。

圖注：A:電鏡檢測分離自人血漿外泌體；B：NTA納米顆粒示蹤儀分析外泌體粒徑；C：Western blot分析外泌體表面標(biāo)志物；D:circRNA芯片初步篩查胃癌血漿來源外泌體中的circRNAs；E:RT-qPCR驗(yàn)證ciRS-133在胃癌血漿中顯著高表達(dá)。

圖注：F：相對于癌旁組織，ciRS-133在胃癌組織中顯著高表達(dá)；G：生信預(yù)測發(fā)現(xiàn)ciRS-133上存在2個(gè)miR-133結(jié)合位點(diǎn)；H:ciRS-133與褐色脂肪組織（BAT）質(zhì)量正相關(guān)；I：ciRS-133與個(gè)體脂肪比率負(fù)相關(guān)。

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2 一種新的環(huán)狀RNA circFAT1(e2)通過靶向細(xì)胞質(zhì)中的miR-548g并與細(xì)胞核中的YBX1相互作用來抑制胃癌的進(jìn)展

文獻(xiàn)標(biāo)題：A novel circular RNA, circFAT1(e2), inhibits gastric cancer progression by targeting miR-548g in the cytoplasm and interacting with YBX1 in the nucleus

期刊：Cancer Lett. 影響因子：6.494

通訊作者單位：蘇州大學(xué)第一附屬醫(yī)院

在本研究中，研究者通過分析挖掘GEO數(shù)據(jù)庫中胃癌(GC)組織環(huán)狀RNA (circRNA)表達(dá)譜。發(fā)現(xiàn)一個(gè)新的circRNA, has_circ_0001461，我們稱之為circFAT1(e2)并進(jìn)一步證實(shí)circFAT1(e2)在胃癌組織和細(xì)胞系中顯著下調(diào)，并與胃癌患者的總體生存率相關(guān)。熒光原位雜交(FISH)分析顯示circFAT1(e2)分布在GC細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)中，也可分布在細(xì)胞核中。功能實(shí)驗(yàn)表明，circFAT1(e2)的過表達(dá)抑制了GC細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。然后，我們研究circFAT1(e2)是否作為microRNA-549g(miR-548g)的海綿并調(diào)控腫瘤抑制因子RUNX1在GC細(xì)胞中的表達(dá)。此外，我們發(fā)現(xiàn)位于核的circFAT1(e2)可以直接與Y-box結(jié)合蛋白-1 (YBX1)相互作用并抑制其功能。綜上所述，circFAT1(e2)可能通過調(diào)節(jié)細(xì)胞質(zhì)中的miR-548g/RUNX1軸，靶向細(xì)胞核中的YBX1，在GC細(xì)胞中發(fā)揮抑癌作用。

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圖注：A：通過生物信息學(xué)技術(shù)挖掘GEO中胃癌中差異表達(dá)的circRNA表達(dá)譜并繪制聚類熱圖；B：兩個(gè)GEO數(shù)據(jù)集中存在兩個(gè)重疊的circRNA（GSE100170和?GSE83521）；C: circFAT1(e2)基因組定位示意圖；

圖注：D:RT-PCR在gDNA和cDNA中驗(yàn)證circFAT1(e2)的表達(dá)；E:sanger測序驗(yàn)證circFAT1(e2)的反向拼接位點(diǎn)序列；F：RT-PCR檢測circFAT1(e2)和linFAT1在放線菌D處理MGC803細(xì)胞中的表達(dá)情況；G：RT-PCR檢測circFAT1(e2)和linFAT1在RNase R處理MGC803細(xì)胞中的表達(dá)情況；

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3、?環(huán)狀RNA表達(dá)譜鑒定前列腺癌特異性環(huán)狀RNA

文獻(xiàn)標(biāo)題：Circular RNA Expression Profiling Identifies Prostate Cancer- Specific circRNAs in Prostate Cancer

期刊：Cell Physiol Biochem. 影響因子：5.5

通訊作者單位：上海復(fù)旦大學(xué)

前列腺癌(PCa)是嚴(yán)重?fù)p害男性健康的主要癌癥之一，發(fā)病率和死亡率均較高，但目前對于前列腺癌的診斷和預(yù)后尚無理想的分子標(biāo)志物。該研究采用ceRNA芯片在4對前列腺癌及癌旁組織中篩選差異表達(dá)環(huán)狀RNA，以確定其是否可作為前列腺癌診斷的新生物標(biāo)志物。利用Cytoscape軟件構(gòu)建了circRNA-miRNA-mRNA的差異環(huán)狀RNA及其宿主基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。通過qRT-PCR技術(shù)驗(yàn)證微陣列數(shù)據(jù)。結(jié)果表明我們在PCa腫瘤中發(fā)現(xiàn)了1021個(gè)差異表達(dá)的環(huán)狀RNA，并通過qRT-PCR分析證實(shí)了circ_0057558、circ_0062019和SLC19A1在PCa細(xì)胞系和腫瘤組織中的表達(dá)。我們發(fā)現(xiàn)，PSA水平與兩種差異表達(dá)的環(huán)狀RNA聯(lián)合使用后，診斷性能AUC靈敏度和特異性(分別為0.938、84.5%和90.9%)均明顯高于單獨(dú)使用PSA(血清PSA的AUC為0.854)。此外，circ_0057558與總膽固醇呈正相關(guān)。circRNA-miRNA-mRNA分析的功能網(wǎng)絡(luò)顯示circ_0057558和circ_0034467調(diào)控了miR-6884, circ_0062019和circ_0060325調(diào)控了miR-5008。研究結(jié)果表明，circ_0062019和circ_0057558兩個(gè)差異表達(dá)環(huán)狀RNA和circ_0062019的宿主基因SLC19A1可作為前列腺癌潛在的新型生物標(biāo)志物。

圖注： circRNA芯片的散點(diǎn)圖和聚類熱圖展示了circRNA和mRNA在前列腺癌組織和正常組織中的差異表達(dá)情況

圖注：前列腺癌中差異表達(dá)circRNA的宿主基因gene ontology富集分析結(jié)果（前30個(gè)term）

表2:生物信息學(xué)預(yù)測4個(gè)差異表達(dá)的circRNA可能結(jié)合的miRNAs

圖注：三個(gè)circRNA分子（circ_0057558, circ_0062019, circ_0075538）和SLC19A1在前列腺癌和癌旁組織中的差異表達(dá)情況（采用qRT-PCR技術(shù)檢測）

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參考文獻(xiàn)列表

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