隨全球人口老齡化程度加劇,實(shí)現(xiàn)健康老齡化是目前亟待解決的社會(huì)問(wèn)題和科學(xué)問(wèn)題。近年來(lái),隨衰老相關(guān)研究成果不斷增多及高通量測(cè)序技術(shù)日益發(fā)展,衰老相關(guān)多組學(xué)數(shù)據(jù)逐漸增多。然而目前,尚缺乏一個(gè)綜合性的、整合衰老生物學(xué)多組學(xué)數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)資源庫(kù)。

中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所(國(guó)家生物信息中心)研究員鮑一明研究組、研究員張維綺研究組和中科院動(dòng)物研究所研究員劉光慧研究組、研究員曲靜研究組,合作建立Aging Atlas數(shù)據(jù)庫(kù)。該數(shù)據(jù)庫(kù)從常規(guī)轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、表觀基因組、蛋白質(zhì)組及藥物基因組等層面,整合衰老相關(guān)數(shù)據(jù)集,實(shí)現(xiàn)不同條件下基因表達(dá)調(diào)控隨衰老變化趨勢(shì)的匯聚融合。該數(shù)據(jù)庫(kù)中,用戶可實(shí)現(xiàn)交互查詢和聯(lián)合分析不同層次組學(xué)數(shù)據(jù)等功能;數(shù)據(jù)庫(kù)將不斷完善,建立多層次組學(xué)間的整合分析和數(shù)據(jù)呈現(xiàn),并形成升級(jí)版本;數(shù)據(jù)庫(kù)提供歸屬不同通路的衰老相關(guān)基因集,使用戶可更深入全面地了解特定基因和通路在衰老生物學(xué)中的意義。Aging Atlas提供開放的數(shù)據(jù)共享平臺(tái),用戶可在上傳界面進(jìn)行原始數(shù)據(jù)和處理后數(shù)據(jù)的上傳操作,為實(shí)現(xiàn)全球數(shù)據(jù)共享提供便利。Aging Atlas的建立旨在為世界范圍內(nèi)衰老相關(guān)大數(shù)據(jù)的統(tǒng)一匯交、集中存儲(chǔ)、安全管理、開放共享及前沿交叉研究和轉(zhuǎn)化應(yīng)用提供助力。相關(guān)研究成果以Aging Atlas: a multi-omics database for aging biology為題,在線發(fā)表在Nucleic Acids Research上。

Aging Atlas數(shù)據(jù)庫(kù)首次實(shí)現(xiàn)對(duì)與衰老相關(guān)的不同層次的多組學(xué)數(shù)據(jù)的收錄和整合,其對(duì)用戶免費(fèi)開放,且持續(xù)實(shí)時(shí)更新,將有助于推動(dòng)衰老相關(guān)的基礎(chǔ)研究和臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用的發(fā)展。Aging Atlas希望在廣大科學(xué)工作者的支持下,不斷吸納更多高質(zhì)量的衰老研究數(shù)據(jù),以更好地服務(wù)衰老生物學(xué)和老年醫(yī)學(xué)的發(fā)展。

該數(shù)據(jù)庫(kù)由北京基因組所、動(dòng)物所、中科院干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)創(chuàng)新研究院、中科院干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)科學(xué)數(shù)據(jù)中心、首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院等合作完成。數(shù)據(jù)庫(kù)的建設(shè)得到北京基因組所研究員楊運(yùn)桂、慈維敏、任捷、韓大力,動(dòng)物所研究員宋默識(shí)、周兵和副研究員馮桂海,中科院生物物理研究所所研究員陳暢,北京大學(xué)教授湯富酬教授、趙揚(yáng),浙江大學(xué)教授郭國(guó)驥和同濟(jì)大學(xué)教授尹曉磊的指導(dǎo)和支持。研究工作得到科技部、國(guó)家自然科學(xué)基金委、中科院和北京市等的資助。

論文鏈接

北京基因組所等合作建立衰老生物學(xué)多組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)-肽度TIMEDOO

Aging Atlas數(shù)據(jù)庫(kù)

來(lái)源: 北京基因組研究所