KRAS抑制劑的“前世今生”
文|曼話
KRAS是一種GTP酶,可催化三磷酸鳥苷(GTP)水解為二磷酸鳥苷(GDP)。當(dāng)與GTP結(jié)合時,KRAS處于激活狀態(tài),相反,與GDP結(jié)合時處于失活狀態(tài)。通過在激活和失活狀態(tài)間切換,KRAS控制著多種不同的細(xì)胞功能。
GTPase激活蛋白(GAPs,如NF1)可增強KRAS的GTP酶活性,促進(jìn)與KRAS結(jié)合的GTP水解成為GDP,從而抑制KRAS的激活;而鳥嘌呤核苷酸交換因子(GEFs,如SOS1/2)可增強GDP向GTP轉(zhuǎn)換,催化KRAS與GTP的結(jié)合,從而促進(jìn)KRAS的激活。
KRAS通過激活多種效應(yīng)蛋白來控制大量的細(xì)胞功能。被研究最充分的效應(yīng)器包括RAF激酶和磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)的催化亞基。KRAS-GTP與RAF激酶結(jié)合可刺激其二聚化和激活,從而觸發(fā)MEK和ERK的逐步激活,這是驅(qū)動細(xì)胞周期進(jìn)展和增殖的一條通路。通過與PI3K結(jié)合,KRAS幫助激活A(yù)KT和MTOR,而AKT和MTOR調(diào)節(jié)細(xì)胞凋亡、代謝和翻譯。
KRAS突變發(fā)生于約25%的癌癥病例中,主要見于肺癌、胰腺癌和結(jié)直腸癌,與極差的疾病預(yù)后有關(guān)。其中,KRAS(G12C)突變是最常見的KRAS突變之一,具體指KRAS 12位的甘氨酸(glycine)突變?yōu)榘腚装彼幔╟ysteine)。該突變存在于~13%的肺腺癌,~3%的結(jié)直腸癌、~2%的子宮癌和~1%的間皮瘤中,胰腺癌(<1%)、宮頸癌(<1%)、膀胱癌(<1%)和胃癌(<1%)中也有低比例的KRAS(G12C)突變。
在患者中有效靶向KRAS信號傳導(dǎo)一直非常困難。一方面,由于RAS GTP酶對核苷酸有非常高的親和力,因此,很難開發(fā)有效的競爭性抑制劑。另一方面,靶向KRAS在質(zhì)膜上的定位(KRAS激活的關(guān)鍵步驟)也無效,因為許多代償途徑可調(diào)控這一過程。類似的,靶向KRAS下游效應(yīng)信號也沒有產(chǎn)生顯著的臨床效益。
此外,由于KRAS蛋白表面除了一個GTP結(jié)合口袋,其它部分非常光滑,藥物研發(fā)人員很難在其表面找到小分子候選藥物的結(jié)合口袋,因為,KRAS靶向療法的研發(fā)在先前的幾十年中遭遇了很大的挫折,鮮有突破進(jìn)展。
不過,2013年發(fā)表在Nature上的一篇論文使KRAS靶向藥物的研發(fā)迎來了轉(zhuǎn)折。加州大學(xué)舊金山分校的化學(xué)生物學(xué)家Kevan Shoka團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)KRAS(G12C)突變新引入的半胱氨酸很容易形成共價鍵,并設(shè)計出了能夠不可逆地靶向KRAS的12號密碼子上的半胱氨酸殘基的共價小分子抑制劑。從那時起,KRAS(G12C)靶向藥物的研發(fā)進(jìn)入了全新的發(fā)展時期。
來源:Cell
10月15日,發(fā)表在Cell雜志上的一篇題為“Targeting KRAS(G12C): From Inhibitory Mechanism to Modulation of Antitumor Effects in Patients”的PERSPECTIVE中,來自Memorial Sloan Kettering癌癥中心的3位科學(xué)家,回顧了KRAS(G12C)選擇性抑制劑近幾年令人興奮的研究進(jìn)展,并討論了這些新療法的作用機制、細(xì)胞效應(yīng)以及患者療效。以下摘編其中部分內(nèi)容,供參考學(xué)習(xí):
一、KRAS(G12C)抑制劑
直接靶向KRAS突變體是科學(xué)家們的長期目標(biāo)。最早的工作可追溯到上世紀(jì)80年代,當(dāng)時研究者們發(fā)現(xiàn),人類癌細(xì)胞中有激活的RAS突變。不過,如前文所述,該領(lǐng)域真正取得突破是在2013年,當(dāng)時Kevan Shoka團(tuán)隊在一篇Nature論文中公布了他們所開發(fā)的一款可選擇性靶向KRAS(G12C)的抑制劑,該分子對野生型和其它突變版本的KRAS沒有影響。如圖1A所示,這一選擇性抑制劑與突變半胱氨酸殘基共價結(jié)合,占據(jù)“switch II region”的一個口袋(a pocket in the switch II region, SIIP)。
圖1 KRAS(G12C)抑制劑及其作用機理
之后,基于結(jié)構(gòu)的優(yōu)化導(dǎo)致了對KRAS(G12C)親和力更強的抑制劑,如ARS853、ARS1620。這些抑制劑在多種腫瘤模型中以不同程度抑制KRAS(G12C)激活,減弱癌細(xì)胞增殖,以及誘導(dǎo)癌細(xì)胞死亡。其中,ARS1620還表現(xiàn)出能夠在異種移植物模型中抑制腫瘤生長。
得益于ARS化合物的結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系從早期就已公開,一些更有效的KRAS(G12C)抑制劑被開發(fā)出來。雖然這些抑制劑共享一個結(jié)合G12C的丙烯酰胺彈頭,但它們有著不同的化學(xué)結(jié)構(gòu)(圖1A)。其中,sotorasib(也稱為AMG510)和MRTX849能夠有效抑制小鼠的異種移植瘤生長。據(jù)報道,它們的效力增強是由于其與KRAS(G12C)α3螺旋中的H95殘基相互作用增強了。這種相互作用也被認(rèn)為是ARS1620和1_AM效力強于ARS853的原因。令人興奮的是,sotorasib和MRTX849現(xiàn)在都在KRAS(G12C)突變腫瘤患者中顯示出了臨床活性。
9月20日,安進(jìn)在頂級醫(yī)學(xué)期刊NEJM雜志上公布了Sotorasib的完整I期試驗結(jié)果。該I期試驗(NCT03600883)共招募了129例患者,59例為非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)、42例為結(jié)直腸癌、28例為其它類型的實體瘤。研究結(jié)果顯示,安全性方面,未觀察到劑量限制毒性效應(yīng)或治療相關(guān)的死亡。有73例患者(56.6%)發(fā)生了與治療相關(guān)的不良事件,其中,15例(11.6%)患者發(fā)生了3級或4級TRAEs。療效方面,在非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)隊列中,所有劑量組均可見抗癌活性,32.2%(19例)患者顯示出明確的客觀緩解(CR或PR),88.1%(52例) 患者疾病得到控制(客觀緩解或病情穩(wěn)定),中位無進(jìn)展生存期為6.3個月。在結(jié)直腸癌隊列中,有7.1%(3例)患者顯示明確的緩解,73.8%(31例)患者疾病得到控制,中位無進(jìn)展生存期為4.0個月。在胰腺癌、子宮內(nèi)膜癌、闌尾癌和黑色素瘤患者中也觀察到了緩解(各1例患者)。
10月25日,Mirati Therapeutics在第32屆國際分子靶標(biāo)與癌癥治療學(xué)研討會(EORTC-NCI-AACR)上發(fā)表了MRTX849(adagrasib)的最新臨床數(shù)據(jù)。MRTX849單藥治療攜帶KRAS G12C突變的晚期/轉(zhuǎn)移性非小細(xì)胞肺癌ORR達(dá)45%,疾病控制率達(dá)96%;單藥治療攜帶KRAS G12C突變的結(jié)直腸癌ORR為17%,疾病控制率為94%。
除了靶向半胱氨酸殘基的特異性抑制劑,其它靶向KRAS(G12C)的方法包括GDP類似物、KRAS(G12C)-GTP:cyclophylin A (CYPA)抑制劑等。這些新興化合物的細(xì)胞效應(yīng)正在評估中,尚不清楚它們是否具有與SIIP抑制劑相同或更好的KRAS抑制作用。
二、臨床開發(fā)
表1 部分處于臨床開發(fā)階段的KRAS(G12C)抑制劑
來源:Cell
據(jù)NextPharma數(shù)據(jù)庫顯示,目前全球有6款KRAS(G12C)抑制劑進(jìn)入臨床開發(fā)階段,除了前文提到的Sotorasib (AMG510)、MRTX849(adagrasib),還包括由基因泰克開發(fā)的GDC6036、 由禮來開發(fā)的LY3499446、由強生和Wellspring Biosciences聯(lián)合開發(fā)的JNJ74699157 (ARS3248)以及由中國新藥研發(fā)公司益方生物開發(fā)的D-1553(NCT04585035)。此外,還有一些項目預(yù)計明年開啟臨床研究。
來源:NextPharma
三、聯(lián)合治療
如圖2所示,KRAS(G12C)抑制劑有多種聯(lián)合治療方向,包括聯(lián)合靶向上游、下游或平行信號通路,以及細(xì)胞周期或免疫檢查點。
圖2 KRAS信號傳導(dǎo)示意圖,以及被報道可調(diào)節(jié)KRAS(G12C)抑制劑的靶向不同中間體的抑制劑(來源:Cell)
共靶向上游信號傳導(dǎo)
如圖1C所示,抑制核苷酸交換可增強KRAS(G12C)停留在失活/藥物敏感狀態(tài),增強KRAS(G12C)抑制劑的療效。由于RTK激活是核苷酸交換的關(guān)鍵刺激,因此,聯(lián)合靶向RTKs被用于增強KRAS(G12C)抑制劑的抗增殖效果。研究顯示,RTK抑制劑直接增加了KRAS(G12C)抑制劑與靶點結(jié)合的能力。
直接抑制RTKs下游的核苷酸交換對提升KRAS(G12C)抑制劑療效也是有效的,如使用SOS1小干擾RNA (siRNAs)或SOS1選擇性抑制劑(如BAY293或BI3406/BI1701963)。
另一種方法是共靶向SHP2,這是一種磷酸酶,參與RTK依賴性SOS1/2激活。多項研究表明,SHP2抑制劑(如RMC4630和TNO155)可增強KRAS(G12C)抑制劑的抗增殖和抗腫瘤作用?;谶@些結(jié)果,評估MRTX849/TNO155或sotorasib/RMC4630聯(lián)合方案療效的臨床試驗即將開展。
共靶向并行信號傳導(dǎo)
盡管在KRAS(G12C)突變細(xì)胞中PI3K、AKT和MTOR的激活機制尚不清楚,但聯(lián)合抑制KRAS(G12C)與PI3K或MTOR的抗腫瘤作用比單獨抑制其中任一靶點都更顯著。此外,同時抑制KRAS(G12C)、IGF1R和MTOR三個靶點也導(dǎo)致了較強的抗腫瘤作用。
共靶向下游信號傳導(dǎo)
靶向RAF二聚體、MEK或ERK是增強KRAS(G12C)抑制劑的一種潛在方法。雖然MEK抑制劑被報道似乎沒有顯著增強ARS1620或MRTX849的效果,但能夠增強sotorasib的抗腫瘤作用。目前,sotorasib+MEK抑制劑的聯(lián)合治療方案正在臨床試驗中進(jìn)行測試。來自該試驗的數(shù)據(jù)將為共靶向RAF/MEK/ERK信號級聯(lián)和KRAS(G12C)能否帶來益處提供關(guān)鍵證據(jù)。
共靶向細(xì)胞周期檢查點
KRAS信號傳導(dǎo)的一個關(guān)鍵輸出是CyclinD:CDK4/6的激活。用palbociclib靶向CDK4/6來最大化細(xì)胞周期阻滯可增強KRAS(G12C)抑制劑的療效。
共靶向免疫檢查點
KRAS信號傳導(dǎo)對腫瘤微環(huán)境具有免疫抑制作用。因此,KRAS(G12C)抑制可能會增強免疫檢查點抑制的療效。已有研究證實,當(dāng)與PD-1抗體聯(lián)合時,sotorasib導(dǎo)致了持久的抗腫瘤作用。相關(guān)臨床試驗正在進(jìn)行中。不過,未來還需要做更多的工作來了解KRAS(G12C)是如何導(dǎo)致免疫抑制的。
四、小結(jié)
在過去7年里,KRAS藥物研發(fā)取得了巨大的進(jìn)步。研究者們認(rèn)為,考慮到KRAS靶向藥物研發(fā)先前遭遇的幾十年的瓶頸以及KRAS突變在癌癥患者中的普遍性,期待KRAS(G12C)選擇性抑制劑的發(fā)現(xiàn)和臨床開發(fā)能夠開辟腫瘤精準(zhǔn)治療的新時代。
參考資料:
[1] Dongsung Kim et al. Targeting KRAS(G12C): From Inhibitory Mechanism to Modulation of Antitumor Effects in Patients. Cell(2020).
來源: 醫(yī)藥魔方


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