無義介導的RNA降解（Nonsense-mediated decay, NMD）是真核生物一種重要的mRNA質(zhì)量控制方式，細胞通過檢驗終止密碼子與最后一個剪接接頭的距離是否超過55nt來判斷該終止密碼子是否為提前終止密碼子（Premature Termination Codon, PTC）從而決定是否降解該RNA。因此經(jīng)典的NMD通路是一種RNA剪接依賴的機制。假基因是一種失去了蛋白編碼能力或者表達能力的基因，通常由基因重復產(chǎn)生，基因組上的DNA重復可以形成非加工型假基因，而逆轉(zhuǎn)錄形成的基因重復會形成加工型假基因。假基因容易形成截短的蛋白產(chǎn)生細胞毒性，因此假基因的活性通常受到抑制。由于假基因通常含有PTC, 因此大量的非加工型假基因可以通過NMD的方式降解。然而，加工型假基因由于缺少內(nèi)含子而不能通過NMD的機制降解，那么加工型的假基因是否進化出其他的方式來進行降解并不清楚。近日，中山大學王金凱教授課題組在Genome Biology雜志發(fā)表題為“Positive natural selection of N6-methyladenosine on the RNAs of processed pseudogenes”論文揭示加工型假基因在進化過程中在達爾文正向選擇的驅(qū)動下快速積累產(chǎn)生m6A motif 的突變，從而造成加工型假基因的m6A水平顯著高于同源的蛋白編碼基因，進化出利用m6A降解加工型假基因的方式。這些進化出的m6A位點對于降解加工型假基因防止其通過ceRNA的機制干擾同源蛋白編碼基因的表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)發(fā)揮了重要作用。該論文的第一作者為王金凱教授課題組的兩名博士研究生譚利強和程維晟同學。這項工作揭示了m6A RNA修飾的新的進化意義，即通過降解加工型假基因來緩解加工型假基因?qū)ν吹鞍拙幋a基因表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的干擾，為進一步揭示假基因的m6A修飾在人類疾病中的作用和機理奠定了基礎(chǔ)。該工作得到了國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學基金和廣州市科技計劃的支持。?E N D?論文原文鏈接為：https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-021-02402-2來源：中山醫(yī)學院
