目前，超強新冠病毒變異株Omicron（B.1.1.529）在全球快速蔓延，為疫情防控監(jiān)測系統(tǒng)帶來了巨大挑戰(zhàn)。華大智造ATOPlex V3.0試劑盒能夠穩(wěn)定地制備覆蓋毒株全長序列的測序文庫，搭配DNB測序和分析系統(tǒng)即可分型所有流行毒株。從Alpha到Omicron，只需一套建庫試劑，就可針對新型毒株提供簡單有效的監(jiān)測。
讓Omicron變異株無處潛逃！一次擴增，雙重覆蓋！華大智造ATOPlex V3.0 + DNBSEQ測序平臺聯(lián)合出擊-肽度TIMEDOO
南非一個傳染病救治點的醫(yī)護人員正因新冠病毒變異株的傳播忙碌
（來源/Alet Pretorius/Gallo Images/Getty）

超強毒株來襲 挑戰(zhàn)疫情監(jiān)測系統(tǒng)

截止日前，新冠疫情造成超過2.6億人感染，超500萬人死亡。WHO發(fā)布的數(shù)據(jù)顯示，世界疫情已經(jīng)經(jīng)歷了三波高峰。11月11日，就在全球普遍認為第三波疫情持續(xù)放緩之時，最新變異毒株B.1.1.529超越正在流行的優(yōu)勢株Delta毒株，成為了最新的強勢毒株，該毒株被WHO命名為Omicron。根據(jù)Nextclade最新的數(shù)據(jù)，Omicron變異株包含61個氨基酸突變，對應(yīng)到核酸序列上有50個新型變異，包括6個缺失突變和44個堿基替換突變（https://covariants.org/variants/21K.Omicron）。其中，刺突蛋白上有30多個突變，包括關(guān)鍵部位ACE2受體RBD區(qū)域的10個突變，很可能影響到現(xiàn)有疫苗的療效。
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Omicron變異株的突變分布圖
（來源/斯坦福大學(xué)冠狀病毒抗病毒與耐藥數(shù)據(jù)庫）
目前，基于多重PCR的測序技術(shù)是新冠毒株監(jiān)測的主流技術(shù)，從Alpha到Beta，到Delta，再到最新的Omicron，新冠病毒不斷變異，每次變異都給以PCR技術(shù)為基礎(chǔ)的測序監(jiān)測技術(shù)帶來了巨大的挑戰(zhàn)。

ATOPlex V3.0實現(xiàn)雙重覆蓋全長基因組，從容應(yīng)對毒株變異

基于多重PCR核心技術(shù)，華大智造ATOPlex平臺推出V3.0版建庫試劑盒應(yīng)對疫情挑戰(zhàn)。ATOPlex V3.0試劑盒采用雙保險引物設(shè)計，在一次實驗中同時對病毒基因組進行2次擴增，任意一管都可以擴增出接近新冠全長序列，有效降低由于病毒突變帶來的失敗風(fēng)險。
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ATOPlex V3.0工作原理
如上圖所示，Pool1和Pool2兩套不同引物池分別擴增一個完整的新冠全基因組，從而有效降低由于毒株突變帶來的引物擴增失敗的風(fēng)險，為持續(xù)有效地檢測新型未知突變株提供有力保障。
華大智造在第一時間拿到Omicron序列后就完成了對ATOPlex試劑盒的溯源性能評估，ATOPlex V3.0建庫試劑盒聯(lián)合DNBSEQ測序系統(tǒng)能夠有效對Omicron毒株進行分析，基因組覆蓋度超過99.2%，在鑒定新型突變的同時獲取完整基因組序列。
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ATOPlex?V3.0設(shè)備屬性
華大智造從疫情初期開始，就一直致力于為疫情監(jiān)測系統(tǒng)提供最新、最優(yōu)的工具，并幫助多個城市和地區(qū)在第一時間確認新冠變異毒株的分型，如Alpha、Delta等。11月29日，華大智造幫助瑞典公共衛(wèi)生局合作的卡羅林斯卡醫(yī)學(xué)院國家疫情中心完成首例Omicron的監(jiān)測。

ATOPlex V3.0聯(lián)合DNBSEQ測序和分析系統(tǒng)，快速應(yīng)對疫情監(jiān)測

ATOPlex V3.0聯(lián)合DNBSEQ測序系統(tǒng)，在18小時內(nèi)就能完成毒株全基因組組裝和分型工作，幫助公共衛(wèi)生監(jiān)測系統(tǒng)快速、持續(xù)地對新冠變異情況進行跟蹤。
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華大智造抗疫產(chǎn)品
華大智造密切關(guān)注新冠突變情況，自疫情暴發(fā)初期開始，就通過核心產(chǎn)品基因測序儀和自動化設(shè)備為全球70余個國家疫情防控提供工具支撐。隨著疫情的不斷變化，華大智造將持續(xù)更新和優(yōu)化包括建庫測序系統(tǒng)在內(nèi)的產(chǎn)品及平臺，為新型突變和疫情監(jiān)測提供更有力的工具保障，助力全球抗疫！