一、培訓班上課內容

上課內容涵蓋“基因組學—蛋白質組學—系統(tǒng)生物學”的研究方法、技術思路、前沿進展及其在各生物學科中的應用。

核心課程包括：

1. 基因組的比較研究、DNA測序技術原理與進展（于軍 教授）

2. 轉錄組的測定與分析、大規(guī)模測序方法及應用、微生物基因組學、基因組學與精準醫(yī)學（胡松年教授）

3. 系統(tǒng)生物學導論及高通量分析技術應用（楊軍?教授）

4. 系統(tǒng)生物學建模分析（陳銘?教授）

5. 蛋白質組學概論及應用 （鐘伯雄?教授）

6. 基因組學在醫(yī)學中的應用（祁鳴?教授）

7. 表觀遺傳學新技術與研究熱點（谷紅倉?研究員）

二、培訓班上機內容

本研習班上機實習課采用 “跟我學”方式，學習實踐各類基礎生物信息學軟件，每人一臺PC機跟著大屏幕一步步學會基因組、蛋白質組學數(shù)據(jù)分析的基本方法。

主要內容如下：

實習一：基因組數(shù)據(jù)注釋和功能分析

通過序列比對工具BLAST的學習，了解基因功能注釋的原理；介紹多序列聯(lián)配工具ClustalX及分子進化分析軟件MEGA4，掌握系統(tǒng)發(fā)生樹繪制的基本方法，認識基因復制在進化上的功能；學習基因序列分析常用的數(shù)據(jù)庫和軟件。

實習二：轉錄組數(shù)據(jù)分析

介紹轉錄組數(shù)據(jù)分析的基本流程及其原理；通過對tophat、cufflinks、R等轉錄組數(shù)據(jù)分析工具的介紹及演示，了解基于二代測序數(shù)據(jù)的轉錄組分析流程及常用分析方法；利用kegg、GOstat、DAVID等在線工具挖掘轉錄組數(shù)據(jù)的生物學意義。

實習三：蛋白質結構與功能分析

從數(shù)據(jù)庫搜索感興趣的蛋白質氨基酸序列開始，接著對蛋白質基本理化性質、二級結構、和三維空間結構和序列模體進行分析，預測目標蛋白的生物功能。

實習四：蛋白質組學數(shù)據(jù)分析

使用X！Tandem、Mascot、Sequest等軟件鑒定蛋白質質譜數(shù)據(jù)，將質譜結果匹配到蛋白質組數(shù)據(jù)庫鑒定蛋白；使用TPP軟件包進行統(tǒng)計學分析和優(yōu)化檢索結果練習。

實習五：系統(tǒng)生物學軟件實習—–網(wǎng)絡結構顯示與分析

利用Cytoscape系統(tǒng)生物學分析軟件，分析蛋白－蛋白相互作用，展示分子網(wǎng)絡系統(tǒng)，并與基因表達等數(shù)據(jù)整合。?

三、培訓對象

1. 無生物信息學背景，希望了解生物信息學的學員；

2. 計劃開展各類組學研究的科研人員；

3. 已有組學數(shù)據(jù)需了解分析方法的研究人員；

4. 有志從事生物信息學相關工作的學生或者技術人員。

四、證書發(fā)放

五、收費標準

4200/人（含教材，轉賬、刷卡、支付寶）

戶 ? ?名：浙江大學

帳 ? ?號：19042201040000014

開戶銀行：農行杭州市浙大支行紫金港分理處 ?（匯單上務必寫上：培訓上機號）

培訓發(fā)票由浙江大學計財處開具電子票據(jù)。

住宿可統(tǒng)一安排，費用自理。

聯(lián) 系 人：沈志成

0571-88206783 ?13958194424（微信同號）

電子郵箱：genetrain@zju.edu.cn

因本課程天數(shù)較多，報名學員因故缺席部分課程，可聯(lián)系會務組在后續(xù)培訓班中免費旁聽。

六、注冊報名

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