2022年3月9-11日|生物大數(shù)據(jù)時代的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究模式學(xué)習(xí)班
人工智能以及云計(jì)算技術(shù)的快速發(fā)展,精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)在生命科學(xué)領(lǐng)域的作用越來越明顯。在人工智能的潮流中,中醫(yī)藥也迎來了新的發(fā)展契機(jī)。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是人工智能和大數(shù)據(jù)時代藥物系統(tǒng)性研究的新興、交叉、前沿學(xué)科,強(qiáng)調(diào)從系統(tǒng)層次和生物網(wǎng)絡(luò)的整體角度出發(fā),解析藥物及治療對象之間的分子關(guān)聯(lián)規(guī)律,被廣泛應(yīng)用于藥物和中藥活性化合物發(fā)現(xiàn)、整體作用機(jī)制闡釋、藥物組合和方劑配伍規(guī)律解析等方面,為中藥復(fù)雜體系研究提供了新思路,為臨床合理用藥、新藥研發(fā)等提供了新的科技支撐。
在大數(shù)據(jù)背景下,隨著網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的影響力和應(yīng)用日益廣泛,網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在理論分析、算法發(fā)展和實(shí)際應(yīng)用等方面,面臨著重要的發(fā)展機(jī)遇和挑戰(zhàn)。整合臨床、實(shí)驗(yàn)的海量數(shù)據(jù),結(jié)合科學(xué)驗(yàn)證,揭示藥物對疾病的調(diào)控機(jī)制,是網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究的主要任務(wù)。
中醫(yī)藥是中華民族的寶貴財(cái)富,在疾病防治方面具有獨(dú)特的優(yōu)勢。中醫(yī)整體觀與以網(wǎng)絡(luò)和系統(tǒng)為特征的新一代醫(yī)學(xué)研究范式相吻合。中醫(yī)提出了一種全新的“網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)”方法,即網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的核心理論和方法。中醫(yī)也是網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的一個重要研究對象。中醫(yī)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),旨在了解復(fù)雜疾病、中醫(yī)證候和中藥治療的網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)基礎(chǔ),在網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的起源和發(fā)展過程中起著至關(guān)重要的作用。
為更好地了解網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的新進(jìn)展,包括預(yù)測中藥靶標(biāo),了解疾病和證候的生物學(xué)基礎(chǔ),中藥方劑的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)制,以及基于生物網(wǎng)絡(luò)的疾病和證候標(biāo)志物的識別。這些研究呈現(xiàn)出計(jì)算、實(shí)驗(yàn)和臨床相結(jié)合的趨勢,是未來中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究的一個很有前途的方向。我中心生物計(jì)算事業(yè)部特舉辦“生物大數(shù)據(jù)時代的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究模式研討班”。培訓(xùn)班由我中心的一線分析工程師授課,通過技術(shù)講座結(jié)合實(shí)驗(yàn)操作,展示應(yīng)用實(shí)例,現(xiàn)場解答技術(shù)疑問,幫助學(xué)員拓展研究思路,提升科研水平和競爭力。
授課對象:生物信息學(xué)學(xué)員,高校生物、藥學(xué)相關(guān)專業(yè)教師、學(xué)生,醫(yī)學(xué)科研人員,醫(yī)院從業(yè)人員,生物專業(yè)相關(guān)從業(yè)人員
電腦要求:64位windows10操作系統(tǒng),運(yùn)行日常程序流暢。
主辦單位:北京市計(jì)算中心有限公司
協(xié)辦單位:
北京市基因測序與功能分析工程技術(shù)研究中心
云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地
北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實(shí)踐基地
舉 辦 地:北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓
課程安排:2022.3.9–11(周三–周五)上午9:30-11:30 ??下午13:30-17:00
時間 | 主題 | 授課內(nèi)容 | 備注 |
第一天 | 主題1:網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究思路 | 1、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的發(fā)展歷程和研究現(xiàn)狀簡介 2、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)SCI論文研讀分析 3、網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究思路及技術(shù)路線 |
理論 |
第一天 | 主題2:網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的數(shù)據(jù)來源 | 4、中藥有效成分查找和獲取 (1)常用中藥數(shù)據(jù)及使用:TCMID、YaTCM、TCMSP (2)小分子化合物結(jié)構(gòu)信息查詢:Pubchem、Drugbank 5、中藥所治療疾病的相關(guān)基因查找和獲取 (1)人類疾病與基因遺傳變異數(shù)據(jù)庫:OMIM (2)疾病相關(guān)的基因與突變位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫DisGeNet (3)人類基因數(shù)據(jù)庫:Genecards (4)治療靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫:TTD 6、中藥有效成分靶點(diǎn)的查詢及獲取 (1)中藥有效成分靶點(diǎn)的預(yù)測:SwissTargetPrediction (2)基于有效成分結(jié)構(gòu)特征靶點(diǎn)預(yù)測:PharmMapper (3)蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫及結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的篩選和獲取:PDB (4)中藥有效成分靶點(diǎn)的獲取:反向虛擬篩選方法 |
理論+實(shí)操 |
第二天 | 主題3:網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)數(shù)據(jù)整理及分析 | 7、中藥分子機(jī)制研究的在線生物信息學(xué)分析工具: BATMAN-TCM 8、中藥高通量實(shí)驗(yàn)和參考數(shù)據(jù)庫:Herb 9、中醫(yī)藥證候關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫:SymMap 10、細(xì)胞代謝及信號傳導(dǎo)通路數(shù)據(jù)庫:KEGG 11、蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)查詢和可視化分析:STRING 12、化合物與蛋白質(zhì)互作:STITCH 13、富集分析數(shù)據(jù)庫:DAVID 14、基因/蛋白質(zhì)功能注釋和功能集富集分析:?Kobas數(shù)據(jù)庫 |
理論+實(shí)操 |
第三天 | 主題4.網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)數(shù)據(jù)可視化 | 15、網(wǎng)絡(luò)分析軟件:Cytoscape (1)分析數(shù)據(jù)導(dǎo)入與導(dǎo)出 (2)基本拓?fù)涮卣饔?jì)算 (3)重要節(jié)點(diǎn)識別 (4)網(wǎng)絡(luò)拓?fù)渲笜?biāo)含義 (5)子網(wǎng)絡(luò)提取 (6)網(wǎng)絡(luò)可視化 (7)圖形導(dǎo)出 (8)Cytoscape插件的安裝和使用 |
理論+實(shí)操 |
第三天 | 主題4.網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)數(shù)據(jù)可視化 | 16、綜合性分析軟件:IPA (1)基于IPA經(jīng)典通路分析 (2)基于IPA疾病與功能分析 (3)基于IPA生物分子網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 (4)基于IPA的因果網(wǎng)絡(luò)分析 17、分子對接及相互作用分析 (1)對接軟件的介紹及安裝 (2)小分子和蛋白結(jié)構(gòu)文件的預(yù)處理 (3)蛋白活性位點(diǎn)的確定 (4)分子對接流程的介紹及實(shí)操 (6)分子對接結(jié)果相互作用分析及可視化 |
理論+實(shí)操 |
注:內(nèi)容以實(shí)際發(fā)生為準(zhǔn);若調(diào),會提前通知。
【報(bào)名費(fèi)用】
注冊費(fèi):4200元/人(含當(dāng)期聽課費(fèi)、資料費(fèi)、證書費(fèi)、考試費(fèi)(如有))。培訓(xùn)期間,食宿自理。
提供當(dāng)期視頻回放以供復(fù)習(xí)使用(羽林學(xué)院平臺)。
開具增值稅發(fā)票,提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書等相關(guān)材料。
【報(bào)名優(yōu)惠政策】
1、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少300元;
2、4+1團(tuán)報(bào),可免費(fèi)贈送一個名額;
3、上面優(yōu)惠政策不能同時享受,只能享受其中一種;
老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。
培訓(xùn)以收到學(xué)員培訓(xùn)費(fèi)為成功報(bào)名,培訓(xùn)座位按收到費(fèi)用先后順序安排。
【付費(fèi)方式】
現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款、現(xiàn)場刷卡
單位全稱:北京市計(jì)算中心有限公司
賬號:0200151819100023937
開戶銀行:中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行
(匯款信息備注:“生物計(jì)算——您的姓名”,個人匯款請備注單位名稱)
注:款項(xiàng)支出后,請?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員,方便核實(shí)到賬、開具發(fā)票。
【咨詢請聯(lián)系】
QQ號:659230635
微信號:vicolee2021


本文系作者 @TIMEDOO 原創(chuàng)發(fā)布在 肽度TIMEDOO。未經(jīng)許可,禁止轉(zhuǎn)載。