2022年3月2-4日|基因組關(guān)聯(lián)分析技術(shù)應(yīng)用培訓(xùn)班

3年前發(fā)布在 培訓(xùn)班

隨著測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，產(chǎn)生了海量的基因型數(shù)據(jù)，然而如何將基因型與表型進(jìn)行關(guān)聯(lián)，從而定位復(fù)雜疾病風(fēng)險(xiǎn)基因或農(nóng)業(yè)動(dòng)植物重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的遺傳變異卻是一項(xiàng)巨大挑戰(zhàn)。在過(guò)去的十年間，借助全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS），科研人員發(fā)掘了大量與人類(lèi)復(fù)雜疾病和農(nóng)業(yè)動(dòng)植物重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的遺傳變異。

北我中心生物計(jì)算事業(yè)部，在基因組關(guān)聯(lián)分析領(lǐng)域具有豐富經(jīng)驗(yàn)，發(fā)表多篇領(lǐng)域頂級(jí)雜志。針對(duì)具備一定統(tǒng)計(jì)學(xué)、遺傳學(xué)、分子生物學(xué)基礎(chǔ)的生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域研究人員，特開(kāi)設(shè)基因組關(guān)聯(lián)分析培訓(xùn)班。

培訓(xùn)特色：

無(wú)需任何計(jì)算機(jī)語(yǔ)言基礎(chǔ)；

深入淺出，內(nèi)容精要實(shí)用；

結(jié)合人類(lèi)醫(yī)學(xué)、動(dòng)植物育種等生物學(xué)數(shù)據(jù)背景知識(shí)與實(shí)例講授；

統(tǒng)計(jì)學(xué)原理+模型/算法+編程實(shí)現(xiàn)+生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用；

授課老師經(jīng)驗(yàn)豐富，邊學(xué)邊練，重實(shí)踐，力求實(shí)效；

小班授課，個(gè)別輔導(dǎo)。

主辦單位：北京市計(jì)算中心有限公司

協(xié)辦單位：

北京市基因測(cè)序與功能分析工程技術(shù)研究中心

云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地

北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實(shí)踐基地

舉辦地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)北科產(chǎn)業(yè)3號(hào)樓

課程安排：2022年3月2-4日（周三-周五） ?上午9:30-11:30 ?下午13:30-17:00

日期	題目	內(nèi)容	備注
第一天	基因組關(guān)聯(lián)分析理論基礎(chǔ)	1、基因組學(xué)與生物信息學(xué)概述 2、基于群體遺傳的數(shù)據(jù)獲取 3、基因組關(guān)聯(lián)分析的原理、數(shù)模、策略及常用軟件介紹 4、常用GWAS數(shù)據(jù)庫(kù)介紹	理論+ 操作（上機(jī)）
	GWAS計(jì)算機(jī)基礎(chǔ)	1、Linux基礎(chǔ)for GWAS 2、R基礎(chǔ)for GWAS
	Plink軟件基礎(chǔ)應(yīng)用	1、Plink軟件應(yīng)用 2、Plink文件格式生成與解析 3、等位基因頻率計(jì)算 4、哈-溫平衡計(jì)算 5、基因組關(guān)聯(lián)分析流程 6、關(guān)聯(lián)分析結(jié)果分析與p校正
第二天	基因型填充Imputation	1、基因型填充Imputation的原理及應(yīng)用 2、基因型填充軟件介紹與應(yīng)用 3、基因組填充的方法與分析流程 4、1000G數(shù)據(jù)應(yīng)用	理論+ 操作（上機(jī)）
第二天	關(guān)聯(lián)分析應(yīng)用	1、基于家系的關(guān)聯(lián)分析 2、曼哈頓圖的繪制與結(jié)果展示 3、實(shí)操for Plink	理論+ 操作（上機(jī)）
第三天	關(guān)聯(lián)分析應(yīng)用	1、單倍型介紹 2、單倍型分析 3、LD連鎖不平衡指數(shù)計(jì)算 4、實(shí)操 5、Tassel軟件介紹	理論+ 操作（上機(jī)）