2022年3月2-4日|基因組關聯(lián)分析技術應用培訓班
隨著測序技術的發(fā)展,產生了海量的基因型數(shù)據(jù),然而如何將基因型與表型進行關聯(lián),從而定位復雜疾病風險基因或農業(yè)動植物重要經濟性狀相關的遺傳變異卻是一項巨大挑戰(zhàn)。在過去的十年間,借助全基因組關聯(lián)分析(GWAS),科研人員發(fā)掘了大量與人類復雜疾病和農業(yè)動植物重要經濟性狀相關的遺傳變異。
北我中心生物計算事業(yè)部,在基因組關聯(lián)分析領域具有豐富經驗,發(fā)表多篇領域頂級雜志。針對具備一定統(tǒng)計學、遺傳學、分子生物學基礎的生物醫(yī)學領域研究人員,特開設基因組關聯(lián)分析培訓班。
培訓特色:
無需任何計算機語言基礎;
深入淺出,內容精要實用;
結合人類醫(yī)學、動植物育種等生物學數(shù)據(jù)背景知識與實例講授;
統(tǒng)計學原理+模型/算法+編程實現(xiàn)+生物醫(yī)學應用;
授課老師經驗豐富,邊學邊練,重實踐,力求實效;
小班授課,個別輔導。
主辦單位:北京市計算中心有限公司
協(xié)辦單位:
北京市基因測序與功能分析工程技術研究中心
云計算關鍵技術與應用北京市重點實驗室
工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓基地
北京市大數(shù)據(jù)教學實踐基地
舉 辦 地:北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產業(yè)3號樓
課程安排:2022年3月2-4日(周三-周五) ?上午9:30-11:30 ?下午13:30-17:00
日期 | 題目 | 內容 | 備注 |
第一天 | 基因組關聯(lián)分析理論基礎 | 1、基因組學與生物信息學概述
2、基于群體遺傳的數(shù)據(jù)獲取 3、基因組關聯(lián)分析的原理、數(shù)模、策略及常用軟件介紹 4、常用GWAS數(shù)據(jù)庫介紹 |
理論+
操作(上機) |
GWAS計算機基礎 | 1、Linux基礎for GWAS
2、R基礎for GWAS |
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Plink軟件基礎應用 | 1、Plink軟件應用
2、Plink文件格式生成與解析 3、等位基因頻率計算 4、哈-溫平衡計算 5、基因組關聯(lián)分析流程 6、關聯(lián)分析結果分析與p校正 |
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第二天 | 基因型填充Imputation | 1、基因型填充Imputation的原理及應用
2、基因型填充軟件介紹與應用 3、基因組填充的方法與分析流程 4、1000G數(shù)據(jù)應用 |
理論+
操作(上機) |
關聯(lián)分析應用 | 1、基于家系的關聯(lián)分析
2、曼哈頓圖的繪制與結果展示 3、實操for Plink |
理論+
操作(上機) |
|
第三天 | 關聯(lián)分析應用 | 1、單倍型介紹
2、單倍型分析 3、LD連鎖不平衡指數(shù)計算 4、實操 5、Tassel軟件介紹 |
理論+
操作(上機) |
注:內容以實際發(fā)生為準;若調,會提前通知。
【報名費用】
注冊費:4200元/人(含當期聽課費、資料費、證書費、考試費(如有))。培訓期間,食宿自理。
提供當期視頻回放以供復習使用(羽林學院平臺)。
開具增值稅發(fā)票,提供蓋章通知、結業(yè)證書等相關材料。
【報名優(yōu)惠政策】
1、3人以上團體報名每人可減少300元;
2、4+1團報,可免費贈送一個名額;
3、上面優(yōu)惠政策不能同時享受,只能享受其中一種;
老學員參加及推薦學員參加均可額外優(yōu)惠200元。
培訓以收到學員培訓費為成功報名,培訓座位按收到費用先后順序安排。
【付費方式】
現(xiàn)金、支票、銀行轉賬、銀行匯款、現(xiàn)場刷卡
單位全稱:北京市計算中心有限公司
賬號:0200151819100023937
開戶銀行:中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行
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注:款項支出后,請?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員,方便核實到賬、開具發(fā)票。
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