近年來，隨著高通量測序技術(shù)的迅猛發(fā)展，轉(zhuǎn)錄組研究從以前的微陣列技術(shù)，SAGE及MPSS技術(shù)的低通量模式切換至RNA-seq的高通量模式。轉(zhuǎn)錄組學(xué)作為一個(gè)伴隨高通量測序技術(shù)率先發(fā)展起來的技術(shù)開始在生物學(xué)前沿研究中得到了廣泛的應(yīng)用。RNA-seq對于真核生物的基因表達(dá)調(diào)控，癌癥等疾病的發(fā)生機(jī)制和新治療方案確定，遺傳育種等眾多方面的研究具有不可估量的潛力。為了輔助廣大科研工作者掌握轉(zhuǎn)錄組高通量測序技術(shù)原理、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)以及后期數(shù)據(jù)分析技能，舉辦“轉(zhuǎn)錄組學(xué)”專題實(shí)戰(zhàn)班。歡迎報(bào)名參加。

主辦單位：北京市計(jì)算中心有限公司

協(xié)辦單位：

北京市基因測序與功能分析工程技術(shù)研究中心

云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地

北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實(shí)踐基地

舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓

課程安排：2022年4月12-14日（周二-周四）?上午9:30-11:30 下午13:30-17:00

時(shí)間 主題 授課內(nèi)容 備注
第一天 轉(zhuǎn)錄組學(xué)前沿概述及測序原理 1、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展前沿動態(tài)
2、轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例及應(yīng)用熱點(diǎn)
3、常用的轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測序建庫技術(shù)
4、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)
5、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程及技術(shù)細(xì)節(jié)；		 理論
Linux服務(wù)器使用入門 6、掌握Linux系統(tǒng)下的常用命令（重點(diǎn)講解）
7、掌握linux環(huán)境下軟件的安裝使用
8、了解shell腳本的編寫		 實(shí)操
第二天 轉(zhuǎn)錄組分析方法 9、差異表達(dá)基因的功能分析（重點(diǎn)講解） 理論
De novo轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析上機(jī)實(shí)踐 10、原始測序數(shù)據(jù)的檢測和預(yù)處理（重點(diǎn)講解）
11、使用Trinity拼接轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)（重點(diǎn)講解）
12、原始數(shù)據(jù)與拼接轉(zhuǎn)錄本的比對（重點(diǎn)講解）
13、表達(dá)量統(tǒng)計(jì)和差異表達(dá)分析（重點(diǎn)講解）
14、使用blast對轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行功能注釋（重點(diǎn)講解）
15、尋找轉(zhuǎn)錄本的ORF，翻譯蛋白質(zhì)序列
16、轉(zhuǎn)錄因子注釋		 實(shí)操
Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
上機(jī)實(shí)踐（一）		 17、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和軟件介紹
18、使用HISAT進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對（重點(diǎn)講解）
19、用IGV查看比對結(jié)果
20、使用cufflinks進(jìn)行表達(dá)量估計(jì)和分析（重點(diǎn)講解）
21、使用samtools檢測轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的突變（重點(diǎn)講解）		 實(shí)操
第三天 Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 22、lncRNA的定義、應(yīng)用和發(fā)展；
23、lncRNA的生物學(xué)過程；
24、lncRNA研究的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測序原理；
25、lncRNA測序分析結(jié)果解讀；		 理論
Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
上機(jī)實(shí)踐（二）		 26、利用tophat和cufflinks組合，預(yù)測轉(zhuǎn)錄本
27、使用CNCI預(yù)測新的lncRNA轉(zhuǎn)錄本（重點(diǎn)講解）
28、使用LncTar軟件預(yù)測lncRNA調(diào)控的靶基因（重點(diǎn)講解）		 理論+
實(shí)操
microRNA測序與數(shù)據(jù)分析 29、microRNA的定義、應(yīng)用和發(fā)展；
30、microRNA的生物學(xué)過程；
31、microRNA研究的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測序原理；		 理論
microRNA測序與數(shù)據(jù)分析（包含上機(jī)實(shí)踐） 32、microRNA測序數(shù)據(jù)分析軟件（重點(diǎn)講解）
33、microRNA測序數(shù)據(jù)預(yù)處理（重點(diǎn)講解）
34、microRNA的預(yù)測（重點(diǎn)講解）
35、microRNA靶標(biāo)基因預(yù)測，結(jié)果提取、統(tǒng)計(jì)（重點(diǎn)講解）		 理論+
實(shí)操

注：課程以實(shí)際發(fā)生為準(zhǔn)；若調(diào)，會提前通知。

【報(bào)名費(fèi)用】

注冊費(fèi)：4200元/人（含當(dāng)期聽課費(fèi)、資料費(fèi)、證書費(fèi)、考試費(fèi)（如有））。培訓(xùn)期間，食宿自理。

提供當(dāng)期視頻回放以供復(fù)習(xí)使用（羽林學(xué)院平臺）。

開具增值稅發(fā)票，提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書等相關(guān)材料。

【報(bào)名優(yōu)惠政策】

1、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少300元；

2、4+1團(tuán)報(bào)，可免費(fèi)贈送一個(gè)名額；

3、上面優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受，只能享受其中一種；

老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。

培訓(xùn)以收到學(xué)員培訓(xùn)費(fèi)為成功報(bào)名，培訓(xùn)座位按收到費(fèi)用先后順序安排。

【付費(fèi)方式】

現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款、現(xiàn)場刷卡

單位全稱：北京市計(jì)算中心有限公司

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（匯款信息備注：“生物計(jì)算——您的姓名”,個(gè)人匯款請備注單位名稱）

注：款項(xiàng)支出后，請?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員，方便核實(shí)到賬、開具發(fā)票。

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