近年來(lái)，隨著高通量測(cè)序技術(shù)的迅猛發(fā)展，轉(zhuǎn)錄組研究從以前的微陣列技術(shù)，SAGE及MPSS技術(shù)的低通量模式切換至RNA-seq的高通量模式。轉(zhuǎn)錄組學(xué)作為一個(gè)伴隨高通量測(cè)序技術(shù)率先發(fā)展起來(lái)的技術(shù)開(kāi)始在生物學(xué)前沿研究中得到了廣泛的應(yīng)用。RNA-seq對(duì)于真核生物的基因表達(dá)調(diào)控，癌癥等疾病的發(fā)生機(jī)制和新治療方案確定，遺傳育種等眾多方面的研究具有不可估量的潛力。為了輔助廣大科研工作者掌握轉(zhuǎn)錄組高通量測(cè)序技術(shù)原理、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)以及后期數(shù)據(jù)分析技能，舉辦“轉(zhuǎn)錄組學(xué)”專(zhuān)題實(shí)戰(zhàn)班。歡迎報(bào)名參加。

主辦單位：北京市計(jì)算中心有限公司

協(xié)辦單位：

北京市基因測(cè)序與功能分析工程技術(shù)研究中心

云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地

北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實(shí)踐基地

舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)北科產(chǎn)業(yè)3號(hào)樓

課程安排：2022年4月12-14日（周二-周四）?上午9:30-11:30 下午13:30-17:00

時(shí)間 主題 授課內(nèi)容 備注
第一天 轉(zhuǎn)錄組學(xué)前沿概述及測(cè)序原理 1、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)發(fā)展前沿動(dòng)態(tài)
2、轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用案例及應(yīng)用熱點(diǎn)
3、常用的轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測(cè)序建庫(kù)技術(shù)
4、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)
5、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)流程及技術(shù)細(xì)節(jié)；		 理論
Linux服務(wù)器使用入門(mén) 6、掌握Linux系統(tǒng)下的常用命令（重點(diǎn)講解）
7、掌握l(shuí)inux環(huán)境下軟件的安裝使用
8、了解shell腳本的編寫(xiě)		 實(shí)操
第二天 轉(zhuǎn)錄組分析方法 9、差異表達(dá)基因的功能分析（重點(diǎn)講解） 理論
De novo轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析上機(jī)實(shí)踐 10、原始測(cè)序數(shù)據(jù)的檢測(cè)和預(yù)處理（重點(diǎn)講解）
11、使用Trinity拼接轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)（重點(diǎn)講解）
12、原始數(shù)據(jù)與拼接轉(zhuǎn)錄本的比對(duì)（重點(diǎn)講解）
13、表達(dá)量統(tǒng)計(jì)和差異表達(dá)分析（重點(diǎn)講解）
14、使用blast對(duì)轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行功能注釋?zhuān)ㄖ攸c(diǎn)講解）
15、尋找轉(zhuǎn)錄本的ORF，翻譯蛋白質(zhì)序列
16、轉(zhuǎn)錄因子注釋		 實(shí)操
Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
上機(jī)實(shí)踐（一）		 17、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和軟件介紹
18、使用HISAT進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比對(duì)（重點(diǎn)講解）
19、用IGV查看比對(duì)結(jié)果
20、使用cufflinks進(jìn)行表達(dá)量估計(jì)和分析（重點(diǎn)講解）
21、使用samtools檢測(cè)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的突變（重點(diǎn)講解）		 實(shí)操
第三天 Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析 22、lncRNA的定義、應(yīng)用和發(fā)展；
23、lncRNA的生物學(xué)過(guò)程；
24、lncRNA研究的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測(cè)序原理；
25、lncRNA測(cè)序分析結(jié)果解讀；		 理論
Reference based轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
上機(jī)實(shí)踐（二）		 26、利用tophat和cufflinks組合，預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)錄本
27、使用CNCI預(yù)測(cè)新的lncRNA轉(zhuǎn)錄本（重點(diǎn)講解）
28、使用LncTar軟件預(yù)測(cè)lncRNA調(diào)控的靶基因（重點(diǎn)講解）		 理論+
實(shí)操
microRNA測(cè)序與數(shù)據(jù)分析 29、microRNA的定義、應(yīng)用和發(fā)展；
30、microRNA的生物學(xué)過(guò)程；
31、microRNA研究的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測(cè)序原理；		 理論
microRNA測(cè)序與數(shù)據(jù)分析（包含上機(jī)實(shí)踐） 32、microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析軟件（重點(diǎn)講解）
33、microRNA測(cè)序數(shù)據(jù)預(yù)處理（重點(diǎn)講解）
34、microRNA的預(yù)測(cè)（重點(diǎn)講解）
35、microRNA靶標(biāo)基因預(yù)測(cè)，結(jié)果提取、統(tǒng)計(jì)（重點(diǎn)講解）		 理論+
實(shí)操

注：課程以實(shí)際發(fā)生為準(zhǔn)；若調(diào)，會(huì)提前通知。

【報(bào)名費(fèi)用】

注冊(cè)費(fèi)：4200元/人（含當(dāng)期聽(tīng)課費(fèi)、資料費(fèi)、證書(shū)費(fèi)、考試費(fèi)（如有））。培訓(xùn)期間，食宿自理。

提供當(dāng)期視頻回放以供復(fù)習(xí)使用（羽林學(xué)院平臺(tái)）。

開(kāi)具增值稅發(fā)票，提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書(shū)等相關(guān)材料。

【報(bào)名優(yōu)惠政策】

1、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少300元；

2、4+1團(tuán)報(bào)，可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額；

3、上面優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受，只能享受其中一種；

老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。

培訓(xùn)以收到學(xué)員培訓(xùn)費(fèi)為成功報(bào)名，培訓(xùn)座位按收到費(fèi)用先后順序安排。

【付費(fèi)方式】

現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款、現(xiàn)場(chǎng)刷卡

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注：款項(xiàng)支出后，請(qǐng)?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員，方便核實(shí)到賬、開(kāi)具發(fā)票。

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