北京大學黃曉軍、李程、常英軍合作揭示G-CSF通過重塑T細胞三維基因組結構誘導免疫耐受分子機制
異基因造血干細胞移植(allo-HSCT)是目前治療血液系統(tǒng)惡性腫瘤的有效手段。但移植后合并癥移植物抗宿主疾?。℅raft-versus-host disease,GVHD)是造成移植后患者死亡的主要原因之一,嚴重影響了患者的生存及生活質量。GVHD可分為急性GVHD(aGVHD)和慢性GVHD(cGVHD),aGVHD在造血干細胞移植患者中的發(fā)生率為25%—55%,而cGVHD在患者中的發(fā)生率約為40%。無論是aGVHD還是cGVHD患者,對于一線激素治療無效的患者,目前均缺乏有效的二線治療藥物。而激素治療無效的aGVHD患者長期生存率較低,僅為5%—30%。因此,尋找aGVHD有效預防及干預靶點是亟待解決的科學和臨床問題。
G-CSF(Granulocyte colony-stimulating factor)是粒細胞刺激因子,可以刺激骨髓中髓系祖細胞增殖并向成熟粒細胞分化發(fā)育。對健康供者給予G-CSF預處理,不僅可以將骨髓中CD34+造血干細胞動員至外周血,同時G-CSF還可以通過調控T細胞以及APCs(抗原提呈細胞)的活性和功能而進一步調控免疫系統(tǒng)。在臨床研究及小鼠GVHD模型中均表明,G-CSF可通過抑制T細胞活化,誘導產生T細胞免疫耐受從而降低aGVHD的發(fā)生。然而,G-CSF誘導T細胞免疫耐受的分子機制尚未有明確研究。
2022年5月18日,北京大學血液病研究所所長、國家血液系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學研究中心主任黃曉軍教授,北京大學生命科學學院李程研究員,北京大學血液病研究所常英軍教授合作,在Advanced Science期刊發(fā)表了“Multiomics Analysis Identifies SOCS1 as Restraining T Cell Activation and Preventing Graft-Versus-Host Disease”的研究論文。在本項研究中,研究人員利用多組學測序手段RNA-seq、ATAC-seq、Hi-C等技術,分析了G-CSF動員前、后健康供者骨髓來源的CD3+CD4+和CD3+CD8+ T細胞的轉錄組、染色質開放性及三維基因組結構變化(圖1A)。多組學分析提示,G-CSF動員后的T細胞中正向調控T細胞相關活化基因的表達水平下調,負向調控T細胞增殖及活化相關信號通路表達上調(圖1B)。ATAC-seq分析也表明,T細胞活化相關基因所在染色質區(qū)域在G-CSF動員后的T細胞中染色質開放性下降(圖1C)。
圖1. G-CSF動員前后T細胞轉錄組及染色質可及性變化
通過整合RNA-seq,ATAC-seq及Hi-C的多組學數(shù)據(jù)分析,研究人員發(fā)現(xiàn)SOCS1是G-CSF動員后表達水平上調最為顯著的基因,而轉錄因子STAT3可能是直接調控SOCS1表達的上游因子(圖2A)。進一步整合分析原代T細胞中增強子信號(H3K27ac)以及STAT3的染色質結合(CUT&Tag)數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn),G-CSF可能通過重構SOCS1基因編碼區(qū)的染色質三維結構上調SOCS1表達水平。在G-CSF動員后的T細胞中SOCS1的基因編碼區(qū)附近,STAT3的結合重構染色質環(huán),促使SOCS1啟動子區(qū)域與上游的增強子區(qū)域互作加強,而由CTCF介導的SOCS1啟動子區(qū)域與下游的異染色質區(qū)域互作水平降低,從而上調了SOSC1的表達水平(圖2B)。
圖2. G-CSF通過STAT3介導的染色質環(huán)重構上調T細胞SOCS1表達水平
進一步,為了驗證SOCS1在T細胞活化中的調控作用,研究人員首先利用慢病毒在體外人原代T細胞中過表達了SOCS1基因,發(fā)現(xiàn)T細胞增殖能力顯著降低,同時T細胞耗竭相關分子TIGIT表達顯著上調。接著構建了T細胞特異性敲除Socs1的轉基因小鼠,從體內水平探索SOCS1對T細胞的調控作用。T細胞缺失Socs1后增殖能力顯著增強,促炎因子IFN-γ分泌水平顯著增多。此外,在由供鼠C57BL/6移植受鼠BALB/c建立的GVHD小鼠模型中,接受Socs1-/-T細胞移植的GVHD受鼠相較于接受野生型T細胞移植的受鼠生存期顯著縮短,同時在肝、肺、小腸及大腸等組織有更明顯的淋巴細胞侵潤導致的組織損傷。研究人員進一步利用G-CSF或PBS預處理的供鼠移植受鼠建立GVHD模型,探索T細胞缺失Socs1后是否影響G-CSF對GVHD受鼠的保護作用。在野生型組,供鼠經(jīng)過G-CSF處理后相較于PBS處理組顯著延長了GVHD小鼠的生存期。而在Socs1-/-組,供鼠經(jīng)過G-CSF處理后的GVHD受鼠生存期與PBS處理組無顯著差異。以上結果提示,T細胞缺失Socs1后G-CSF對GVHD小鼠的保護作用消失,證明G-CSF在體內通過上調T細胞中SOCS1水平從而誘導T細胞進入免疫耐受態(tài),從而降低GVHD損傷。進一步研究發(fā)現(xiàn),SOCS1不僅對CSF3R/JAK2/STAT3信號通路有抑制作用,同時對NLRP3炎癥小體信號通路也具有抑制作用。利用SOCS1蛋白功能域擬合肽段體外處理人原代T細胞后,可顯著降低T細胞增殖能力,并抑制STAT3的磷酸化水平,這一結果提示,SOCS1由STAT3激活后會負反饋性抑制STAT3的活化。此外,研究人員還通過小規(guī)模臨床隊列發(fā)現(xiàn),發(fā)生GVHD的患者與移植后同期未發(fā)生GVHD的患者相比,T細胞中SOCS1的表達水平顯著降低。
綜上,研究人員通過多組學分析并結合體內及體外功能實驗,完善了G-CSF誘導T細胞免疫耐受的分子機制模型:G-CSF通過與T細胞表面受體CSF3R結合,激活STAT3?;罨腟TAT3進入細胞核,通過重塑SOCS1基因編碼區(qū)染色質三維結構,上調SOCS1的表達水平。高水平SOCS1不僅可以負反饋抑制CSF3R/STAT3通路,同時還可抑制NLRP3炎癥小體信號通路,從而抑制T細胞增殖及炎癥因子分泌,誘導T細胞進入免疫耐受態(tài),降低GVHD損傷(圖3)。此研究揭示了SOCS1在抑制T細胞活化及降低GVHD中的重要調控作用,為臨床進一步干預及預防GVHD提供了新的潛在靶點。
圖3. G-CSF誘導T細胞免疫耐受分子調控機制模式圖
北京大學人民醫(yī)院助理研究員郭惠東,北大-清華生命科學聯(lián)合中心博士生李瑞風(現(xiàn)清華大學博士后)為本文共同第一作者。黃曉軍、李程、常英軍為本文的共同通訊作者。
來源:北京大學

