? ? ? ?在真核細(xì)胞中,信使RNA加帽現(xiàn)象較為普遍,帽子結(jié)構(gòu)對維持RNA的穩(wěn)定性以及促進(jìn)蛋白質(zhì)翻譯至關(guān)重要。一些RNA病毒的基因組具有帽子結(jié)構(gòu),多數(shù)RNA病毒在細(xì)胞質(zhì)中復(fù)制,而宿主的加帽體系存在于細(xì)胞核中,因此某些病毒需要編碼加帽酶,擁有自身的加帽體系。如登革病毒、乙型腦炎病毒等黃病毒編碼的NS3和NS5蛋白都參與病毒基因組的加帽過程(圖A)。與宿主加帽過程類似,黃病毒加帽涉及鳥苷酰轉(zhuǎn)移反應(yīng),該反應(yīng)可將鳥苷三磷酸(GTP)中的鳥苷單磷酸(GMP)模塊連接到RNA的5′-端。研究表明,該反應(yīng)過程中可形成GMP-蛋白質(zhì)共價中間體,即GMP先與特定的氨基酸殘基的側(cè)鏈形成共價鍵,進(jìn)而被轉(zhuǎn)移到RNA末端形成GpppRNA。在黃病毒相關(guān)研究中,有證據(jù)顯示NS5可與GMP形成共價中間體,但具體的氨基酸殘基未能得到確證。
  中國科學(xué)院武漢病毒研究所研究員龔鵬團(tuán)隊長期從事RNA病毒聚合酶的催化與調(diào)控機(jī)制研究。黃病毒NS5蛋白是加帽酶和聚合酶的融合蛋白,其N端結(jié)構(gòu)域兼具甲基轉(zhuǎn)移酶(methyltransferase,MTase)和鳥苷酰轉(zhuǎn)移酶(guanylyltransferase,GTase)功能。近日,該團(tuán)隊解析了蜱傳黃病毒鄂木斯克出血熱病毒(Omsk hemorrhagic fever virus,OHFV)NS5加帽酶的系列高分辨率晶體結(jié)構(gòu)(圖B,分辨率1.4-2.1埃),捕獲了GMP和m7GMP(鳥苷N7位甲基化的GMP)與NS5第28位精氨酸(Arg28)形成的共價中間體(圖C、圖1D下方結(jié)構(gòu))。部分黃病毒NS5該位點為賴氨酸(Lys),提示GMP-Arg和GMP-Lys共價中間體均可能存在(圖C),而m7GMP-Arg結(jié)構(gòu)則提示帽子鳥苷N7甲基化也有可能發(fā)生在鳥苷酰轉(zhuǎn)移反應(yīng)之前,這些結(jié)構(gòu)證據(jù)為剖析黃病毒加帽機(jī)制提供了重要參考。此外,單磷酸核苷和精氨酸形成的共價分子此前在轉(zhuǎn)移酶和連接酶中均未被觀測到。與其他氨基酸相比,精氨酸形成的這類共價分子有何獨特之處,共價分子的形成過程及后續(xù)反應(yīng)的特征等均尚待進(jìn)一步研究。
  相關(guān)研究成果在線發(fā)表Journal of Virology上。研究工作得到科技部、國家自然科學(xué)基金委員會、中科院武漢國家生物安全實驗室、湖北江夏實驗室等的支持。

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武漢病毒所解析鄂木斯克出血熱病毒加帽過程共價中間體結(jié)構(gòu)-肽度TIMEDOO??

  黃病毒加帽過程中可形成GMP-精氨酸共價中間體。A、黃病毒RNA的加帽過程示意圖;B、OHFV NS5 N端結(jié)構(gòu)域的晶體結(jié)構(gòu);C、基于結(jié)構(gòu)的12種黃病毒GTP/帽子相互作用模塊的部分序列比對;D、GTP/GMP-Arg28共價中間體和m7GTP/m7GMP-Arg28共價中間體結(jié)構(gòu),其中GTP/GMP、m7GTP/ m7GMP、Arg28的2Fo-Fc電子密度(經(jīng)3500 K拼合模擬退火處理,0.8σ水平)同時顯示。?

來源: 武漢病毒研究所