2022年12月28-30日·北京·計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)(CADD)——蛋白質(zhì)分子對接和網(wǎng)絡(luò)互作研討班
生命活動的基礎(chǔ)是生物分子間以及生物分子與其它分子間的相互作用,主要包括蛋白質(zhì)-小分子、蛋白-蛋白相互作用、蛋白-核酸相互作用等。研究生物分子間的相互作用,可以從分子水平上了解生命現(xiàn)象,從而闡明生命活動的機(jī)理,發(fā)現(xiàn)致病機(jī)制、治療途徑以及新藥研發(fā),具有非常重要的理論和現(xiàn)實(shí)意義。隨著生物分子相互作用實(shí)驗(yàn)技術(shù)平臺的發(fā)展,積累了大量的分子互作實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),如何分析和處理這些數(shù)據(jù)成為關(guān)鍵。目前,用生物信息學(xué)的手段來研究生物分子相互作用顯示出巨大的優(yōu)勢,技術(shù)工具更替升級的速度也越來越快。對從事基礎(chǔ)研究的人員來說,迫切需要學(xué)習(xí)掌握生物信息學(xué),生物分子互作等新工具,才有機(jī)會在科研競爭中占據(jù)優(yōu)勢。虛擬篩選是計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)中十分重要的技術(shù)手段,能夠從千萬量級的化合物數(shù)據(jù)庫中迅速篩選潛在的Hits,大大縮短發(fā)現(xiàn)先導(dǎo)藥物的時(shí)間。經(jīng)過多年的技術(shù)迭代,虛擬篩選領(lǐng)域積累了豐富的數(shù)據(jù)庫和軟件,我們的課程從理論到實(shí)際操作完美結(jié)合,讓各位充分掌握相關(guān)軟件操作的關(guān)鍵點(diǎn)。
授課對象:有生物分子互作分析需求的或者希望深入了解并掌握生物分子互作生物信息學(xué)分析數(shù)據(jù)庫及工具的研究生、科研工作者。
學(xué)員基礎(chǔ):由于培訓(xùn)具備一定的深度和廣度,我們希望學(xué)員應(yīng)具有學(xué)習(xí)生物分子互作軟件的興趣、基本的生物概念和相關(guān)基礎(chǔ)知識。
電腦要求:64位windows10操作系統(tǒng),運(yùn)行日常程序流暢。
主辦單位:北京市計(jì)算中心有限公司
協(xié)辦單位:
北京市基因測序與功能分析工程技術(shù)研究中心
云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地
北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實(shí)踐基地
支持單位:肽度TIMEDOO
舉 辦 地:北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓
課程安排:2022.12.28-30(周三-周五) ?上9:30-11:30 ?下13:30-17:00
日期 | 主題 | 內(nèi)容 | 備注 |
第一天 | 生物分子互作概述 | 1.生物分子相互作用概述
2.虛擬篩選:生物分子相互作用在計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)方面的應(yīng)用 |
理論+實(shí)戰(zhàn) |
基因信息和分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫 | 1.PDB:蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫及結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的篩選和獲取
2.NCBI:生物信息綜合數(shù)據(jù)庫查詢和數(shù)據(jù)獲取 |
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生物網(wǎng)絡(luò)和疾病相關(guān)數(shù)據(jù)庫 | 1.IPA:臨床組學(xué)及藥物數(shù)據(jù)挖掘
2.OMIM:人類疾病與基因遺傳變異數(shù)據(jù)庫 3.KEGG:細(xì)胞代謝及信號傳導(dǎo)通路數(shù)據(jù)庫 4.STRING:蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)查詢和可視化分析 |
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第二天 | 分子網(wǎng)絡(luò)分析及可視化實(shí)戰(zhàn) | 1.Cytoscape:網(wǎng)絡(luò)分析軟件
2.生物分子交互作用復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)可視化 3.生物分子網(wǎng)絡(luò)靶點(diǎn)分析、網(wǎng)絡(luò)聚類分析 4.網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)論文實(shí)例概述 |
理論+實(shí)戰(zhàn) |
分子結(jié)構(gòu)可視化軟件SCI繪圖實(shí)戰(zhàn) | 1.Pymol分子結(jié)構(gòu)可視化軟件
2.分子結(jié)構(gòu)文件處理和計(jì)算 3.生物大分子靶點(diǎn)結(jié)構(gòu)分析及高質(zhì)量論文繪圖 |
理論+實(shí)戰(zhàn) | |
第三天 | 蛋白質(zhì)靶點(diǎn)和小分子對接實(shí)戰(zhàn) | 1.Autodock軟件原理及功能介紹
2.分子對接和對接結(jié)果分析 3.實(shí)例講解與練習(xí) |
理論+實(shí)戰(zhàn) |
虛擬篩選演示與實(shí)戰(zhàn) | 1.基于高性能計(jì)算集群的藥物虛擬篩選概述2.ZINC:虛擬篩選小分子數(shù)據(jù)庫介紹與應(yīng)用
3.Autodock vina軟件原理及功能介紹 4.實(shí)例講解與練習(xí) 5.Linux介紹及高性能計(jì)算虛擬篩選操作演示 |
理論+實(shí)戰(zhàn) | |
生物分子互作網(wǎng)絡(luò)分析繪圖及網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)介紹 | 1.大分子對接原理及應(yīng)用介紹
2.Rosetta軟件介紹與使用 3.z-dock軟件介紹與使用 4.實(shí)例講解與練習(xí) |
理論+實(shí)戰(zhàn) |
注:內(nèi)容以實(shí)際發(fā)生為準(zhǔn);若調(diào),會提前通知。
【報(bào)名費(fèi)用】
注冊費(fèi):4200元/人(含當(dāng)期聽課費(fèi)、資料費(fèi)、證書費(fèi)、考試費(fèi)(如有))。
提供當(dāng)期視頻回放以供復(fù)習(xí)使用(羽林學(xué)院平臺)。
開具增值稅發(fā)票,提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書等相關(guān)材料。
【報(bào)名優(yōu)惠政策】
1、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少300元;
2、4+1團(tuán)報(bào),可免費(fèi)贈送一個(gè)名額;
3、上面優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受,只能享受其中一種;
老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。
【付費(fèi)方式】
手機(jī)銀行或電子銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款等
單位全稱:北京市計(jì)算中心有限公司
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注:款項(xiàng)支出后,請?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員,方便核實(shí)到賬、開具發(fā)票。
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