12月2日，中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院劉興國課題組與香港中文大學(xué)合作，在《自然-通訊》（Nature Communications）上，在線發(fā)表了題為Nuclear Localization of Mitochondrial TCA Cycle Enzymes Modulates Pluripotency via Histone Acetylation（《線粒體TCA循環(huán)酶入核通過組蛋白乙?；{(diào)控多能性》）的最新研究成果。研究發(fā)現(xiàn)，多種線粒體TCA循環(huán)酶在多能干細胞獲得、狀態(tài)轉(zhuǎn)變以及轉(zhuǎn)變?yōu)槿芨杉毎冗^程均存在從線粒體轉(zhuǎn)運到細胞核的現(xiàn)象，且核定位TCA循環(huán)酶調(diào)控上述過程。核定位丙酮酸脫氫酶（Pdha1）可促進細胞核內(nèi)乙酰CoA從而促進組蛋白乙?；揎?，并進一步打開多能性相關(guān)基因，推進多能性獲得。該研究揭示了線粒體TCA循環(huán)酶入核通過表觀遺傳調(diào)控多能性的重要作用，拓展了線粒體反向信號調(diào)控干細胞多能性的新模式。

哺乳動物細胞存在兩個具有遺傳物質(zhì)的細胞器——細胞核與線粒體。這兩者約二十億年前相遇，便開始了相戀相依的進化歷程。多能干細胞獨特的自我更新能力與分化為多種細胞類型的能力，使其在再生醫(yī)學(xué)和發(fā)育生物學(xué)研究中受到關(guān)注。胚胎干細胞（embryonic stem cell，ESCs）與誘導(dǎo)多能干細胞（induced pluripotent stem cells，iPSCs）是常見的多能干細胞。多能干細胞具有特殊的表觀遺傳修飾狀態(tài)，而許多線粒體代謝產(chǎn)物如乙酰輔酶A、α-酮戊二酸、NAD+等作為組蛋白修飾酶的輔基直接發(fā)揮重要作用。劉興國團隊以多能干細胞模型系統(tǒng)地闡明了線粒體氧離子調(diào)控組蛋白甲基化與DNA甲基化，線粒體代謝產(chǎn)物調(diào)控組蛋白乳酸化、乙?；?，線粒體磷脂調(diào)控組蛋白乙?；盎虮磉_等一系列通過反向信號模式調(diào)控細胞核的全新模式。

三羧酸循環(huán)（tricarboxylic acid cycle，TCA cycle）作為需氧生物體內(nèi)普遍存在的代謝途徑，是物質(zhì)代謝與能量代謝的重要樞紐。線粒體TCA循環(huán)酶正常行駛功能是TCA循環(huán)維持的關(guān)鍵。TCA循環(huán)酶在一些惡性腫瘤細胞中能從線粒體轉(zhuǎn)運到細胞核內(nèi)發(fā)揮DNA修復(fù)和表觀遺傳調(diào)控的作用。然而，TCA循環(huán)酶在多能性獲得與轉(zhuǎn)變中時空調(diào)控的規(guī)律和作用尚不清楚。

劉興國團隊聚焦多能性的各個過程，包括多能干細胞獲得（iPSCs重編程）、始發(fā)態(tài)-原始態(tài)轉(zhuǎn)變（Primed-Naive轉(zhuǎn)變）、轉(zhuǎn)變?yōu)槿芨杉毎‥SCs-類二細胞期細胞（2CLCs）轉(zhuǎn)變）。以上過程均發(fā)現(xiàn)線粒體內(nèi)TCA循環(huán)酶類，包括Pdha1、Pcb、Aco2、Cs、Idh3a、Ogdh、Sdha、Mdh2等存在從線粒體向細胞核轉(zhuǎn)運的現(xiàn)象。其中，過表達核定位TCA循環(huán)酶Pdha1、Pcb、Aco2、Cs、Idh3a能促進干細胞多能性的獲得以及Primed-Naive轉(zhuǎn)變。另外，核定位的Pdha1促進ESCs向2CLCs轉(zhuǎn)變。Pdha1對多能干細胞命運的作用依賴于其丙酮酸脫氫酶活性。

研究發(fā)現(xiàn)，在多能性獲得過程中，核定位TCA循環(huán)酶Pdha1不改變細胞的有氧呼吸及糖酵解動態(tài)平衡。核定位Pdha1通過促進細胞核內(nèi)乙酰輔酶A的合成為組蛋白乙?；峁┓磻?yīng)底物，促進組蛋白H3乙?；绕涫荋3K9與H3K27兩個位點的乙?；揎椝?。進一步，研究顯示，核定位Pdha1能促進多能性相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄起始位點以及增強子區(qū)域的H3K9ac和H3K27ac水平。核定位Pdha1能促進P300以及重編程因子Sox2/Klf4/Oct4對它們下游靶標（多能性基因）的結(jié)合，并促進多能性相關(guān)基因染色質(zhì)的重塑，進而促進多能性的獲得。

該工作為目前新的組蛋白修飾如組蛋白棕櫚?；?、巴豆?；?、丁?；揎椀鹊难芯刻峁┝诵碌难芯克悸罚ㄟ@些修飾依賴于線粒體產(chǎn)生的代謝物）。本研究描述了多個TCA循環(huán)酶的轉(zhuǎn)運入核。除Pdha1外，其他TCA循環(huán)酶可能在調(diào)節(jié)細胞核中的表觀遺傳學(xué)中發(fā)揮類似作用，提示細胞核中可能存在類似線粒體中的復(fù)雜代謝循環(huán)，并調(diào)控多種表觀遺傳途徑。

本研究闡明的Pdha1轉(zhuǎn)運入核為組蛋白乙?；峁┚植恳阴］o酶A，是全新的通過活躍的組蛋白乙?；S持染色質(zhì)開放狀態(tài)的新途徑。這一途徑對于多能性頗為重要，并表明其在早期發(fā)育中的重要生理意義。腫瘤干細胞同樣表現(xiàn)出開放的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、過度活躍的組蛋白乙?；蛷难趸姿峄綗o氧糖酵解的代謝轉(zhuǎn)換，這一新途徑或為腫瘤干細胞的病理研究提供信息。

細胞核與線粒體在二十億年相戀相依中，進化出較多交流方式，其中，線粒體代謝物入核作為表觀遺傳酶的輔基是重要的一種。這如同線粒體與細胞核隔著細胞質(zhì)的海洋，代謝物是舟上相思的“紅豆”。而線粒體TCA循環(huán)酶則另辟蹊徑，作為線粒體的“信物”，到達細胞核，更加精準的對應(yīng)需求，在細胞核里局部生根發(fā)芽，就地利用養(yǎng)料（丙酮酸）結(jié)出新鮮茂密的“紅豆”，并使局部的核小體松散。

研究工作得到國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金、中科院、廣東省、廣州市的支持。

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TCA循環(huán)酶入核調(diào)控多能性獲得、多能性轉(zhuǎn)變及全能性獲得模式圖

來源：中科院