最新Nature,Nature子刊公布CRISPR兩項突破性成果
作為生命的基本遺傳物質(zhì),DNA的精準(zhǔn)編輯和快速檢測一直以來備受關(guān)注。近年來,CRISPR/Cas9系統(tǒng)的發(fā)現(xiàn)和開發(fā)帶來了許多新希望。最新Nature和Nature Communications雜志公布了兩項重要成果:“Super-Mendelian inheritance mediated by CRISPR–Cas9 in the female mouse germline”,“Engineering of CRISPR-Cas12b for human genome”,分別報道了首次哺乳動物CRISPR-Cas9基因驅(qū)動,以及第三種CRISPR-Cas系統(tǒng)。
第一篇文章中,加州大學(xué)圣地亞哥分校的研究人員探索了CRISPR-Cas9編輯技術(shù)是否能夠在哺乳動物中成功實施基因驅(qū)動,結(jié)果證明CRISPR-Cas9能改變雌性小鼠生殖系,驅(qū)動白色毛皮和紅色熒光蛋白的表達。
這一研究成果公布在Nature雜志上。由加州大學(xué)圣地亞哥分校的進化發(fā)育生物學(xué)家Kimberly Cooper領(lǐng)導(dǎo)完成。
一位未參與該研究的科學(xué)家認(rèn)為,“這是第一篇描述哺乳動物中基因驅(qū)動的重要成果?!?/p>
基因驅(qū)動(gene drive)能將外源基因快速引入動物群體,并由此消除相關(guān)疾病,或者對害蟲和入侵物種進行控制。這種方法確保后代優(yōu)先繼承一個父母的特定等位基因,因此即使它對物種繁殖或者存活有害,這種突變也可以快速傳播。
Cooper表示,她的團隊最開始是希望能復(fù)制其它物種的遺傳改變,以便了解這些遺傳改變的作用是什么,但是利用傳統(tǒng)的小鼠遺傳學(xué)進行轉(zhuǎn)基因操作,得到每個轉(zhuǎn)基因兩個純合等位基因,很困難。
為此Cooper求助于兩位加州大學(xué)圣地亞哥分校的同事:Ethan Bier和Valentino Gantz。他們曾在2015年報道了果蠅的基因驅(qū)動。
在最新的研究中,Cooper等人聚焦于Tyrosinase(酪氨酸酶)基因,這種基因能決定皮毛的顏色,方便研究人員了解基因驅(qū)動是否發(fā)生了。他們利用包含導(dǎo)向RNA的基因驅(qū)動插入到酪氨酸酶基因上,將一種紅色熒光蛋白的基因插入到酪氨酸酶的第四個外顯子中。
同時也將轉(zhuǎn)基因?qū)氲骄?,卵?xì)胞和胚胎發(fā)育過程中不同時間和不同地點激活cas9的基因群,這樣研究人員培育出的動物,看看它們發(fā)生了什么變化,如果長出來的動物是白色毛皮的,那么就表明Cas9剔除了酪氨酸酶基因;如果動物能發(fā)紅光,那就表明切割的酪氨酸酶已經(jīng)用其工程基因的拷貝進行了修復(fù)。
Cooper等人已經(jīng)將這項技術(shù)應(yīng)用于肢體發(fā)育和進化的三趾跳鼠的研究,“這為為生物醫(yī)學(xué)研究和藥物設(shè)計制作了實驗小鼠”,也回答了關(guān)于進化的其他問題。
總體來說,這項研究精確了雌性小鼠Cas9生成的時間,分析了更高的效率是否能決雄性小鼠缺乏同源定向修復(fù)的問題?!斑@是第一次證明可行,但還不是很完美,因此還有待改進,“Cooper說。
另外一項研究中,張鋒等人開發(fā)了第三種基因編輯工具CRISPR-Cas12b。我們知道CRISPR-Cas9系統(tǒng)有很多類,其中第2類系統(tǒng)包括基于cas9、cas12和cas13效應(yīng)蛋白的II、V和VI型,之前研究發(fā)現(xiàn)Cas12包含一個單一的Ruvc核酸酶結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域切割PAM序列附近的dsDNA,非特異性地切割SSDNA,可以分成V-A亞型( cas12a )和V-B亞型( cas12b )。
最新研究構(gòu)建了酶活最高的突變體BhCas12b v4(K846R/S893R/E837G),它有以下幾個優(yōu)點:
(1)酶活與SpCas9、AsCas12a相當(dāng),但特異性比更SpCas9更高,其安全性更適合于臨床應(yīng)用;
(2)在基因組里PAM數(shù)量與AsCas12a相當(dāng),擴大了基因組的靶向范圍;
(3)蛋白更小(BhCas12b:1108個氨基酸、SpCas9:1369個氨基酸、AsCas12a:1353個氨基酸),尤其適合用于腺相關(guān)病毒AAV介導(dǎo)的基因治療。
因此,該系統(tǒng)具有極大的應(yīng)用前景,有望開發(fā)出新一代安全高效的基因編輯工具。
研究團隊相信,在繼Cas9和Cas12a之后,改造的Cas12b將以其分子量小和靶向特異性高的兩大特點,成為又一款在體編輯人類基因組的有力工具。并且,這一顯著提升Cas12b效率的改造工程也為解鎖更多CRISPR工具提供了富有啟發(fā)的指導(dǎo)。
來源:生物通
原文標(biāo)題:
Super-Mendelian inheritance mediated by CRISPR–Cas9 in the female mouse germline
Engineering of CRISPR-Cas12b for human genome


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