2023.8.18-20|微生物與微生物組課題設(shè)計(jì)與高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班-肽度TIMEDOO
微生物在人們?nèi)粘I睢W(xué)習(xí)、科研中隨處可見,也同每個(gè)人息息相關(guān),經(jīng)過多期培訓(xùn)以及學(xué)員反饋,特開設(shè)更為貼合科研工作者、初學(xué)者的需求的微生物主題培訓(xùn)。課程分為三部分:
第一部分以理論概念講述、課題設(shè)計(jì)、文獻(xiàn)分享為主,主要目的是幫助科研工作者把握領(lǐng)域的基本情況、了解領(lǐng)域熱點(diǎn)問題、從而可以獨(dú)立進(jìn)行課題設(shè)計(jì)與實(shí)驗(yàn)計(jì)劃安排,以演示為主;
第二部分以操作邏輯講解、報(bào)告解讀、文章優(yōu)化為主,主要目的是幫助科研工作者串聯(lián)基本的分析脈絡(luò)、整理文章圖表進(jìn)行文章優(yōu)化,以演示和操作為主;
第三部分以實(shí)際編程操作、上機(jī)練習(xí)為主,主要目的是幫助時(shí)間較為充足的科研工作者實(shí)現(xiàn)從分析的初級(jí)結(jié)果中提煉出有效信息,整理出圖表,深入理解編程軟件的基本用法,以演示、操作和練習(xí)為主。
其中,第一部分和第二部分主要面向涉及課程設(shè)計(jì)的科研工作者,第二部分和第三部分主要面向即將進(jìn)入該領(lǐng)域,有大量精力可以用來學(xué)習(xí)的學(xué)生。

課程目的

1. 掌握相關(guān)的基礎(chǔ)知識(shí);

2. 掌握微生物學(xué)和微生物組學(xué)的基本概念;

3. 掌握擴(kuò)增子測(cè)序技術(shù)、宏基因組、宏轉(zhuǎn)錄組、宏代謝組測(cè)序技術(shù)的基本概念、分析邏輯;

4. 掌握相關(guān)文章邏輯把握和呈現(xiàn)形式,以及相關(guān)的分析技能。

主講專家

邀請(qǐng)一直從事微生物組研究的教授、研究員等專家,有豐富的系統(tǒng)性科研訓(xùn)練經(jīng)歷和授課經(jīng)驗(yàn),任職于北京各高校和研究所,有Nat. Commun.、Nucleic Acids Res.Gut、Genome Biology等國(guó)際頂級(jí)刊物多篇文章發(fā)表。

培訓(xùn)時(shí)間

20230818-0820日,上午9:30-12:00,下午13:30-18:00
北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)3號(hào)樓

課程大綱

微生物與微生物組課題設(shè)計(jì)與高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班課程目錄
第一章微生物與微生物組研究理論基礎(chǔ)
1.1 微生物與微生物組研究背景與現(xiàn)狀

1.2 基因組學(xué)與微生物組學(xué)

1.3 微生物組研究項(xiàng)目設(shè)計(jì)

1.4 微生物組研究文獻(xiàn)綜述

第二章生物信息學(xué)在微生物組研究中的應(yīng)用 2.1 生物信息學(xué)背景介紹

2.2 常用參考數(shù)據(jù)庫(kù)介紹

2.3 常用微生物基因組分析流程介紹

2.4 常用微生物組分析流程介紹

2.5 常用軟件使用介紹與練習(xí)

2.6 應(yīng)用案例與課后練習(xí)

第三章微生物組擴(kuò)增子測(cè)序方案及結(jié)果解讀 3.1 16S/ITS擴(kuò)增子研究方案介紹

3.2 分析報(bào)告解讀

3.3 擴(kuò)增子測(cè)序分析文獻(xiàn)詳解

第四章微生物組宏基因組測(cè)序和宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序方案及結(jié)果解讀 4.1 宏基因組、宏轉(zhuǎn)錄組、宏病毒組、宏代謝組研究方案介紹

4.2 分析報(bào)告解讀

4.3 宏基因組、宏轉(zhuǎn)錄組、宏病毒組、宏代謝組文獻(xiàn)詳解

4.4 整合型研究文獻(xiàn)分析詳解

第五章 R語言在微生物組研究中的應(yīng)用 5.1 編程基礎(chǔ)簡(jiǎn)介

5.2 R語言基礎(chǔ)與練習(xí)

5.3 R語言的統(tǒng)計(jì)與繪圖

5.4 R語言在微生物組研究中的應(yīng)用案例

5.5制圖軟件優(yōu)化

注:以上為課程主要內(nèi)容,并非課程安排,課程安排順序會(huì)根據(jù)面向科研工作者的類型有差異。
分享的案例以CNS子刊microbiomeISMEJ,genome biology等為主,并結(jié)合學(xué)員實(shí)際情況進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整。

主辦單位

北京市計(jì)算中心有限公司

協(xié)辦單位:

北京市基因測(cè)序與功能分析工程技術(shù)研究中心
云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地
北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實(shí)踐基地
支持單位:肽度TIMEDOO

報(bào)名費(fèi)用

注冊(cè)費(fèi):3900/人(含當(dāng)期聽課費(fèi)、資料費(fèi)、證書費(fèi)),開具發(fā)票,提供蓋章通知。
3人以上參加每人優(yōu)惠300元,不與其他政策共享。

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2023.8.18-20|微生物與微生物組課題設(shè)計(jì)與高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析培訓(xùn)班-肽度TIMEDOO

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李老師:vicolee2021(微信)