2023.8.16-18|基因組關聯(lián)分析技術應用培訓班

2年前發(fā)布在 培訓班

2023.8.16-18|基因組關聯(lián)分析技術應用培訓班-肽度TIMEDOO

隨著測序技術的發(fā)展，產(chǎn)生了海量的基因型數(shù)據(jù)，然而如何將基因型與表型進行關聯(lián)，從而定位復雜疾病風險基因或農(nóng)業(yè)動植物重要經(jīng)濟性狀相關的遺傳變異卻是一項巨大挑戰(zhàn)。在過去的十年間，借助全基因組關聯(lián)分析（GWAS），科研人員發(fā)掘了大量與人類復雜疾病和農(nóng)業(yè)動植物重要經(jīng)濟性狀相關的遺傳變異。

我中心智能計算事業(yè)部，在基因組關聯(lián)分析領域具有豐富經(jīng)驗，發(fā)表多篇領域頂級雜志。針對具備一定統(tǒng)計學、遺傳學、分子生物學基礎的生物醫(yī)學領域研究人員，特開設基因組關聯(lián)分析培訓班。

培訓特色：

無需任何計算機語言基礎；

深入淺出，內(nèi)容精要實用；

結合人類醫(yī)學、動植物育種等生物學數(shù)據(jù)背景知識與實例講授；

統(tǒng)計學原理+模型/算法+編程實現(xiàn)+生物醫(yī)學應用；

授課老師經(jīng)驗豐富，邊學邊練，重實踐，力求實效；

小班授課，個別輔導。

主辦單位：北京市計算中心有限公司

協(xié)辦單位：

北京市基因測序與功能分析工程技術研究中心

云計算關鍵技術與應用北京市重點實驗室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓基地

北京市大數(shù)據(jù)教學實踐基地

支持單位：肽度TIMEDOO

舉辦地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓；亦可聽取線上直播

課程安排：2023年8月16-18日（周三-周五）上9:30-11:30 下13:30-17:00

日期	主題	內(nèi)容	備注
第一天	基因組關聯(lián)分析理論基礎	1、基因組學與生物信息學概述 2、基于群體遺傳的數(shù)據(jù)獲取 3、基因組關聯(lián)分析的原理、數(shù)模、策略及常用軟件介紹 4、常用GWAS數(shù)據(jù)庫介紹	理論+ 操作（上機）
	GWAS計算機基礎	1、Linux基礎for GWAS 2、R基礎for GWAS
	Plink軟件基礎應用	1、Plink軟件應用 2、Plink文件格式生成與解析 3、等位基因頻率計算 4、哈-溫平衡計算 5、基因組關聯(lián)分析流程 6、關聯(lián)分析結果分析與p校正
第二天	基因型填充Imputation	1、基因型填充Imputation的原理及應用 2、基因型填充軟件介紹與應用 3、基因組填充的方法與分析流程 4、1000G數(shù)據(jù)應用	理論+ 操作（上機）
第二天	關聯(lián)分析應用	1、基于家系的關聯(lián)分析 2、曼哈頓圖的繪制與結果展示 3、實戰(zhàn)for Plink	理論+ 操作（上機）
第三天	關聯(lián)分析應用	1、單倍型介紹 2、單倍型分析 3、LD連鎖不平衡指數(shù)計算 4、實戰(zhàn) 5、Tassel軟件介紹	理論+ 操作（上機）