利用數(shù)據(jù)湖和自然語言生成的新方法自動篩選最佳生物藥物細胞系
眾所周知,選取適當?shù)募毎凳巧镏扑幑に囬_發(fā)的關鍵步驟之一。選擇不當可能會延誤規(guī)模擴大,并損害藥物的商業(yè)潛力。根據(jù)一項研究的作者所言,成功的關鍵在于全面的特性表征,他們概述了一種利用數(shù)據(jù)湖、自然語言生成和先進分析技術的新型選擇方法,以自動識別最佳細胞。
這個由倫敦大學學院(UCL)和阿斯利康的研究人員組成的團隊開發(fā)了一種名為CLD4的數(shù)據(jù)驅動方法,該方法基于生產過程中的一系列數(shù)據(jù)來選擇克隆細胞。研究員Haneen Alosert來自UCL生化工程系,也是該研究的共同作者。她表示,這種方法不同于目前的方法,后者僅基于實驗室中可用的信息進行選擇。
她解釋道:“目前的細胞系選擇流程考慮了每個篩選階段的數(shù)據(jù),與每個處理規(guī)模相對應。例如,僅使用與低體積細胞生長、終點滴度和產品質量信息相關的離線數(shù)據(jù),來選擇前列細胞系。然后,在不同規(guī)模上培養(yǎng)這些細胞系,在這些處理條件下,細胞系的表現(xiàn)受到影響,這最終影響了選擇主導細胞系的決策?!?/p>
“本文中討論的新方法考慮了與處理條件、生長特性、生產能力和產品質量特征有關的不同標準,這些標準使用制造可行性指數(shù)來進行分析。該指數(shù)采用加權求和方法,總結了細胞系在每個標準內的排名以及每個標準的相對重要性。因此,它使用一個基本度量簡化了選擇主導細胞系的決策?!?/p>
該方法的核心是Alosert及其同事開發(fā)的“制造可行性”指數(shù)。該指數(shù)使用多個過程參數(shù)的數(shù)據(jù)構建,例如生長特性、處理條件、生產能力和質量信息,這些數(shù)據(jù)記錄在不同規(guī)模下。
該指數(shù)用于評估候選細胞系,并為每個細胞系分配一個制造可行性指數(shù)(MI指標),可以用來對可能在商業(yè)規(guī)模培養(yǎng)中最具生產力的細胞系進行排名,根據(jù)Alosert的說法。
她繼續(xù)說道:“這使用戶可以使用MI指標生成結果。一旦計算出MI,就會使用基于規(guī)則的自然語言生成(NLG)算法,使用與CLD決策過程中未使用的MI記錄和元數(shù)據(jù),這些與治療產品的商業(yè)潛力相關。
“在這種情況下提取的元數(shù)據(jù)將是針對每家公司特定的,例如影響公司組合管理和預算規(guī)劃程序的制造能力,這些被發(fā)現(xiàn)是至關重要的?!?/p>
編輯:王洪
排版:李麗


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