肽度TIMEDOO獲悉,提到寄生蟲,人們很容易聯(lián)想到寄生的動物或微生物。但你知道嗎?其實植物界中也有“寄生蟲”哦!

地球上絕大多數植物為“自養(yǎng)型”,它們自立更生,從土壤中吸取養(yǎng)分,依靠自身光合作用獲取生長能量。然而在被子植物中,進化出了至少12類,近5000種寄生植物,它們“好吃懶做”,寄生在其它植物上并偷取營養(yǎng)。蛇菰(gū)科植物就是全寄生植物的典型代表之一。

理解此類植物的演化歷程及生活機制,對探究物種起源、萬物生長具有重要意義。9月21日,深圳華大生命科學研究院聯(lián)合昆明植物所、英屬哥倫比亞大學等單位,合作完成了兩種蛇菰的基因組解析,揭示了其獨特形態(tài)和特殊生活方式的背后機制,相關成果發(fā)表于國際期刊《自然-植物》(Nature Plants)。

華大等機構破譯蛇菰基因組,揭示植物界“寄生蟲”的演化歷程-肽度TIMEDOO

蛇菰雖形似蘑菇,卻是實打實的高等植物,其主要器官為根莖和花。一般的寄生植物會把吸收營養(yǎng)的器官伸進宿主體內,而蛇菰卻能將宿主的維管組織(有輸導水分和營養(yǎng)的功能)誘導到自己體內,如同將別人家的水管連到自己家中。這種獨特的寄生方式能幫助蛇菰更好地獲取養(yǎng)分。

華大等機構破譯蛇菰基因組,揭示植物界“寄生蟲”的演化歷程-肽度TIMEDOO

杯莖蛇菰的野外生活環(huán)境(左圖,拍攝者:魏澤,中國植物圖像庫);杯莖蛇菰的根莖,花葶,以及與寄主根的連接(中圖);球穗蛇菰不同的生長發(fā)育階段(右圖)

與自養(yǎng)植物相比,寄生植物發(fā)生了不同數量的基因丟失。根據過往發(fā)表的文章,大花草科植物寄生花(全寄生)丟失了約44%的基因、旋花科植物菟絲子(介于全寄生和半寄生之間)丟失了約11.7%的基因、列當科植物松蒿和馬先蒿(半寄生)則丟失了約2.4%-3.0%的基因……

華大等機構破譯蛇菰基因組,揭示植物界“寄生蟲”的演化歷程-肽度TIMEDOO

來自5個類群的寄生植物形態(tài)及一些關鍵功能的基因丟失

研究團隊通過比較此次新組裝的蛇菰科的兩個物種——杯莖蛇菰和球穗蛇菰,與半寄生植物小紅花寄生,以及如上提及的幾種寄生植物,發(fā)現(xiàn)半寄生植物丟失了相對少量的基因,而全寄生的蛇菰和寄生花卻發(fā)生了大量的基因丟失(分別為28%和38%),且兩個類群丟失的基因大部分是相同的,這也是目前研究人員在植物中發(fā)現(xiàn)的最大程度的基因丟失。

“盡管蛇菰和寄生花形態(tài)不同,由不同的祖先獨立進化到現(xiàn)在,但它們丟失的共同基因卻分別占到各自丟失的60%和80%?!比A大生命科學研究院的陳曉麗博士補充道,“這兩個類群很像大自然做了兩次不同的實驗,但是得到了非常類似的結果。我們推斷,其它全寄生植物類群盡管形態(tài)各異,但也有可能發(fā)生相似的基因丟失?!?/p>

伴隨著光合作用功能的喪失,蛇菰和寄生花丟失了幾乎全部與此相關的基因;同時,與根部發(fā)育、氮的吸收、開花調節(jié)等重要功能相關的基因也發(fā)生了大量丟失;此外,一般植物會保留多個相似的基因用于信號傳遞、代謝或環(huán)境適應等,形成一些多基因家族,而蛇菰和寄生花在這些家族中卻傾向于只保留一個基因。這從側面展示了全寄生植物在進化歷程中基因丟失的程度及方式,反映了基因丟失在進化中所發(fā)揮的的強大力量。

另一個有趣的發(fā)現(xiàn)是,蛇菰和寄生花丟掉了脫落酸主要合成通路的大部分基因,而此次研究卻在蛇菰的花序中發(fā)現(xiàn)了脫落酸積累和響應基因的高表達。研究人員猜測,蛇菰可能直接利用了宿主中合成的脫落酸,這代表了寄生植物與宿主互作的一種全新的形式。

文章共同通訊作者、加拿大英屬哥倫比亞大學Graham教授認為,“寄生植物的基因丟失大部分能與不需要的功能聯(lián)系起來。但我們推斷,有一些基因丟失對寄生植物來說是有益的,如上述脫落酸合成通路相關基因的丟失,能保證寄生植物與宿主保持生理上的同步,可能更有利于自身的存活?!?/p>

前文提到蛇菰能將宿主的維管組織誘導到自己體內,形成一種嵌合體。對宿主來說,與另一物種接觸會導致較強的免疫反應,研究發(fā)現(xiàn),水楊酸在宿主的根中積累,而蛇菰在二者交接處高表達了一些用于分解或負調節(jié)水楊酸的基因。研究人員推斷,蛇菰可能通過減弱水楊酸的作用來降低宿主的免疫反應,這也是首次發(fā)現(xiàn)寄生植物與宿主之間會通過水楊酸來互相較量。

文章共同通訊作者、深圳華大生命科學研究院劉歡研究員認為:“此次研究揭示了寄生植物與宿主之間復雜的互作關系,有助于我們了解寄生植物的進化機制,對農業(yè)中特別是一些寄生雜草的控制有非常大的幫助。”

深圳華大生命科學研究院陳曉麗、方東明,中國科學院昆明植物所許宇星為該論文共同第一作者。深圳華大生命科學研究院劉歡,加拿大英屬哥倫比亞大學Sean W. Graham 為論文共同通訊作者。該項目得到深圳市科技創(chuàng)新委員會(No. JCYJ20160331150739027、KCXFZ20201221173013035)基金的支持。該項目是萬種植物基因組計劃的一部分(https://db.cngb.org/10kp/),同時也得到了中國國家基因庫(www.cngb.org)的支持。

原文鏈接:https://www.nature.com/articles/s41477-023-01517-7

編輯:李麗