2018年5月份上半月circRNA研究報(bào)道匯總-肽度TIMEDOO

5月上旬的circRNA研究報(bào)道總結(jié)又跟大家見面了,往期每半月的總結(jié),大家可以在本公眾號(hào)的近期文章目錄中查看,下面我們一起瀏覽下這半個(gè)月circRNA的研究進(jìn)展情況。

1、視網(wǎng)膜神經(jīng)退化疾病中對(duì)circRNA-ZRANB1的治療干預(yù)研究

論文標(biāo)題:Targeting circular RNA-ZRANB1 for therapeutic intervention in retinal neurodegeneration

雜志:Cell Death Dis
影響因子:5.97分

通訊作者單位:上海醫(yī)科大學(xué)眼科研究所

青光眼是一種常見的視網(wǎng)膜退行性疾病,表現(xiàn)為視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)細(xì)胞、雙極細(xì)胞、感光細(xì)胞、色素細(xì)胞等進(jìn)行性變性、凋亡和壞死等。目前針對(duì)這類疾病主要是緩解視網(wǎng)膜細(xì)胞變性和凋亡進(jìn)展,已有研究表明circRNA在神經(jīng)退行性疾病中似乎起著重要調(diào)控作用,該研究發(fā)現(xiàn)circRNA?cZRANB1在青光眼中顯著上調(diào),體內(nèi)實(shí)驗(yàn)表明敲低c?ZRANB1可顯著降低神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞活性和提高視網(wǎng)膜神經(jīng)節(jié)細(xì)胞(RGC)的生存率。體外實(shí)驗(yàn)表明,cZRANB1敲低可直接調(diào)控Müller細(xì)胞的功能和間接調(diào)控RGC細(xì)胞功能,cZRANB1通過cZRANB1/miR-217/RUNX2途徑發(fā)揮miRNA?sponge功能,因此研究者認(rèn)為在青光眼神經(jīng)退行性疾病中,靶向cZRANB1也許是一個(gè)重要的治療靶點(diǎn)。

?

2、肺癌細(xì)胞中TNRC6A蛋白調(diào)控circRNA-0006916的表達(dá)研究

論文標(biāo)題:RNA-binding Protein Trinucleotide repeat-containing 6A Regulates the Formation of Circular RNA 0006916, with Important Functions in Lung Cancer Cells

雜志:Carcinogenesis
影響因子5.11分

作者通訊單位:廣州醫(yī)科大學(xué)

鎳化合物廣泛存在于人類職業(yè)環(huán)境中,是人類發(fā)生肺癌的主要危險(xiǎn)因素,該文研究者利用抗BPDE(benzo[a]pyrene-trans-7,8-dihydrodiol-9,10-epoxide)誘導(dǎo)人正常支氣管上皮細(xì)胞16HBE惡性轉(zhuǎn)化為16HBE-T,建立細(xì)胞模型。發(fā)現(xiàn)該模型中circRNA circ0006916持續(xù)下調(diào),在A549和H460細(xì)胞中,敲低circRNA circ0006916后,通過加速細(xì)胞周期的方式加速細(xì)胞增殖,并不抑制細(xì)胞凋亡,對(duì)應(yīng)地,過表達(dá)circRNA circ0006916可引起相反的細(xì)胞功能,熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)表明circRNA circ0006916可結(jié)合miR-522-3P抑制PHLPP1的活性,同時(shí)研究者還發(fā)現(xiàn)RNA結(jié)合蛋白TNRC6A可以結(jié)合到circRNA circ0006916的側(cè)翼內(nèi)含子序列處,調(diào)控circRNA circ0006916的形成,同時(shí)RNA?pulldown實(shí)驗(yàn)也證實(shí)了兩者的結(jié)合,缺少TNRC6A則circRNA circ0006916不能有效成環(huán),表明TNRC6A的重要性,該研究成功地揭示了circRNA circ0006916上游的調(diào)控蛋白,較清晰地揭示了circRNA在細(xì)胞惡變過程中的作用機(jī)制。

3、has_circ_0001275:絕經(jīng)后骨質(zhì)疏松癥的潛在新型診斷生物標(biāo)記

論文標(biāo)題:Hsa_Circ_0001275: A Potential Novel Diagnostic Biomarker for Postmenopausal Osteoporosis

雜志:CELL PHYSIOL BIOCHEM
影響因子:5.1分

作者通訊單位:南方醫(yī)科大學(xué)

本研究研究對(duì)象為絕經(jīng)后骨質(zhì)疏松癥(PMOP)患者PBMCs細(xì)胞為研究對(duì)象,通過circRNA芯片實(shí)驗(yàn)篩選差異表達(dá)的circRNA,經(jīng)擴(kuò)大樣本,PCR驗(yàn)證6個(gè)差異表達(dá)的circRNAs,發(fā)現(xiàn)has_circ_0001275與患者年齡、體重、淋巴細(xì)胞,單核細(xì)胞和骨密度密切相關(guān),ROC曲線顯示has_circ_0001275在絕經(jīng)后骨質(zhì)疏松癥患者有較高的診斷價(jià)值(AUC=0.759,P<0.001),表明has_circ_0001275可作為PMOP的潛在診斷分子指標(biāo)。

4、非小細(xì)胞肺癌中的血漿標(biāo)志物

論文標(biāo)題:A novel plasma circular RNA circFARSA is a potential biomarker for non‐small cell lung cancer circFARSA

雜志:cancer medicine
影響因子:3.36

通訊作者單位:南京醫(yī)科大學(xué)

本研究主要考察非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者臨床樣本中circRNA差異表達(dá)變化,并分析是否可以作為潛在NSCLC診斷標(biāo)志物,通過RNA-seq技術(shù)在NSCLC組織樣本中發(fā)現(xiàn)共鑒定出5471個(gè)circRNA,其中185個(gè)顯著差異表達(dá),其中circFARSA起源于FARSA基因的5-7號(hào)外顯子,在肺癌組織中異常高表達(dá),qPCR進(jìn)一步在患者血漿樣本中發(fā)現(xiàn)circFARSA相對(duì)于健康人血漿樣本顯著高表達(dá),A549細(xì)胞中過表達(dá)circFARSA可顯著提高細(xì)胞的遷移和侵襲能力,生物信息預(yù)測發(fā)現(xiàn)circFARSA可吸附miR-330-5p和miR-326,釋放癌基因脂肪酸合成酶的表達(dá),或許是circFARSA促進(jìn)腫瘤發(fā)生的作用機(jī)制,也提示circFARSA可作為非小細(xì)胞肺癌的診斷標(biāo)志物。

參考文獻(xiàn)列表

2018年5月份上半月circRNA研究報(bào)道匯總-肽度TIMEDOO
2018年5月份上半月circRNA研究報(bào)道匯總-肽度TIMEDOO
2018年5月份上半月circRNA研究報(bào)道匯總-肽度TIMEDOO

文 | circRNA 吉賽生物

本文為作者授權(quán)肽度時(shí)界發(fā)布

僅為作者觀點(diǎn),不代表肽度時(shí)界立場,轉(zhuǎn)載請注明來源肽度時(shí)界