歡迎大家來(lái)到circRNA研究報(bào)道匯總，往期匯總文章可在本公眾號(hào)“近期文章”欄目中查閱，接下來(lái)我們一起瀏覽5月下半月circRNA研究有哪些進(jìn)展。

1、?circRNA從胞核中釋放出的機(jī)制研究

論文題目：A length-dependent evolutionarily conserved pathway controls nuclear export of circular RNAs

雜志：Genes Dev
影響因子：9.431分

通訊作者單位：佩雷爾曼醫(yī)學(xué)院

本文研究者來(lái)自賓夕法尼亞大學(xué)佩雷爾曼醫(yī)學(xué)院，他們重點(diǎn)關(guān)注了circRNA的轉(zhuǎn)錄后出核機(jī)制，這方面的研究還非常少，但并不意味著不重要，通過(guò)觀測(cè)circRNA的出核和細(xì)胞定位機(jī)制，可以幫助更好地理解circRNA的功能和分子機(jī)制。研究者通過(guò)果蠅shRNA篩選模型，發(fā)現(xiàn)Hel25E是介導(dǎo)circRNA轉(zhuǎn)錄后出核的重要調(diào)控因子，隨后在人中找到了Hel25E的同源蛋白UAP56 (DDX39B)?和URH49 (DDX39A)同樣可介導(dǎo)circRNA的出核，意味該現(xiàn)象可能是一種普遍機(jī)制，進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)一個(gè)有趣的現(xiàn)象，circRNA出核受circRNA本身序列長(zhǎng)度的影響。本文的具體解讀可參看我們公眾號(hào)“重磅！circRNA出核機(jī)制取得重大進(jìn)展”的微信文章。

圖1：circRNA（長(zhǎng)/短序列）出核分子機(jī)制示意圖（Hopper AK,et?al.2018. Genes Dev）

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2、?circRNA在Twist1調(diào)控肝癌轉(zhuǎn)移EMT過(guò)程中機(jī)制研究

論文題目：Twist1 regulates Vimentin through Cul2 circular RNA to promote EMT in hepatocellular carcinoma

雜志：Cancer Res
影響因子：9.122

通訊作者單位：南開大學(xué)

以往研究表明Twist是腫瘤轉(zhuǎn)移EMT過(guò)程中的非常重要轉(zhuǎn)錄因子之一，它可以上調(diào)波形蛋白Vimentin蛋白的表達(dá)，進(jìn)而促進(jìn)腫瘤發(fā)生上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化（EMT），但其中具體機(jī)制尚不清楚。Twist轉(zhuǎn)錄因子可以結(jié)合Cul2基因的啟動(dòng)子區(qū)域選擇性激活Cul2—circRNA（circ-10720）的表達(dá)，但不影響cul2?mRNA的表達(dá)水平。circ-10720與Twist表達(dá)水平、肝癌惡性程度正相關(guān)，circ-10720可通過(guò)吸附靶向vimentin蛋白的miRNA，提高vimentin的蛋白表達(dá)水平，敲低circ-10720后可抵消Twist促進(jìn)肝癌發(fā)展的進(jìn)程。TetOn-Twist1轉(zhuǎn)基因小鼠模型中同樣觀測(cè)到這種現(xiàn)象。該研究表明了circRNA在腫瘤EMT過(guò)程中的重要作用，也揭示了Twist上調(diào)Vimentin蛋白促進(jìn)肝癌轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制，為肝癌的治療了提供了潛在的分子靶標(biāo)。

圖2：circ-10720在Twist1調(diào)控肝癌轉(zhuǎn)移EMT過(guò)程中分子機(jī)制模式圖

3、circIRAK3通過(guò)吸附miR–3607促進(jìn)乳腺癌轉(zhuǎn)移

論文題目：CircIRAK3 sponges miR-3607 to facilitate breast cancer me tastasis

雜志：Cancer Lett
影響因子：6.375

通訊作者單位：南京醫(yī)科大學(xué)

腫瘤轉(zhuǎn)移是腫瘤致死的重要因素之一，揭示其分子機(jī)制，遏制腫瘤轉(zhuǎn)移一直是醫(yī)學(xué)科研的重要任務(wù)，但腫瘤轉(zhuǎn)移過(guò)程中涉及的分子機(jī)制異常復(fù)雜，本文研究者主要關(guān)注circRNA在乳腺癌轉(zhuǎn)移過(guò)程中的分子功能機(jī)制。研究者發(fā)現(xiàn)circIRAK3在乳腺癌轉(zhuǎn)移細(xì)胞中異常高表達(dá)，體外功能獲得性和缺失性研究發(fā)現(xiàn)，circIRAK3可促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移和侵襲，但不影響細(xì)胞增殖。RNA免疫沉淀和熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)表明circIRAK3可通過(guò)吸附miR-3607,下調(diào)其表達(dá)，進(jìn)一步研究表明circIRAK3/miR-3607的下游靶基因?yàn)镕OXC1，而FOXC1進(jìn)一步可結(jié)合到IRAK3的啟動(dòng)子區(qū)域，形成正反饋回路，維持circIRAK3/miR-3607/FOXC1通路的持續(xù)激活。該研究為乳腺癌的轉(zhuǎn)移治療提供了潛在新的circRNA治療靶標(biāo)。

圖3：circIRAK3通過(guò)miRNA?sponge功能調(diào)控FOXC1的表達(dá)

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4、人喉鱗狀細(xì)胞癌中circRNA的RNA-seq表達(dá)譜

論文題目：RNA-Seq profiling of circular RNAs in human laryngeal squamous cell carcinomas

雜志：Mol Cancer
影響因子：6.204

通訊作者單位：北京友誼醫(yī)院

人喉鱗狀細(xì)胞癌LSCC是起源于喉黏膜上皮組織的惡性腫瘤，是頭頸部腫瘤中惡性程度非常強(qiáng)的腫瘤，世界范圍內(nèi)每年發(fā)生率占比2.4%，近年內(nèi)還有逐漸增加趨勢(shì)。CircRNA作為一種新興的分子，在人體各組織中均有特異表達(dá)，參與機(jī)體的各類生理病理過(guò)程，本研究主要關(guān)注circRNA在LSCC疾病中的表達(dá)情況，通過(guò)RNA-seq高通量測(cè)序技術(shù)，研究者觀測(cè)分析了10例LSCC患者臨床標(biāo)本（2例高分化、3例為中分化、 5例正常）中的circRNA表達(dá)情況。共鑒定出21444個(gè)circRNA，其中在LSCC中顯著上調(diào)的circRNA 29個(gè)，顯著下調(diào)circRNA 19個(gè)，進(jìn)一步結(jié)合臨床特征（高分化，中分化和正常）進(jìn)行分類，將差異表達(dá)circRNA縮小到18個(gè)和5個(gè)。CircRNA-miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)分析，發(fā)現(xiàn)20個(gè)失調(diào)控circRNA與多種腫瘤相關(guān)的miRNA相關(guān)，信號(hào)通路KEGG富集分析發(fā)現(xiàn)，過(guò)氧化物酶體PPAR、軸突導(dǎo)向、Wnt和細(xì)胞周期通路與LSCC密切相關(guān)。隨后的qPCR驗(yàn)證結(jié)果顯示，circ:chr20:31876585–31,897,648可以很好區(qū)分LSCC標(biāo)本和正常標(biāo)本，表明circRNA作為L(zhǎng)SCC潛在理想標(biāo)志物。

圖4：LSCC樣本中circRNA差異表達(dá)譜

文獻(xiàn)列表

文 | circRNA 吉賽生物

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