PRINT:精準RNA介導的轉基因插入
一種名為PRINT的基于RNA的系統(tǒng)可以在人類基因組中創(chuàng)建并引入特定位置的安全且穩(wěn)定的轉基因。僅使用兩種體外轉錄的RNA,即“precise RNA-mediated insertion of transgenes”(PRINT),該系統(tǒng)通過位點特異性引導反轉錄,將轉基因直接合成到基因組的多拷貝安全區(qū)位點。這種基于RNA的策略可以降低有害的免疫反應,防范來自外源DNA的隨機基因組插入,適用于基因療法等用途,而且成本相對較低,生產(chǎn)迅速且可擴展。
研究論文《利用真核反轉座元件蛋白進行轉基因插入人類安全區(qū)位點》“Harnessing eukaryotic retroelement proteins for transgene insertion into human safe-harbor loci”?發(fā)表在《Nature Biotechnology》雜志上。
基于RNA的轉基因技術 一些非長末端重復(non-LTR)的反轉座元件利用RNA模板進行新基因合成,通過目標引導反轉錄(TPRT)將合成的互補DNA(cDNA)直接插入基因組,而不生成易于發(fā)生突變重連的鈍端雙鏈末端。
加州大學伯克利分校的共同主要作者張曉竹和Briana Van Treeck采用一種方法,利用編碼鳥類R2反轉座元件和經(jīng)驗證長度可達4kb的轉基因的RNA。R2蛋白協(xié)調地識別目標位點,在精確的位置切割一個鏈條,并為穩(wěn)定的轉基因插入啟動互補DNA合成。
PRINT專門插入多拷貝的核糖體RNA基因位點(rDNA),該基因由RNA聚合酶(RNAP)轉錄,已用于長期表達轉基因。由于目標序列位于每個基因組中數(shù)百個拷貝中,而在人類細胞中這些拷貝以串聯(lián)陣列形式存在于五對acrocentric染色體的短臂上,細胞功能不會受到幾個rDNA單位被插入元件導致的失活的妨礙。
在對培養(yǎng)的人類原代細胞系使用PRINT時,張和Van Treeck報告說,超過50%的細胞可以獲得幾個2kb的轉基因,其中超過50%是全長的。離靶事件和cDNA合成錯誤非常罕見,每大約10,000bp僅檢測到一個錯誤,與RNA和cDNA合成的預期保真度一致。
盡管上述結果構成了一種基于兩種體外轉錄的RNA的遞補人類基因組的傳遞方法的原理證明,但對于PRINT發(fā)展仍需解決關鍵的知識差距和方向。例如,監(jiān)測和減少對引入RNA的不良細胞反應將是至關重要的,需要在與疾病治療相關的背景下調查長期轉基因存在,以及需要研究和了解PRINT在包括非分裂細胞在內(nèi)的各種細胞類型中的效率。
作者建議,如果PRINT最終發(fā)展成為一種基因治療方法,它將是CRISPR–Cas基于基因破壞、堿基編輯和序列替代的補充,后者使用引導RNA將DNA合成和修復機制帶到內(nèi)源基因位點。
參考文獻:https://www.nature.com/articles/s41587-024-02137-y
編輯:王洪
排版:李麗


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