華大等破譯茶枝柑基因組圖譜,揭示“廣陳皮”活性成分合成調(diào)控機(jī)制
茶枝柑(新會柑),是歷經(jīng)700多年馴化栽培的柑橘變種,其果皮制干即為中藥“廣陳皮”,含有多種生物活性成分。多甲氧基黃酮[1]是廣陳皮中關(guān)鍵的藥用成分,但目前對其生物合成的遺傳基礎(chǔ)及調(diào)控機(jī)制的了解十分有限。
據(jù)肽度TIMEDOO獲悉,近日,華大生命科學(xué)研究院聯(lián)合華南農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國藥科大學(xué)、南京中醫(yī)藥大學(xué),通過多組學(xué)技術(shù)破譯了茶枝柑基因組的遺傳圖譜,揭示了多甲氧黃酮合成的潛在通路以及基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。該研究首次報道了一種新的酶基因,該基因被證實(shí)能夠直接合成具有抗腫瘤作用和抗神經(jīng)炎癥活性的多甲氧基黃酮化合物。本項(xiàng)研究為廣陳皮獨(dú)特的藥用成分形成及價值提供了科學(xué)支撐,相關(guān)成果于5月11日在國際學(xué)術(shù)期刊《自然·通訊》(Nature Communications)上發(fā)表。
Nature Communications官網(wǎng)截圖
首先,研究團(tuán)隊(duì)成功構(gòu)建了茶枝柑染色體級別的高質(zhì)量基因組圖譜,為茶枝柑遺傳育種和性狀改良提供數(shù)據(jù)支撐。從茶枝柑的基因組中,研究團(tuán)隊(duì)鑒定出了47個高可信度,且與多甲氧基黃酮合成直接相關(guān)的甲氧基轉(zhuǎn)移酶[2]基因,主要分布在3號染色體和9號染色體上。
茶枝柑基因組圖譜
每年的9月-12月是茶枝柑果皮采收的季節(jié),不同時間段采收的果皮制作出來的陳皮具有不同的功效。研究團(tuán)隊(duì)在廣陳皮的道地產(chǎn)區(qū)新會采集了茶枝柑不同發(fā)育時期的花、葉以及果實(shí)等組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組和代謝組測序研究,揭示了不同發(fā)育階段多甲氧基黃酮合成和積累的變化規(guī)律。研究人員在茶枝柑的不同組織中共發(fā)現(xiàn)29種多甲氧基黃酮化合物,其相對含量的變化與不同發(fā)育階段、不同組織中的甲氧基酶基因表達(dá)模式有關(guān),并且大多數(shù)化合物的相對含量在花后200天(9月)的果皮中達(dá)到最高,說明該時間段是茶枝柑果實(shí)采摘的適宜期。
不同發(fā)育時期的茶枝柑組織樣本
值得注意的是,研究團(tuán)隊(duì)首次發(fā)現(xiàn)一種新的甲氧基轉(zhuǎn)移酶基因CcOMT1,成功表征其活性,同時,通過實(shí)驗(yàn)證實(shí)該酶能夠催化合成具有抗腫瘤活性的化合物3,5,6,7,8,3′,4′-七甲氧基黃酮(HPMF),并能夠顯著改變茶枝柑果皮中該化合物的含量。因此,CcOMT1被認(rèn)為是茶枝柑中合成HPMF的候選酶,這是首次報道的可直接合成HPMF的甲氧基轉(zhuǎn)移酶。
此外,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)了多甲氧基黃酮合成基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的核心轉(zhuǎn)錄因子。這些轉(zhuǎn)錄因子能夠響應(yīng)干旱、鹽害等非生物脅迫,而這些環(huán)境壓力與茶枝柑的自然生長條件高度吻合。新會地區(qū)獨(dú)特的地理位置,為茶枝柑的生長提供了特有的鹽脅迫環(huán)境,這種環(huán)境條件對茶枝柑的生長發(fā)育和次生代謝產(chǎn)物的合成具有重要影響。
研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),與廣東惠州、臺山和廣西玉林等非道地產(chǎn)區(qū)相比,新會地區(qū)的茶枝柑中,關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)量顯著升高。這種表達(dá)模式的差異,促進(jìn)了多甲氧基黃酮合成相關(guān)基因的活性,從而增強(qiáng)了新會茶枝柑果實(shí)中多甲氧基黃酮的生物合成,為新會陳皮的高品質(zhì)形成提供了分子層面的解釋。
文章共同第一作者、深圳華大生命科學(xué)研究院副研究員王亞玉表示:“本次研究從‘基因挖掘—代謝物合成—轉(zhuǎn)錄調(diào)控’三個層次詳細(xì)闡述了廣陳皮活性成分多甲氧基黃酮的合成調(diào)控機(jī)制,為茶枝柑基因組輔助育種、活性成分工程化合成、藥材質(zhì)量保障及品質(zhì)提升奠定了堅(jiān)實(shí)的理論基礎(chǔ)?!?/p>
通過多組學(xué)數(shù)據(jù)相結(jié)合的方法可以加速藥用植物基因資源的挖掘。本研究是該課題組繼2023年3月在國際期刊《微生物組》上發(fā)表“微生物和土壤養(yǎng)分影響茶枝柑活性成分單萜積累”的文章后,再次通過基因組解析了茶枝柑活性成分合成的遺傳調(diào)控機(jī)制。
本項(xiàng)目在國家重點(diǎn)研發(fā)計劃(2019YFC1711002)常用中藥的核酸物質(zhì)分析及核酸標(biāo)記研究,廣東省重點(diǎn)領(lǐng)域研發(fā)計劃項(xiàng)目(2020B020221001)廣藿香等6種嶺南中藥材新品種培育研究等科技項(xiàng)目資助下完成。
文章鏈接:https://www.nature.com/articles/s41467-024-48235-y
[1]多甲氧基黃酮:一般指含有3個及以上甲氧基基團(tuán)的黃酮化合物,在柑橘屬植物當(dāng)中尤其豐富,以甜橙和茶枝柑所在的寬皮橘類為最。
[2]甲氧基轉(zhuǎn)移酶:多甲氧基黃酮合成的關(guān)鍵酶。
編輯:李麗


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