一個(gè)供研究人員共享危險(xiǎn)病毒基因組的新數(shù)據(jù)庫(kù)，有望解決許多阻礙現(xiàn)有方法的問(wèn)題。但前提是，必須說(shuō)服研究人員使用它。

據(jù)《自然》報(bào)道，這一名為Pathoplexus的數(shù)據(jù)庫(kù)于上個(gè)月啟動(dòng)，數(shù)據(jù)庫(kù)背后的科學(xué)家團(tuán)隊(duì)希望有更多研究人員分享已知和新出現(xiàn)的對(duì)公共衛(wèi)生具有重要意義的基因序列。

澳大利亞悉尼大學(xué)病毒學(xué)家Edward Holmes說(shuō)，盡可能快地共享序列對(duì)于識(shí)別新病毒、跟蹤其變異至關(guān)重要，同時(shí)也有助于疫苗設(shè)計(jì)。

Pathoplexus數(shù)據(jù)庫(kù)目前聚焦其他數(shù)據(jù)庫(kù)未包含的4種病毒：克里米亞-剛果出血熱病毒、蘇丹埃博拉病毒、扎伊爾埃博拉病毒和西尼羅河病毒。該團(tuán)隊(duì)表示，稍后還會(huì)在數(shù)據(jù)庫(kù)中添加其他病原體。

現(xiàn)有最大的數(shù)據(jù)庫(kù)之一是美國(guó)的GenBank，它允許無(wú)限制訪問(wèn)。但是無(wú)限制訪問(wèn)意味著理論上任何人都可以使用這些數(shù)據(jù)發(fā)表科學(xué)論文，而無(wú)需承認(rèn)數(shù)據(jù)所有者。這阻礙了科學(xué)家，特別是來(lái)自低收入國(guó)家的科學(xué)家在突發(fā)公共衛(wèi)生事件期間快速分享他們的數(shù)據(jù)。

另一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)GISAID要求用戶注冊(cè)，同意承認(rèn)數(shù)據(jù)所有者并盡力與所有者合作，旨在確保數(shù)據(jù)提交者的權(quán)利。GISAID一度非常受歡迎，但研究人員對(duì)其治理透明度、如何調(diào)解關(guān)于誠(chéng)信的爭(zhēng)議等提出了擔(dān)憂。

日本東京大學(xué)進(jìn)化病毒學(xué)家Spyros Lytras說(shuō)：“在過(guò)去幾年里，GISAID遇到了很多挫折?！钡茖W(xué)界也吸取了教訓(xùn)?！皬牧汩_(kāi)始是我們所需要的，Pathoplexus數(shù)據(jù)庫(kù)可能是解決方案。”

Pathoplexus數(shù)據(jù)庫(kù)為用戶提供了一些保護(hù)。例如，研究人員可以對(duì)他人如何使用他們的數(shù)據(jù)進(jìn)行限制，例如，不允許在沒(méi)有明確許可的情況下，在一年內(nèi)將他們的數(shù)據(jù)作為科學(xué)出版物的重點(diǎn)。這應(yīng)該為數(shù)據(jù)所有者留足了時(shí)間來(lái)提交他們的研究成果初稿。

用戶還必須在他們的出版物中注明數(shù)據(jù)所有者?！拔覀兊哪繕?biāo)是建立一個(gè)社區(qū)，讓研究人員確信他們的貢獻(xiàn)將得到尊重和適當(dāng)認(rèn)可。”Pathoplexus數(shù)據(jù)庫(kù)團(tuán)隊(duì)成員、全球基因組流行病學(xué)公共衛(wèi)生聯(lián)盟運(yùn)營(yíng)負(fù)責(zé)人Jamie Southgate說(shuō)。

Pathoplexus不會(huì)阻止違反使用條款的個(gè)人訪問(wèn)該網(wǎng)站，而GISAID在極少數(shù)情況下會(huì)這樣做。相反，如果發(fā)布的數(shù)據(jù)違反了條款，該團(tuán)隊(duì)將聯(lián)系期刊，確保數(shù)據(jù)按照共享方式使用。Pathoplexus數(shù)據(jù)庫(kù)的聯(lián)合創(chuàng)始人、瑞士熱帶和公共衛(wèi)生研究所分子流行病學(xué)家Emma Hodcroft說(shuō)：“我們盡力讓條款十分明確?！?/p>

孟加拉兒童健康研究基金會(huì)分子微生物學(xué)家Senjuti Saha同意聯(lián)系出版商的方法?！斑@是一個(gè)很好的、聰明的解決方案?！彼J(rèn)為，Pathoplexus數(shù)據(jù)庫(kù)的透明度將在科學(xué)界中建立信任。

Saha強(qiáng)調(diào)，現(xiàn)在說(shuō)Pathoplexus存儲(chǔ)庫(kù)能否解決當(dāng)前的數(shù)據(jù)共享問(wèn)題還為時(shí)過(guò)早?！暗@是非常棒的第一步?！?/p>

Pathoplexus的創(chuàng)建者盡力改進(jìn)用戶體驗(yàn)，例如盡可能簡(jiǎn)化上傳過(guò)程。Pathoplexus數(shù)據(jù)庫(kù)還會(huì)檢查序列數(shù)據(jù)和相關(guān)信息的錯(cuò)誤，并幫助將病毒組織成亞型。

目前，已經(jīng)有數(shù)千人訪問(wèn)了該數(shù)據(jù)庫(kù)，有50人創(chuàng)建了賬戶提交數(shù)據(jù)，但沒(méi)有人提交序列。為了擴(kuò)大規(guī)模，Pathoplexus數(shù)據(jù)庫(kù)團(tuán)隊(duì)需要獲得長(zhǎng)期資金。Hodcroft說(shuō)，現(xiàn)在的首要任務(wù)是吸引捐助者，“我抱著謹(jǐn)慎的希望”。

來(lái)源：中國(guó)科學(xué)報(bào)