歡迎各位來(lái)到“circRNA研究報(bào)道匯總”欄目,本期從pubmed中檢索收集最新發(fā)布的circRNA文獻(xiàn)22篇,下面我們一起來(lái)看看circRNA研究有哪些新進(jìn)展。

1、源自EML4-ALK融合基因的環(huán)狀RNA F-circEA-2a促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞遷移和侵襲

論文標(biāo)題Circular RNA F-circEA-2a derived from EML4-ALK fusion gene promotes cell migration and invasion in non-small cell lung cancer

雜志:Mol Cancer. 影響因子:7.776

通訊作者單位:四川大學(xué)華西醫(yī)院

NSCLC非小細(xì)胞肺癌約占肺癌中85%,NSCLC往往確診既是中晚期,5年生存率極低。NSCLC中通常存在原癌基因樣的融合基因,如EML4-ALK融合基因占NSCLC比例約4%-5%,EML4-ALK融合蛋白可激活A(yù)LK相關(guān)原癌基因信號(hào)通路促進(jìn)NSCLC發(fā)展,研究者前期發(fā)現(xiàn)EML4-ALK基因剪接體3b可產(chǎn)生一種融合的circRNA,F(xiàn)-circEA-4a可以促進(jìn)腫瘤發(fā)生發(fā)展。該研究中發(fā)現(xiàn)EML4-ALK產(chǎn)生的另一種融合circRNA,F(xiàn)-circEA-2a拼接位點(diǎn)處包含“AA”motif(F-circEA-4a是“AAAA”),F(xiàn)-circEA-2a主要定位在細(xì)胞質(zhì)促進(jìn)肺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移和侵襲,對(duì)細(xì)胞增殖影響不大。F-circEA-2a主要在NSCLC患者組織中,而不存在患者血液中,也突出了F-circEA-4a在體液篩查中作為標(biāo)志物的潛力。

目前融合基因產(chǎn)生的融合circRNA文章并不多,相信不久將來(lái)會(huì)發(fā)現(xiàn)更多有意思的融合circRNA分子。Cell雜志報(bào)道的融合circRNA文獻(xiàn)解讀可參看文章:cell雜志:融合環(huán)狀RNA文獻(xiàn)解讀

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圖注:F-circEA-2a在NSCLC中的鑒定,a:F-circEA-2a起源于EML4-ALK基因的事宜圖;b:RT-PCR和sanger測(cè)序驗(yàn)證F-circEA-2a的拼接位點(diǎn);c:斑點(diǎn)印跡和qPCR實(shí)驗(yàn)鑒定F-circEA-2a和4a在H2228細(xì)胞中的表達(dá)情況;d:qPCR實(shí)驗(yàn)分析F-circEA-2a/4a在H2228細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中的表達(dá)比例。

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2、環(huán)狀RNA hsa_circ_0008305(circPTK2)通過(guò)控制非小細(xì)胞肺癌中的TIF1γ抑制TGF-β誘導(dǎo)的上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)移

論文題目:Circular RNA hsa_circ_0008305 (circPTK2) inhibits TGF-β-induced epithelial-mesenchymal transition and metastasis by controlling TIF1γ in non-small cell lung cancer.

雜志:Mol Cancer 影響因子:7.776

通訊作者單位:蘇州大學(xué)醫(yī)學(xué)院

在非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)中,TGF-β通過(guò)誘導(dǎo)上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)來(lái)促進(jìn)腫瘤侵襲和轉(zhuǎn)移?,F(xiàn)有研究表明環(huán)狀RNA(circRNA)是涉及人類癌癥的非常重要的一類RNA分子。然而,circRNA是否以及如何促成TGF-β誘導(dǎo)的EMT和NSCLC轉(zhuǎn)移仍然模糊不清。該研究發(fā)現(xiàn)hsa_circ_0008305(circPTK2)在TGF-β誘導(dǎo)的EMT和腫瘤轉(zhuǎn)移中,circPTK2和轉(zhuǎn)錄中間因子1γ(TIF1γ)之間互作發(fā)揮調(diào)控作用。研究結(jié)果表明:CircPTK2和TIF1γ在經(jīng)TGF-β誘導(dǎo)的EMT的NSCLC細(xì)胞中顯著下調(diào)。CircPTK2過(guò)表達(dá)則可增加TIF1γ表達(dá),抑制TGF-β誘導(dǎo)的EMT和NSCLC細(xì)胞侵襲能力,而circPTK2敲低則具有相反的作用。CircPTK2可海綿樣吸附miR-429 / miR-200b-3p,而miR-429 / miR-200b-3p則可通過(guò)靶向TIF1γ促進(jìn)TGF-β誘導(dǎo)的EMT和NSCLC細(xì)胞侵襲。CircPTK2過(guò)表達(dá)顯著降低了Snail的表達(dá),Snail是TGF-β/ Smad信號(hào)傳導(dǎo)的重要下游轉(zhuǎn)錄激活因子。在體內(nèi)轉(zhuǎn)移模型實(shí)驗(yàn)中,circPTK2過(guò)表達(dá)可抑制NSCLC細(xì)胞轉(zhuǎn)移。此外,人NSCLC組織中circPTK2表達(dá)顯著下調(diào)與TIF1γ表達(dá)正相關(guān)。特別是,轉(zhuǎn)移性NSCLC組織中circPTK2顯著性低于非轉(zhuǎn)移組織。研究結(jié)果表明,circPTK2(hsa_circ_0008305)通過(guò)控制NSCLC中的TIF1γ來(lái)抑制TGF-β誘導(dǎo)的EMT和轉(zhuǎn)移,揭示了circRNA調(diào)節(jié)TGF-β誘導(dǎo)的EMT和腫瘤轉(zhuǎn)移的新機(jī)制,并提示circPTK2過(guò)表達(dá)可為惡性NSCLC治療提供線索。

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圖注:在TGF-β誘導(dǎo)的NSCLC細(xì)胞EMT過(guò)程中TIF1γ 和circPTK2表達(dá)下調(diào)。a:TGF-β1(5ng / ml)處理24小時(shí)后,A549細(xì)胞發(fā)生上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)。觀察細(xì)胞形態(tài)并用相差顯微鏡(上圖)拍照,比例尺,50μm。通過(guò)蛋白質(zhì)印跡檢查EMT相關(guān)蛋白的表達(dá),包括E-鈣粘蛋白E-cadherin,N-鈣粘蛋白N-cadherin和波形蛋白Vimentin(左下)和TIF1γ蛋白(右下)。b:circRNA芯片檢測(cè)TGF-β1處理0小時(shí)或24小時(shí)的兩組A549細(xì)胞檢測(cè)繪制circRNA表達(dá)層次聚類熱圖,circPTK2(hsa_circRNA_104703)的表達(dá)用箭頭表示。cdef:RT-PCR,sanger測(cè)序,northblot和免疫熒光實(shí)驗(yàn)鑒定circPTK2(hsa_circRNA_104703)特異性存在,并主要分布在細(xì)胞質(zhì)中。

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3、CircRNA微陣列分析鑒定用于檢測(cè)胃癌的新型循環(huán)生物標(biāo)志物

論文題目:CircRNA microarray profiling identifies a novel circulating biomarker for detection of gastric cancer

雜志:Mol Cancer. 影響因子:7.776

通訊作者單位:南京醫(yī)科大學(xué)南京第一醫(yī)院

該研究前期通過(guò)circRNA高通量篩選胃癌患者血漿中circRNA差異分子,并鑒定到circ-KIAA124在胃癌中低表達(dá),結(jié)合臨床資料分析發(fā)現(xiàn)circ-KIAA1244與TNM分期、淋巴轉(zhuǎn)移和患者總體存活時(shí)間長(zhǎng)成負(fù)相關(guān),同時(shí)在血漿外泌體中也檢測(cè)到circ-KIAA1244,提示該分子可作為胃癌分子診斷的新型標(biāo)志物。通過(guò)circBank數(shù)據(jù)庫(kù)的進(jìn)一步預(yù)測(cè)分析發(fā)現(xiàn)circ-KIAA1244互作的circRNA-miRNA-mRNA分子網(wǎng)絡(luò)。為后續(xù)深入研究circ-KIAA1244分子機(jī)制研究提供了線索。該文獻(xiàn)具體解讀文章見歷史文章:circBank助力胃癌研究發(fā)表于Molecular Cancer。

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圖注:circ-KIAA1244作為胃癌診斷標(biāo)志物的理論模型示意圖

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