歡迎各位來到“circRNA研究報道匯總”欄目,本期從pubmed中檢索收集最新發(fā)布的circRNA文獻22篇,下面我們一起來看看circRNA研究有哪些新進展。

1、源自EML4-ALK融合基因的環(huán)狀RNA F-circEA-2a促進非小細胞肺癌細胞遷移和侵襲

論文標題Circular RNA F-circEA-2a derived from EML4-ALK fusion gene promotes cell migration and invasion in non-small cell lung cancer

雜志:Mol Cancer. 影響因子:7.776

通訊作者單位:四川大學華西醫(yī)院

NSCLC非小細胞肺癌約占肺癌中85%,NSCLC往往確診既是中晚期,5年生存率極低。NSCLC中通常存在原癌基因樣的融合基因,如EML4-ALK融合基因占NSCLC比例約4%-5%,EML4-ALK融合蛋白可激活ALK相關原癌基因信號通路促進NSCLC發(fā)展,研究者前期發(fā)現(xiàn)EML4-ALK基因剪接體3b可產(chǎn)生一種融合的circRNA,F(xiàn)-circEA-4a可以促進腫瘤發(fā)生發(fā)展。該研究中發(fā)現(xiàn)EML4-ALK產(chǎn)生的另一種融合circRNA,F(xiàn)-circEA-2a拼接位點處包含“AA”motif(F-circEA-4a是“AAAA”),F(xiàn)-circEA-2a主要定位在細胞質(zhì)促進肺癌細胞轉移和侵襲,對細胞增殖影響不大。F-circEA-2a主要在NSCLC患者組織中,而不存在患者血液中,也突出了F-circEA-4a在體液篩查中作為標志物的潛力。

目前融合基因產(chǎn)生的融合circRNA文章并不多,相信不久將來會發(fā)現(xiàn)更多有意思的融合circRNA分子。Cell雜志報道的融合circRNA文獻解讀可參看文章:cell雜志:融合環(huán)狀RNA文獻解讀

9月下半月circRNA研究報道匯總-肽度TIMEDOO

圖注:F-circEA-2a在NSCLC中的鑒定,a:F-circEA-2a起源于EML4-ALK基因的事宜圖;b:RT-PCR和sanger測序驗證F-circEA-2a的拼接位點;c:斑點印跡和qPCR實驗鑒定F-circEA-2a和4a在H2228細胞中的表達情況;d:qPCR實驗分析F-circEA-2a/4a在H2228細胞質(zhì)和細胞核中的表達比例。

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2、環(huán)狀RNA hsa_circ_0008305(circPTK2)通過控制非小細胞肺癌中的TIF1γ抑制TGF-β誘導的上皮-間質(zhì)轉化和轉移

論文題目:Circular RNA hsa_circ_0008305 (circPTK2) inhibits TGF-β-induced epithelial-mesenchymal transition and metastasis by controlling TIF1γ in non-small cell lung cancer.

雜志:Mol Cancer 影響因子:7.776

通訊作者單位:蘇州大學醫(yī)學院

在非小細胞肺癌(NSCLC)中,TGF-β通過誘導上皮-間質(zhì)轉化(EMT)來促進腫瘤侵襲和轉移?,F(xiàn)有研究表明環(huán)狀RNA(circRNA)是涉及人類癌癥的非常重要的一類RNA分子。然而,circRNA是否以及如何促成TGF-β誘導的EMT和NSCLC轉移仍然模糊不清。該研究發(fā)現(xiàn)hsa_circ_0008305(circPTK2)在TGF-β誘導的EMT和腫瘤轉移中,circPTK2和轉錄中間因子1γ(TIF1γ)之間互作發(fā)揮調(diào)控作用。研究結果表明:CircPTK2和TIF1γ在經(jīng)TGF-β誘導的EMT的NSCLC細胞中顯著下調(diào)。CircPTK2過表達則可增加TIF1γ表達,抑制TGF-β誘導的EMT和NSCLC細胞侵襲能力,而circPTK2敲低則具有相反的作用。CircPTK2可海綿樣吸附miR-429 / miR-200b-3p,而miR-429 / miR-200b-3p則可通過靶向TIF1γ促進TGF-β誘導的EMT和NSCLC細胞侵襲。CircPTK2過表達顯著降低了Snail的表達,Snail是TGF-β/ Smad信號傳導的重要下游轉錄激活因子。在體內(nèi)轉移模型實驗中,circPTK2過表達可抑制NSCLC細胞轉移。此外,人NSCLC組織中circPTK2表達顯著下調(diào)與TIF1γ表達正相關。特別是,轉移性NSCLC組織中circPTK2顯著性低于非轉移組織。研究結果表明,circPTK2(hsa_circ_0008305)通過控制NSCLC中的TIF1γ來抑制TGF-β誘導的EMT和轉移,揭示了circRNA調(diào)節(jié)TGF-β誘導的EMT和腫瘤轉移的新機制,并提示circPTK2過表達可為惡性NSCLC治療提供線索。

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圖注:在TGF-β誘導的NSCLC細胞EMT過程中TIF1γ 和circPTK2表達下調(diào)。a:TGF-β1(5ng / ml)處理24小時后,A549細胞發(fā)生上皮-間質(zhì)轉化(EMT)。觀察細胞形態(tài)并用相差顯微鏡(上圖)拍照,比例尺,50μm。通過蛋白質(zhì)印跡檢查EMT相關蛋白的表達,包括E-鈣粘蛋白E-cadherin,N-鈣粘蛋白N-cadherin和波形蛋白Vimentin(左下)和TIF1γ蛋白(右下)。b:circRNA芯片檢測TGF-β1處理0小時或24小時的兩組A549細胞檢測繪制circRNA表達層次聚類熱圖,circPTK2(hsa_circRNA_104703)的表達用箭頭表示。cdef:RT-PCR,sanger測序,northblot和免疫熒光實驗鑒定circPTK2(hsa_circRNA_104703)特異性存在,并主要分布在細胞質(zhì)中。

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3、CircRNA微陣列分析鑒定用于檢測胃癌的新型循環(huán)生物標志物

論文題目:CircRNA microarray profiling identifies a novel circulating biomarker for detection of gastric cancer

雜志:Mol Cancer. 影響因子:7.776

通訊作者單位:南京醫(yī)科大學南京第一醫(yī)院

該研究前期通過circRNA高通量篩選胃癌患者血漿中circRNA差異分子,并鑒定到circ-KIAA124在胃癌中低表達,結合臨床資料分析發(fā)現(xiàn)circ-KIAA1244與TNM分期、淋巴轉移和患者總體存活時間長成負相關,同時在血漿外泌體中也檢測到circ-KIAA1244,提示該分子可作為胃癌分子診斷的新型標志物。通過circBank數(shù)據(jù)庫的進一步預測分析發(fā)現(xiàn)circ-KIAA1244互作的circRNA-miRNA-mRNA分子網(wǎng)絡。為后續(xù)深入研究circ-KIAA1244分子機制研究提供了線索。該文獻具體解讀文章見歷史文章:circBank助力胃癌研究發(fā)表于Molecular Cancer。

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圖注:circ-KIAA1244作為胃癌診斷標志物的理論模型示意圖

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文獻列表:

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來源:geneseed