歡迎各位來到“circRNA研究報(bào)道匯總”欄目,本期從pubmed中檢索收集最新發(fā)布的circRNA文獻(xiàn)19篇,下面我們一起來看看circRNA研究有哪些新進(jìn)展。

1、環(huán)狀RNAPRMT5通過吸附miR-30c誘導(dǎo)上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化促進(jìn)膀胱尿路上皮癌轉(zhuǎn)移

論文標(biāo)題PRMT5 circular RNA promotes metastasis of urothelial carcinoma of the bladder through sponging miR-30c to induce epithelial-mesenchymal transition

雜志:Clin Cancer Res. 影響因子:10.199

通訊作者單位:中山大學(xué)癌癥中心

環(huán)狀RNA(circRNA)是一類新的RNA分子,最近其在人類癌癥的發(fā)病機(jī)制中引起了很多關(guān)注。然而,circRNA在癌細(xì)胞上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)中的作用仍不清楚。該研究中,研究者鑒定出調(diào)節(jié)膀胱尿路上皮癌(UCB)細(xì)胞EMT的新型circRNA,并探討其在UCB中的調(diào)節(jié)機(jī)制和臨床意義。研究者首先使用circRNA微陣芯片在成對(duì)的UCB和正常組織中篩選circRNA表達(dá)譜,最終篩選出在大量UCB患者中上調(diào)的circRNA(circPRMT5)的臨床意義。研究者進(jìn)一步研究了circPRMT5在UCB細(xì)胞EMT中的功能和潛在機(jī)制。此外,研究者結(jié)合自己研究數(shù)據(jù)和癌癥基因組圖譜(TCGA)的兩個(gè)獨(dú)立隊(duì)列中評(píng)估了circPRMT5對(duì)miR-30c及其靶基因SNAIL1和E-鈣粘蛋白的調(diào)節(jié)作用。結(jié)果顯示circPRMT5的上調(diào)表達(dá)與UCB患者的晚期臨床分期和更差的存活率呈正相關(guān)。我們進(jìn)一步揭示circPRMT5通過海綿樣吸附miR-30c促進(jìn)UCB細(xì)胞EMT。來自兩個(gè)獨(dú)立UCB群組的臨床分析顯示,circPRMT5 / miR-30c / SNAIL1 / E-鈣粘蛋白途徑對(duì)于支持UCBs進(jìn)展是必需的。重要的是,我們發(fā)現(xiàn)circPRMT5在UCB患者的血清和尿外泌體中上調(diào),并且與腫瘤轉(zhuǎn)移顯著相關(guān)。綜上結(jié)論表明CircPRMT5在促進(jìn)UCB細(xì)胞EMT和/或侵襲性方面發(fā)揮關(guān)鍵作用,并且是該疾病的預(yù)后生物標(biāo)志物,表明circPRMT5可以作為UCB患者的潛在治療靶標(biāo)。

10月上半月circRNA研究報(bào)道匯總-肽度TIMEDOO

圖注:UCB疾病中CircPRMT5調(diào)控miR-30c/SANIL1/E-cadherin影響UCB進(jìn)程

A:CircPRMT5與miR-30c的表達(dá)水平成負(fù)相關(guān)(來自SYSUCC的UCB患者樣本);

B:CircPRMT5與SNAIL1的表達(dá)水平成正相關(guān)(來自SYSUCC的UCB患者樣本);

C:CircPRMT5與E-cadherin的表達(dá)水平成負(fù)相關(guān)(來自SYSUCC的UCB患者樣本);

D:miR-30c差異表達(dá)水平的kaplan meier曲線分析,UCB患者中整體生存(左)和DFS(右)的分析(P<0.01,log-rank分析)結(jié)果(來自TCGA數(shù)據(jù));

E:qPCR檢測miR-30c在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和非轉(zhuǎn)移UCB樣本中的表達(dá)情況分析(來自TCGA數(shù)據(jù));

F:miR-30c表達(dá)水平與SNAIL1表達(dá)呈負(fù)相關(guān)(來自SYSUCC和TCGA數(shù)據(jù));

G:SNAIL1與E-cadherin的表達(dá)水平成負(fù)相關(guān)(來自SYSUCC和TCGA數(shù)據(jù));

H:CircPRMT5調(diào)控miR-30c/SANIL1/E-cadherin的ceRNA機(jī)制抑制UCB細(xì)胞EMT和侵襲假說;

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2、環(huán)狀RNA BCRC-3通過miR-182-5p/p27軸抑制膀胱癌增殖

論文標(biāo)題:Circular RNA BCRC-3 suppresses bladder cancer proliferation through miR-182-5p/p27 axis

雜志:Mol Cancer 影響因子:7.776

通訊作者單位:華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院

背景最近研究表明環(huán)狀RNA(circRNA)是基因表達(dá)的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子。我們之前的研究已經(jīng)確定了circHIPK3與膀胱癌分級(jí),侵襲以及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移之間的負(fù)相關(guān)。然而,circRNA在膀胱癌細(xì)胞增殖中的作用很大程度上仍然未知。

方法我們通過高通量測序技術(shù)在人體組織中分析了circRNA表達(dá)情況,并確定了膀胱癌相關(guān)的circRNA-3(BCRC-3,GenBank:KU921434.1),BCRC-3是來源自PSMD1基因的新circRNA。通過定量實(shí)時(shí)PCR技術(shù)檢測人組織和細(xì)胞中circRNA,mRNA和miRNA的表達(dá)水平。通過在體外和體內(nèi)用質(zhì)粒轉(zhuǎn)染來研究BCRC-3對(duì)癌細(xì)胞的作用。應(yīng)用RNA-pulldown試驗(yàn),熒光素酶報(bào)告基因檢測和熒光原位雜交來驗(yàn)證BCRC-3與microRNA之間的相互作用。通過流式細(xì)胞術(shù),蛋白質(zhì)印跡和qRT-PCR測量茉莉酸甲酯(MJ)的抗癌作用。

結(jié)果BCRC-3在膀胱癌組織和細(xì)胞系中低表達(dá)。在體外和體內(nèi)中,BCRC-3的過表達(dá)可抑制BC細(xì)胞的增殖。在機(jī)制上,BCRC-3的過表達(dá)誘導(dǎo)細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶抑制劑1B的表達(dá)(p27)。BCRC-3可以直接與miR-182-5p相互作用,并隨后充當(dāng)miRNA海綿樣吸附作用以促進(jìn)p27活性。此外,MJ顯著增加BCRC-3的表達(dá),導(dǎo)致p27的明顯上調(diào)。

結(jié)論BCRC-3作為腫瘤抑制劑起作用,通過miR-182-5p / p27軸抑制BC細(xì)胞增殖,BCRC-3是BC治療的潛在新靶標(biāo)。

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圖注:BCRC-3在膀胱癌細(xì)胞中的調(diào)控通路示意圖

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3、circDiaph3調(diào)節(jié)大鼠血管平滑肌細(xì)胞分化,增殖和遷移

論文標(biāo)題:circDiaph3 regulates rat vascular smooth muscle cell differentiation, proliferation, and migration

雜志:FASEB J. 影響因子5.595

通訊作者單位:西南醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院

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血管損傷是由心血管疾病的診斷或治療程序引起的血管再狹窄的主要原因,而血管損傷主要表現(xiàn)為血管內(nèi)膜增生。已有報(bào)道表明環(huán)狀RNA(circRNA)與多種心血管疾病有關(guān),但血管內(nèi)膜中circRNA的表達(dá)尚未見詳細(xì)報(bào)道。在這項(xiàng)研究中,我們建立了球囊損傷的大鼠頸動(dòng)脈模型,并用微陣列芯片檢測了頸動(dòng)脈中circRNA的表達(dá)。我們發(fā)現(xiàn)健康組的頸動(dòng)脈和受損動(dòng)脈的circRNA表達(dá)譜有顯著差異。我們研究了rno-circ_005717(circDiaph3)在大鼠血管平滑肌細(xì)胞(VSMC)分化中的作用,敲低circDiaph3可上調(diào)formin-3(維持細(xì)胞骨架肌動(dòng)蛋白的重要調(diào)節(jié)因子)蛋白水平,促進(jìn)VSMC分化為收縮型。此外,circDiaph3可上調(diào)Igf1r的轉(zhuǎn)錄并支持VSMC的增殖和遷移。研究結(jié)果表明circDiaph3可能是對(duì)抗內(nèi)膜增生的分子靶點(diǎn)。

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圖注:血管損傷后circDiaph3調(diào)控血管生成示意圖

正常情況下,Diaph3會(huì)促進(jìn)VSMCs中收縮標(biāo)記的合成。在動(dòng)脈損傷后,circDiaph3增加,導(dǎo)致線性Diaph3的mRNA相對(duì)減少,進(jìn)而Diaph3蛋白合成下降。因此,VSMCs表現(xiàn)特征是收縮標(biāo)記的減少,膠原蛋白合成的升高,以及細(xì)胞增殖和遷移的增加。在血管損傷后,VSMCs中miR-148a-5p的表達(dá)減少miR-148a-5p靶向的Igf1r的mRNA,Igf1r蛋白減少。此外,circDiaph3通過ceRNA機(jī)制與胞質(zhì)中游離的miR-148a-5p結(jié)合,從而減少了miR-148a-5p的活性。miR-148a-5p的豐度和活性的減少,在VSMCs中引發(fā)了Igf1r轉(zhuǎn)錄的升高,從而通過IGF-1信號(hào)通路促進(jìn)血管內(nèi)膜增生。

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4、通過微陣列揭示喉鱗狀細(xì)胞癌中的環(huán)狀RNA表達(dá)譜

Circular RNA Expression Profile in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma Revealed by Microarray.

雜志:Cell Physiol Biochem 影響因子:5.5

通訊作者單位:中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院

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背景:越來越多的證據(jù)表明環(huán)狀RNA(circRNAs)在基因表達(dá)調(diào)控中具有重要功能,并且它們的調(diào)節(jié)異常與各種類型的癌癥有關(guān)。然而,circRNA在喉癌中的作用仍然很大程度上未知。該研究調(diào)查了喉鱗狀細(xì)胞癌(LSCC)中circRNA表達(dá)模式的全局變化,以鑒定潛在的差異表達(dá)的circRNA。

方法:在LSCC和成對(duì)的正常喉組織中微陣列芯片法測定circRNA表達(dá),篩選出的差異表達(dá)的circRNA的進(jìn)行功能富集分析。通過實(shí)時(shí)定量PCR驗(yàn)證候選circRNA和微小RNA(miRNA)的表達(dá)水平。使用生物信息學(xué)方法構(gòu)建circRNA / miRNA相互作用網(wǎng)絡(luò),以預(yù)測miRNA與circRNA的結(jié)合。

結(jié)果:我們從人LSCC和正常喉粘膜組織中鑒定出506個(gè)差異表達(dá)的circRNA,證實(shí)hsa_circ_0044520和hsa_circ_0044529在LSCC組織中顯著上調(diào)。hsa_ circ_0044520和hsa_circ_0044529的最可能的潛在靶miRNA分別是hsa-miR-4726-5p和hsa-miR-4640-5p。功能分析顯示hsa_circ_0044520和hsa_circ_0044529參與膠原合成過程。

結(jié)論:競爭性內(nèi)源性RNA網(wǎng)絡(luò)預(yù)測和生物信息學(xué)功能分析表明,hsa_circ_0044520和hsa_circ_0044529通過競爭性吸附hsa-miR-4726-5p和hsa-miR-4640-5p發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用,該研究為LSCC的腫瘤發(fā)生提供新的見解。

10月上半月circRNA研究報(bào)道匯總-肽度TIMEDOO

圖注:hsa_circ_0044520和hsa_circ_0044529通過競爭性吸附hsa-miR-4726-5p和hsa-miR-4640-5p調(diào)控喉癌LSCC形成的可能分子機(jī)制

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文獻(xiàn)列表:

序號(hào) 主要內(nèi)容 論文標(biāo)題 雜志

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單位
1 環(huán)狀RNA-PRMT5通過吸附miR-30c誘導(dǎo)上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化并促進(jìn)膀胱尿路上皮癌轉(zhuǎn)移 PRMT5 circular RNA promotes metastasis of urothelial carcinoma of the bladder through sponging miR-30c to induce epithelial-mesenchymal transition. Clin Cancer Res. 10.199 中山大學(xué)癌癥中心
2 環(huán)狀RNA BCRC-3通過miR-182-5p / p27軸抑制膀胱癌增殖 Circular RNA BCRC-3 suppresses bladder cancer proliferation through miR-182-5p/p27 axis Mol Cancer 7.776 華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院
3 circDiaph3調(diào)節(jié)大鼠血管平滑肌細(xì)胞分化,增殖和遷移 circDiaph3 regulates rat vascular smooth muscle cell differentiation, proliferation, and migration FASEB J. 5.595 西南醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院
4 通過微陣列揭示喉鱗狀細(xì)胞癌中的環(huán)狀RNA表達(dá)譜 Circular RNA Expression Profile in Laryngeal Squamous Cell Carcinoma Revealed by Microarray. Cell Physiol Biochem 5.5 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院
5 環(huán)狀RNA表達(dá)譜及其在銀屑病中的潛在功能分析 Circular RNA Expression Profile and Analysis of Their Potential Function in Psoriasis Cell Physiol Biochem 5.5 山東大學(xué)齊魯醫(yī)院
6 環(huán)狀RNA:心血管疾病的方法學(xué)挑戰(zhàn)和觀點(diǎn) Circular RNAs: Methodological challenges and perspectives in cardiovascular diseases J Cell Mol Med 4.302 意大利 IRCCS
7 輻射誘導(dǎo)的食管損傷大鼠模型中的circRNA和miRNA表達(dá)分析 Profiling circRNA and miRNA of radiation-induced esophageal injury in a rat model. Sci Rep 4.122 山東大學(xué)醫(yī)學(xué)院
8 circRNA表達(dá)譜的變化與大腸桿菌F17在羔羊脾臟中的拮抗作用有關(guān) Changes in circRNA expression profiles related to the antagonistic effects of Escherichia coli F17 in lamb spleens Sci Rep 4.122 揚(yáng)州大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院
9 Hsa_circ_101280通過調(diào)節(jié)miR-375 / JAK2來促進(jìn)肝細(xì)胞癌增殖 Hsa_circ_101280 promotes hepatocellular carcinoma by regulating miR-375/JAK2 Immunol Cell Biol. 3.795 泰山醫(yī)科大學(xué)
10 由傳染性胃腸炎病毒誘導(dǎo)的差異表達(dá)的非編碼RNA調(diào)節(jié)豬腸上皮細(xì)胞系中的炎癥和NF-κB途徑 Differentially expressed non-coding RNAs induced by transmissible gastroenteritis virus potentially regulate inflammation and NF-κB pathway in porcine intestinal epithelial cell line BMC Genomics. 3.73 西北農(nóng)林科技大學(xué)
11 環(huán)狀RNA分析顯示circEXOC6B和circN4BP2L2是上皮性卵巢癌的新型預(yù)后生物標(biāo)志物 Circular RNA profiling reveals circEXOC6B and circN4BP2L2 as novel prognostic biomarkers in epithelial ovarian cancer Int J Oncol 3.333 北京協(xié)和醫(yī)院
12 高通量測序和生物信息學(xué)分析揭示舌癌中環(huán)狀RNA的差異表達(dá) Profiling and bioinformatics analyses reveal differential expression of circular RNA in tongue cancer revealed by high-throughput sequencing J Cell Biochem 2.959 南通大學(xué)耳鼻咽喉科
13 CircRNAs在骨關(guān)節(jié)炎中的潛在作用:即將到來的尋找寶藏的旅程 The Potential Roles of CircRNAs in Osteoarthritis: A Coming Journey to Find a Treasure Biosci Rep 2.889 中山大學(xué)附屬第五醫(yī)院
14 環(huán)狀RNA在特發(fā)性肺纖維化中的潛在調(diào)節(jié)作用 Potential regulatory role of circular RNA in idiopathic pulmonary fibrosis Int J Mol Med 2.784 濱州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院
15 環(huán)狀RNA和mRNA分析揭示了禽白血病病毒中的競爭性內(nèi)源RNA網(wǎng)絡(luò),亞群J誘導(dǎo)的雞的腫瘤發(fā)生。 Circular RNA and mRNA profiling reveal competing endogenous RNA networks during avian leukosis virus, subgroup J-induced tumorigenesis in chickens. PLoS One 2.766 揚(yáng)州大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院
16 鞘內(nèi)circHIPK3 shRNA減輕糖尿病大鼠的神經(jīng)性疼痛。 Intrathecal circHIPK3 shRNA alleviates neuropathic pain in diabetic rats. Biochem Biophys Res Commun. 2.559 內(nèi)蒙古呼和浩特市人民醫(yī)院
17 circ-UBAP2上調(diào)提示三陰性乳腺癌不良預(yù)后,并通過miR-661/MTA1途徑促進(jìn)三陰性乳腺癌進(jìn)展 Upregulation of circ-UBAP2 predicts poor prognosis and promotes triple-negative breast cancer progression through the miR-661/MTA1 pathway Biochem Biophys Res Commun. 2.559 西安培華學(xué)院
18 CircRNA_001569通過吸附miR-145促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖 CircRNA_001569 promotes cell proliferation through absorbing miR-145 in gastric cancer J Biochem. 2.35 開封市中心醫(yī)院
19 三七葉總皂苷通過調(diào)節(jié)circRNA表達(dá)抑制小鼠慢性不可預(yù)測的輕度應(yīng)激模型 Total saponins from the leaves of Panax notoginseng inhibit depression on mouse chronic unpredictable mild stress model by regulating circRNA expression. Brain Behav 2.219 嶺南師范大學(xué)

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