EMBO Reports | 蔣輝實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)線(xiàn)粒體應(yīng)激反應(yīng)維持線(xiàn)粒體膜電位并解析其分子機(jī)制
2021年3月3日,北京生命科學(xué)研究所/清華大學(xué)生物醫(yī)學(xué)交叉研究院蔣輝實(shí)驗(yàn)室在《EMBO Reports》在線(xiàn)發(fā)表了題為“OXPHOS deficiency activates global adaptation pathways to maintain mitochondrial membrane potential”的研究論文。該論文以酵母細(xì)胞為模型,揭示了線(xiàn)粒體氧化磷酸化缺陷情況下,細(xì)胞啟動(dòng)適應(yīng)性反應(yīng)維持線(xiàn)粒體膜電位的分子機(jī)制。
線(xiàn)粒體是細(xì)胞的能量供應(yīng)和代謝中樞。線(xiàn)粒體呼吸鏈通過(guò)電子傳遞在線(xiàn)粒體內(nèi)膜兩側(cè)建立起膜電位(ΔΨm)。線(xiàn)粒體膜電位執(zhí)行諸多重要功能,包括驅(qū)動(dòng)ATP合成,幫助線(xiàn)粒體前體蛋白和部分代謝物的跨內(nèi)膜轉(zhuǎn)運(yùn)等。線(xiàn)粒體最核心的功能之一是合成鐵硫簇(iron-sulfur cluster)—一種細(xì)胞必不可少的輔酶。鐵硫簇在線(xiàn)粒體基質(zhì)合成,供應(yīng)給線(xiàn)粒體,細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核內(nèi)的鐵硫蛋白作為輔酶;這些鐵硫蛋白包括DNA聚合酶、核糖體循環(huán)因子等看家酶(housekeeping enzymes)。鐵硫簇合成通路蛋白和原料亞鐵離子依賴(lài)膜電位轉(zhuǎn)運(yùn)進(jìn)線(xiàn)粒體基質(zhì)。因此,線(xiàn)粒體膜電位的維持對(duì)于細(xì)胞的存活和增值至關(guān)重要。
領(lǐng)域內(nèi)過(guò)去的研究表明呼吸鏈缺失的線(xiàn)粒體通過(guò)水解ATP(來(lái)自糖酵解)來(lái)維持膜電位。該機(jī)制從酵母到哺乳動(dòng)物細(xì)胞都高度保守。線(xiàn)粒體呼吸鏈缺失同時(shí)激活細(xì)胞應(yīng)激反應(yīng)(mitochondrial stress response),但應(yīng)激反應(yīng)是否參與膜電位維持并不清楚。蔣輝實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建了缺失呼吸鏈復(fù)合物Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ和線(xiàn)粒體DNA(?0)的酵母株系,發(fā)現(xiàn)這些氧化磷酸化突變體的線(xiàn)粒體膜電位逐漸降低(WT>缺失復(fù)合物Ⅲ/Ⅳ>缺失復(fù)合物Ⅴ>?0)。研究人員對(duì)這些突變體的轉(zhuǎn)錄組和線(xiàn)粒體蛋白質(zhì)組進(jìn)行了全面分析,發(fā)現(xiàn)伴隨著線(xiàn)粒體膜電位的逐漸降低,細(xì)胞會(huì)啟動(dòng)越來(lái)越多的適應(yīng)性反應(yīng):(1)所有突變體都下調(diào)轉(zhuǎn)錄因子Hap4的翻譯效率,進(jìn)而下調(diào)Hap4下游基因Inh1(線(xiàn)粒體ATP合酶抑制蛋白),從而釋放線(xiàn)粒體水解ATP的能力;(2)在線(xiàn)粒體膜電位嚴(yán)重下降的缺失復(fù)合物Ⅴ和?0突變體中,細(xì)胞激活A(yù)MPK/Snf1,從而上調(diào)糖酵解基因,同時(shí)抑制細(xì)胞質(zhì)核糖體生成。該變化加強(qiáng)細(xì)胞內(nèi)ATP供應(yīng),同時(shí)減少ATP消耗,從而增強(qiáng)了線(xiàn)粒體的ATP供應(yīng);(3)同樣在缺失復(fù)合物Ⅴ和P0突變體中,細(xì)胞高磷酸化mRNA結(jié)合蛋白Puf3,上調(diào)其結(jié)合的數(shù)百條編碼線(xiàn)粒體蛋白的mRNA,從而促進(jìn)線(xiàn)粒體生成(biogenesis)。在Puf3的數(shù)以百計(jì)的底物中,線(xiàn)粒體膜間隙蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)受體Mia40的上調(diào)最為關(guān)鍵。抑制這些反應(yīng),例如阻斷Inh1下調(diào),?0突變體無(wú)法維持膜電位和鐵硫簇的合成,導(dǎo)致細(xì)胞生長(zhǎng)停滯和死亡。綜合而言,細(xì)胞在氧化磷酸化缺失情況下啟動(dòng)線(xiàn)粒體內(nèi)外的適應(yīng)性反應(yīng),以維持線(xiàn)粒體膜電位、鐵硫簇的合成和細(xì)胞的存活與增值。
在人類(lèi)線(xiàn)粒體疾病中,超過(guò)150個(gè)致病基因突變后導(dǎo)致氧化磷酸化缺陷。這些疾病的發(fā)生往往伴隨著線(xiàn)粒體膜電位的降低。鑒于酵母細(xì)胞維持線(xiàn)粒體膜電位機(jī)制的效應(yīng)蛋白高度保守,本研究對(duì)線(xiàn)粒體疾病的致病機(jī)理和治療思路具有一定參考價(jià)值。
蔣輝實(shí)驗(yàn)室的劉思琪是第一作者,蔣輝博士為通訊作者。論文的其他作者包括蔣輝實(shí)驗(yàn)室的劉珊珊、何白羽、李蘭蘭博士,蛋白質(zhì)組中心的李琳博士、陳涉博士,以及核酸測(cè)序中心的王家文博士、蔡濤博士。該研究在北京生命科學(xué)研究所完成。
論文鏈接: https://www.embopress.org/doi/full/10.15252/embr.202051606
來(lái)源:NIBS

