還在認(rèn)為沒有實(shí)驗(yàn)就不能發(fā)表論文？

手頭有很多數(shù)據(jù)，不知道該怎么進(jìn)一步挖掘？

還在為不知道如何找靶點(diǎn)而苦惱？

還在為不精通挖掘GEO、TCGA等數(shù)據(jù)庫而痛苦不堪？

還在為不會(huì)那些高大上的圖表而暗自傷神？

快來參加北京市計(jì)算中心舉辦的生物醫(yī)學(xué)公共數(shù)據(jù)深度挖掘及應(yīng)用培訓(xùn)班吧！

本次培訓(xùn)對目前公共數(shù)據(jù)挖掘熱點(diǎn)進(jìn)行系統(tǒng)介紹，提供一次系統(tǒng)了解TCGA、GEO、SRA、ENCODE等數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)產(chǎn)生、分析及挖掘的課程。通過大量演練操作，幫助科研人員利用這些公共數(shù)據(jù)庫挖掘多組學(xué)數(shù)據(jù)，以便為自身科研項(xiàng)目服務(wù)。歡迎報(bào)名參加。更多消息可關(guān)注“生信會(huì)議”公眾號，會(huì)給您帶來更多驚喜！

授課對象：

從事生物醫(yī)學(xué)研究的臨床醫(yī)生、轉(zhuǎn)化研究科研人員；

課題經(jīng)費(fèi)不足，無法進(jìn)行大規(guī)模測序，但需要發(fā)表SCI論文的相關(guān)研究人員；

已獲得轉(zhuǎn)錄組、基因組等多組學(xué)數(shù)據(jù)，需要進(jìn)一步挖掘分析人員；

對生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)分析與挖掘感興趣的其他人員。

培訓(xùn)效果：

短、平、快，為基金申請保駕護(hù)航，發(fā)表paper如虎添翼；

掌握多組學(xué)數(shù)據(jù)分析核心技能，GEO、TCGA、SRA數(shù)據(jù)處理沒有壓力；

科研繪圖：以一敵百，高端大氣，私人訂制；

一套數(shù)據(jù)多角度演練，更易掌握分析思路。

主辦單位：北京市計(jì)算中心有限公司

協(xié)辦單位：北京市基因測序與功能分析工程技術(shù)研究中心

云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地

北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實(shí)踐基地

舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產(chǎn)業(yè)3號樓

課程安排：2022年6月14日-17日（周二–周五） 上午9:30-11:30 ?下午13:30-17:00

時(shí)間 主題 授課內(nèi)容 備注
第一天 組學(xué)及生物信息學(xué)概述 1、組學(xué)研究概述（基因組學(xué)，轉(zhuǎn)錄組學(xué)，表觀組學(xué)，蛋白質(zhì)組學(xué)，代謝組學(xué)及相關(guān)技術(shù)介紹）
2、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測序原理
3、生物信息學(xué)背景知識介紹		 理論
公共數(shù)據(jù)庫挖掘熱點(diǎn)介紹 4、人工智能研究在病理切片識別上的應(yīng)用
5、人工智能多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析		 理論
常用生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫介紹 6、用生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫介紹：
（1）大型綜合數(shù)據(jù)庫：NCBI、UCSC
（2）公共高通量測序數(shù)據(jù)庫：SRA
（3）公共基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)庫：GEO
（4）公共癌癥多組學(xué)數(shù)據(jù)庫：TCGA
7、各大數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)下載		 理論+演示
第二天 R語言入門 8、R語言簡介
9、R語言安裝及配置
10、R語言數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)
11、R語言數(shù)據(jù)處理
12、R語言繪圖		 理論+實(shí)操
基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練（一） 13、差異表達(dá)分析及結(jié)果可視化：
（1）edgeR包使用
（2）火山圖繪制
（3）聚類熱圖繪制
14、GO、KEGG功能富集分析及結(jié)果可視化：
（1）GO富集分析
（2）KEGG富集分析
（3）富集分析氣泡圖繪制		 理論+實(shí)操
第三天 基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練（二） 15、預(yù)后相關(guān)性分析、生存曲線、ROC曲線繪制：
（1）利用R包進(jìn)行單因素及多因素預(yù)后分析
（2）生存曲線繪制、生存曲線差異顯著性分析
（3）RISK score計(jì)算及結(jié)果可視化		 理論+實(shí)操
基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練（三） 16、利用string數(shù)據(jù)庫查詢基因/蛋白相互作用
17、網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析、關(guān)鍵基因識別		 理論+實(shí)操
基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練（三） 18利用cytoscape工具構(gòu)建相互作用網(wǎng)絡(luò) 實(shí)操
第四天 多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析演練（一） 19、表觀組高通量數(shù)據(jù)原理
20、甲基化與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路
21、表觀組公共數(shù)據(jù)庫：ENCODE、regulomeDB		 理論
多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析演練（一） 22、甲基化數(shù)據(jù)預(yù)處理
23、差異甲基化位點(diǎn)及區(qū)域識別
24、差異分析結(jié)果可視化		 實(shí)操
多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析演練（二） 25、lncRNA-miRNA-mRNA全轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練
（1）lncRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù)獲取
（2）miRNA靶基因分析
（3）lncRNA與mRNA表達(dá)相關(guān)性分析
（4）ceRNA網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及結(jié)果可視化		 理論+實(shí)操

注：內(nèi)容以實(shí)際發(fā)生為準(zhǔn)；若調(diào)，會(huì)提前通知。

【報(bào)名費(fèi)用】

注冊費(fèi)：4800元/人（含當(dāng)期聽課費(fèi)、資料費(fèi)、證書費(fèi)、考試費(fèi)（如有））。培訓(xùn)期間，食宿自理。

提供當(dāng)期視頻回放以供復(fù)習(xí)使用（羽林學(xué)院平臺）。

開具增值稅發(fā)票，提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書等相關(guān)材料。

【報(bào)名優(yōu)惠政策】

1、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少300元；

2、4+1團(tuán)報(bào)，可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額；

3、上面優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受，只能享受其中一種；

老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。

培訓(xùn)以收到學(xué)員培訓(xùn)費(fèi)為成功報(bào)名，培訓(xùn)座位按收到費(fèi)用先后順序安排。

【付費(fèi)方式】

現(xiàn)金、支票、銀行轉(zhuǎn)賬、銀行匯款、現(xiàn)場刷卡

單位全稱：北京市計(jì)算中心有限公司

賬號：0200151819100023937

開戶銀行：中國工商銀行股份有限公司北京永豐支行

（匯款信息備注：“生物計(jì)算——您的姓名”,個(gè)人匯款請備注單位名稱）

注：款項(xiàng)支出后，請?zhí)峁└犊罨貓?zhí)給工作人員，方便核實(shí)到賬、開具發(fā)票。

【咨詢請聯(lián)系】

QQ號：659230635

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