5月5日,時空組學聯(lián)盟啟動暨首期專輯成果發(fā)布會在深圳國家基因庫舉行,華大等機構領銜、來自16個國家的80多位科學家共同參與的時空組學聯(lián)盟(STOC)宣布成立。該聯(lián)盟的首期成果實現(xiàn)了全球首批生命時空圖譜繪制,日前以專題的形式在Cell出版社官網(wǎng)發(fā)布。
發(fā)布會現(xiàn)場正式啟動國際化科學聯(lián)盟——時空組學聯(lián)盟,聯(lián)盟旨在推動時空組學技術在生命科學各個領域的廣泛應用,將在器官、疾病、發(fā)育、演化四個方向充分發(fā)揮時空組學的技術優(yōu)勢,促進物種演化,胚胎發(fā)育,疾病機理等領域的研究。?
華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO時空組學聯(lián)盟成立儀式

深圳市鹽田區(qū)政府副區(qū)長、黨組成員李強強,深圳市鹽田區(qū)科技創(chuàng)新局黨組書記、局長曹筠,深圳市大鵬新區(qū)科創(chuàng)經(jīng)服局局長段曉偉,中科院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院研究員Miguel Esteban,南方科技大學醫(yī)學院藥理學系副教授、研究員胡宇慧,華大集團聯(lián)合創(chuàng)始人、理事長楊煥明院士,華大集團董事長、聯(lián)合創(chuàng)始人汪建,華大集團聯(lián)合創(chuàng)始人、監(jiān)事長劉斯奇,深圳華大生命科學研究院院長、系列文章通訊作者徐訊,深圳華大生命科學研究院時空組學首席科學家、小鼠時空圖譜論文的第一作者陳奧,深圳華大生命科學研究院單細胞組學領域首席科學家、系列文章通訊作者劉龍奇,深圳華大生命科學研究院生物信息首席科學家、系列論文的通訊作者黎宇翔及多位華大領導參與本次成果發(fā)布會。

華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO△中國科學院蒲慕明院士線上致辭華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO
△中國工程院曹雪濤院士線上致辭
華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO
△《細胞》雜志科學編輯Yang Yang線上致辭
華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO△劍橋大學臨床醫(yī)學院分子血液學教授Berthold G?ttgens致辭
華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO△劍橋大學臨床醫(yī)學院院長Patrick H. Maxwell致辭
華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO△瑞典卡羅林斯卡學院 神經(jīng)科學家Jan Mulder致辭
華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO△印度希夫-納達爾大學教授Sanjeev Galande致辭
中國科學院院士、中科院腦科學與智能技術卓越創(chuàng)新中心主任蒲慕明,中國工程院院士、南開大學校長曹雪濤,《細胞》雜志科學編輯Yang Yang,劍橋大學惠康-英國醫(yī)學研究委員會劍橋干細胞研究所所長Berthold G?ttgens,英國劍橋大學臨床醫(yī)學院院長Patrick Maxwell,牛津大學納菲爾德醫(yī)學院院長Richard Cornall,瑞典卡羅林斯卡學院神經(jīng)科學家Jan Mulder,印度希夫-納達爾大學教授Sanjeev Galande等嘉賓以線上視頻的形式對聯(lián)盟成立及首期成果發(fā)布表示祝賀。
Berthold G?ttgens教授是時空組學聯(lián)盟的成員之一,他通過視頻表示:“我們能將已在中國取得發(fā)展的大量新技術更廣泛地為世界各地研究人員所用,這能夠幫助我們了解單細胞的基因組和轉錄組學領域,并為基礎和遺傳學研究帶來極大影響?!?/section>
時空聯(lián)盟成員、中科院腦科學與智能技術卓越創(chuàng)新中心主任蒲慕明院士表示:“過去10年、20年間出現(xiàn)的各類組學所產(chǎn)生的大量數(shù)據(jù)都缺少時空信息,而時空信息的收集、分析、建模等大量工作,需要生物學、計算機、數(shù)學、工程學等多領域的人才加入,需要很多單位共同參與完成。因此,聯(lián)盟是生物學未來的新方向,代表了一個相當龐大的領域?!??
華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO
△深圳市鹽田區(qū)政府副區(qū)長、黨組成員李強強致辭
華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO△深圳市大鵬新區(qū)科創(chuàng)經(jīng)服局局長段曉偉致辭
深圳市鹽田區(qū)政府副區(qū)長、黨組成員李強強代表鹽田區(qū)政府對華大本次重大成果的發(fā)布表示祝賀,并表示華大為深圳和鹽田衍生和聚集了生命科學領域的企業(yè),輻射帶動了以華大為龍頭的生命科學集群發(fā)展壯大。近些年鹽田區(qū)發(fā)展雙區(qū)驅動,借建設東部濱海生物谷的契機,積極謀劃和華大在高端醫(yī)療器械、大健康、合成生物等領域合作,這次成果的發(fā)布也將對推動鹽田加快構建現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)體系,做實生物醫(yī)藥和產(chǎn)業(yè)搶占先機具有重要意義。
深圳市大鵬新區(qū)科創(chuàng)經(jīng)服局局長段曉偉表示,“大鵬新區(qū)作為深圳東部濱海先進制造業(yè)基地,近年來在科技創(chuàng)新方面取得了一些成果,接下來也將把生物科技作為新區(qū)發(fā)展的重要方向,打造更舒適、宜居宜業(yè)宜游的創(chuàng)業(yè)環(huán)境?!?/section>
華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO華大集團董事長、聯(lián)合創(chuàng)始人汪建致辭
華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO△中國科學院院士、華大集團聯(lián)合創(chuàng)始人楊煥明線上致辭
華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO△華大集團監(jiān)事長、聯(lián)合創(chuàng)始人劉斯奇致辭

華大集團董事長、聯(lián)合創(chuàng)始人汪建表示,“華大從人類基因組計劃的參與者,到水稻基因組的獨立完成者,到今天一個新的全球聯(lián)盟的發(fā)起者,已經(jīng)完成了一個完整的蛻變過程,而這個過程是在深圳這片土地上實現(xiàn)的。未來,華大將繼續(xù)產(chǎn)學研的全面貫通,用科學技術、產(chǎn)業(yè)和教育的成果來接受時空的檢驗,也希望全球的科技合作者們在時空的尺度上來考驗我們、支持我們,共同創(chuàng)造生命科學新的里程碑。

華大領銜啟動時空組學聯(lián)盟 首期成果重磅發(fā)布-肽度TIMEDOO
△發(fā)布會交流環(huán)節(jié)
交流環(huán)節(jié)中,系列文章的通訊作者徐訊、劉龍奇、黎宇翔,小鼠時空圖譜論文的共同第一作者陳奧,小鼠時空圖譜論文共同通訊作者Miguel A. Esteban,果蠅論文共同通訊作者胡宇慧進一步解讀了本次系列研究成果。

徐訊介紹了本次研究所使用的時空組學Stereo-seq技術,“這項技術實際上就是要在時間維度和空間維度上對生命的基本單元,也就是細胞進行定義。這是顯微鏡、測序技術之后生命科學研究工具上的重大突破,其所帶來的應用,能夠讓我們更清楚地去理解和觀察生命、認知疾病,進而發(fā)現(xiàn)治療疾病的辦法,最終為人類健康帶來極大的改善。

本次成果在五四青年節(jié)發(fā)布,對此徐訊表示:“這項研究的團隊中有不少80后、90后科學家,很多青年科學人才來到華大之后,在大平臺的支撐、大科學工程的組織范式下,他們的創(chuàng)新想法能夠快速地得以實現(xiàn),這也是華大培養(yǎng)人才的一個非常特殊的模式?!?
陳奧對Stereo-seq技術的應用方向進行介紹,“Stereo-seq技術可以應用的研究方向非常廣,包括人類器官結構解析、人類疾病研究、胚胎發(fā)育、物種演化這四大方向。這次的系列研究中我們已經(jīng)成功把時空組學技術應用于動物胚胎發(fā)育、植物發(fā)育、腦科學、腫瘤等多個不同領域,證明了該技術的普適性,將來可以應用到生命科學與臨床醫(yī)學研究的各個領域?!?/section>
劉龍奇補充道:“通過全景圖譜的繪制,我們能夠推動解決生命科學領域一些存在已久的難題。以人類發(fā)育疾病為例,過去發(fā)現(xiàn)了很多與人類發(fā)育相關的變異,這些變異導致母親懷孕的過程中流產(chǎn)或者新生兒出現(xiàn)出生缺陷的情況,比如唇腭裂、唐氏綜合征等,但大家不了解其背后的原理。現(xiàn)在,我們能夠借助時空組學Stereo-seq技術,找到它在發(fā)育的哪些時期、哪個器官、哪種細胞類型發(fā)生了異常,這對未來潛在的治療具有重要意義?!?/section>
黎宇翔表示:“Stereo-seq技術最主要的特點是大視場和高分辨,因此也帶來了數(shù)據(jù)量龐大、精確度要求高兩個不同的挑戰(zhàn)。為此,我們的算法團隊重新設計了一套既高效,又準確并且能夠容錯的算法,這里面涉及到非常多的技術創(chuàng)新。我們也希望通過聯(lián)盟吸引更多科學家參與進來,共同挖掘新的算法,讓這項技術變得更好?!?/section>
作為時空組學聯(lián)盟成員,胡宇慧表示:“21世紀初,我們看到人類基因組計劃的完成,在此之后生命科學的研究得到高速發(fā)展,其中一個顯著特征就是產(chǎn)生了巨大的基因表達數(shù)據(jù)。但我們一直困惑的事情是,這些大量的數(shù)據(jù)是分散的、獨立存在的,缺少了具體的相互之間的位置關聯(lián)信息,而華大這項具有自主產(chǎn)權的劃時代的技術,把整個生命科學研究推向了新的領域,讓我們能以全新的角度去看待生命科學領域中的很多問題,去提出新的問題,去尋找解決這些問題的答案。
Miguel A. Esteban認為:“通過時空組學技術,我們不僅能逐步剖析人體里數(shù)以萬億計的細胞,實際上,我們可以在不同年齡、不同物種、不同條件下研究各種疾病。時空組學技術就像一艘宇宙飛船,可以將我們帶到這個擁有數(shù)萬億個細胞的宇宙,而我們就是宇航員。聯(lián)盟這種讓來自世界各地的人們都能分享、發(fā)現(xiàn)新事物的能力非常重要,因為我們的熱情會越來越高,我們可以一起努力創(chuàng)造歷史,為人類和整個世界做更多的事情?!?/section>
關于時空組學聯(lián)盟的目標,華大集團董事長特別助理、時空聯(lián)盟組織委員會成員劉偉斌表示:“時空組學聯(lián)盟希望未來能夠通過科研成果改變人類對自身身心、生老病死、起源與未來,以及對地球生物圈的認知。本次發(fā)表的成果是聯(lián)盟實現(xiàn)遠大目標的第一步,為聯(lián)盟共同完成多物種時空組學圖譜奠定了堅實的基礎,也驗證了這些工具和方法用于繪制其他時空組學圖譜的可行性和通用性。時空組學聯(lián)盟的愿景激動人心但也充滿挑戰(zhàn)。這個國際化的組織會齊心協(xié)力,跨越生物、數(shù)理化、工程、計算機等多個學科,會連接醫(yī)療服務、產(chǎn)業(yè)和資助機構等多種類型的參與方。未來,我們會持續(xù)共同規(guī)劃前進的藍圖,共建新型工具和能力,共享資源和成果,一起迎接未知挑戰(zhàn)?!?/section>
編輯:李麗