AJHG:給新生兒做基因測序 美國人已經(jīng)這樣做了
大部分嬰兒在出生時要接受足跟血篩查等檢測,以診斷某些疾病,如苯丙酮尿癥、先天性甲狀腺功能低下等。然而,這種生化檢測能夠適用的疾病種類并不全面。
如何克服這一局限性?新生兒測序或許是個辦法。
圖片來源:AJHG
近日,一組科學(xué)家在《美國人類遺傳學(xué)雜志》(AJHG)雜志上報告稱,他們對127名健康新生兒以及32名患病新生兒進(jìn)行了外顯子組測序,發(fā)現(xiàn)了15名攜帶基因變異的嬰兒。這些基因變異會使新生兒具有患病風(fēng)險,而這類風(fēng)險是傳統(tǒng)篩查無法檢測到的。
新生兒測序計劃
圖片來源:The Genomes2People
該研究是名為“新生兒測序計劃”(BabySeq)的項(xiàng)目的一部分。5年前,美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)資助了包括BabySeq在內(nèi)的4個項(xiàng)目,旨在探索基因組測序在新生兒篩查中的應(yīng)用。
BabySeq是首個對新生兒進(jìn)行測序的隨機(jī)試驗(yàn),由布萊根婦女醫(yī)院和波士頓兒童醫(yī)院的研究人員聯(lián)合發(fā)起,貝勒醫(yī)學(xué)院的研究人員也參與其中。
參與試驗(yàn)的268個家庭都面見了一位遺傳顧問,目的是討論一般的家族史。之后,超過一半的家庭對新生兒進(jìn)行了全外顯子組測序,并利用Sanger測序驗(yàn)證了所有變異。
領(lǐng)導(dǎo)該研究的臨床分子遺傳學(xué)家Ozge Cehan-Birsoy和她的團(tuán)隊查看這些測序信息后會撰寫一份臨床報告,然后交給新生兒的家庭,放進(jìn)他們的醫(yī)療記錄,供兒科醫(yī)生使用。
在報告中,Cehan-Birsoy等提供了指示患兒童疾病任何風(fēng)險的信息,以及與兒童用藥副作用相關(guān)的基因突變。此外,研究人員還讓參與試驗(yàn)的新生兒父母選擇,是否需要了解與成人疾病發(fā)病風(fēng)險相關(guān)的基因變異,如BRCA1 和BRCA2。
基因測序發(fā)現(xiàn)了什么
圖片來源:The Genomes2People
具體來說,研究顯示,接受測序的159名嬰兒中,有15人攜帶與患兒童疾病風(fēng)險相關(guān)的基因變異。這些變異與多種疾病有關(guān),包括幾種心臟病(如擴(kuò)張型或肥厚型心肌病、瓣上主動脈瓣狹窄)、生物素代謝酶缺乏以及聽力喪失。
其中,攜帶與生物素代謝酶缺乏相關(guān)突變的新生兒經(jīng)進(jìn)一步檢測,確認(rèn)患有部分生物素酶缺乏癥(Biotinidase Deficiency,一種罕見病),這種疾病會導(dǎo)致皮疹、脫發(fā)和癲癇發(fā)作。目前,該患兒的飲食中正在添加生物素,有望預(yù)防這類疾病的臨床表現(xiàn)。
此外,有2名嬰兒的基因組中含有與癌癥相關(guān)的BRCA2突變,其中一名嬰兒的母親具有乳腺癌家族史。有8名嬰兒攜帶與藥物不良反應(yīng)相關(guān)的基因突變。
測序的價值“仍未知”
Alan Beggs博士(圖片來源:波士頓兒童醫(yī)院)
BabySeq的項(xiàng)目發(fā)起人之一、波士頓兒童醫(yī)院的遺傳學(xué)家Alan Beggs表示,目前來說,他們面對的一個難題是:大部分他們發(fā)現(xiàn)的基因變異都與新生兒目前所患的任何疾病沒有關(guān)系。那么,這些基因變異究竟會如何影響孩子呢?盡管這類基因信息可能有一定的預(yù)測價值,但它不是確定的。孩子們在未來不會患任何相關(guān)的疾病也是有可能的。
此外,他還表示,盡管新生兒基因測序可能會帶來有益的、甚至是救命的影響,但也會讓孩子的父母感到不安。究竟測序篩查帶來的經(jīng)濟(jì)壓力和家庭心理壓力,與其帶來的好處之間會是怎樣一個平衡?這是BabySeq項(xiàng)目真正想要尋找的答案。而時間將回答這一問題。
北卡羅來納大學(xué)教堂山分校的兒科醫(yī)生、遺傳學(xué)家Cynthia Powell對此表示認(rèn)同,她希望研究人員能夠長期跟蹤接受測序的新生兒,以了解他們之后患病的情況。盡管如此,Powell仍認(rèn)為,這項(xiàng)研究提供了相當(dāng)有說服力的證據(jù),證明基因組測序是有幫助的。
然而,盡管測序能夠提供更多關(guān)于新生兒的信息,但全面推廣還有很多阻礙。一方面,據(jù)估計,臨床外顯子組測序可能會花費(fèi)每人幾千美元;相比之下,新生兒足跟血篩查以及血液檢測最多需要幾百美元。另一方面,外顯子組測序是否會給嬰兒帶來更好的結(jié)果還有待觀察。此外,對基因數(shù)據(jù)正確、全面的解讀也是一大未解的難題。
圖片來源:The Genomes2People
寫在最后
近年來,隨著測序技術(shù)在臨床應(yīng)用中越來越普遍,我們似乎正邁向“基因組醫(yī)學(xué)時代”。未來,不僅測序成本會進(jìn)一步降低,對基因數(shù)據(jù)的解讀也必定會更加更熟。每個人的基因信息將變得越來越重要。
盡管這一趨勢明顯,但美國的這項(xiàng)新生兒測序計劃進(jìn)展地并不是非常順利。2016年,Science曾報道,愿意加入該項(xiàng)目的家庭占受邀家庭的比例不到10%。那么,給你的新生兒做個測序,你愿意嗎?
來源:生物探索


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