5月19日，由深圳華大生命科學(xué)研究院聯(lián)合中國(guó)科學(xué)院微生物研究所共同提出，中國(guó)食品發(fā)酵工業(yè)研究院有限公司、深圳華大智造科技股份有限公司等共同參與制定的國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)《ISO/TS 24420:2023 Biotechnology — Massively parallel DNA sequencing—General requirements for data processing of shotgun metagenomic?sequences（暫譯名：生物技術(shù)-大規(guī)模并行DNA測(cè)序-鳥槍法宏基因組數(shù)據(jù)處理通用要求）》發(fā)布。該項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)是全球首個(gè)針對(duì)宏基因組數(shù)據(jù)處理進(jìn)行規(guī)范的國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)。
標(biāo)準(zhǔn) | 華大智造參與制定，全球首個(gè)針對(duì)宏基因組數(shù)據(jù)處理的國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)發(fā)布-肽度TIMEDOO
宏基因組測(cè)序能夠?qū)Χ喾N環(huán)境中微生物種群的種類及其相對(duì)豐度進(jìn)行定性和定量，并確定這些種群中單個(gè)生物的遺傳信息，在醫(yī)療檢測(cè)、健康管理等領(lǐng)域得到了廣泛應(yīng)用。測(cè)序數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化處理和質(zhì)量控制是開展宏基因組學(xué)分析的前提，關(guān)系到復(fù)雜生態(tài)群落物種的鑒定，并顯著影響宏基因組學(xué)分析結(jié)果的可靠性。因此，制定宏基因組數(shù)據(jù)處理標(biāo)準(zhǔn)，對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理，規(guī)范數(shù)據(jù)質(zhì)量，對(duì)于解決目前宏基因組研究中高深度測(cè)序帶來的數(shù)據(jù)極端復(fù)雜化問題、提升超大隊(duì)列數(shù)據(jù)的處理與管理等具有重要意義。
本次發(fā)布的ISO/TS 24420:2023聚焦最為常用的鳥槍法測(cè)序，闡述了宿主共生微生物組和環(huán)境微生物宏基因組的測(cè)序數(shù)據(jù)處理工作流程，規(guī)定了用于大規(guī)模并行DNA測(cè)序的鳥槍法宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)處理的質(zhì)量控制要求，為鳥槍法宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)目錄、數(shù)據(jù)存檔和元數(shù)據(jù)提供了指南，適用于鳥槍法宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、共享和互操作。
該項(xiàng)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)提案由華大研究院宏基因組團(tuán)隊(duì)于2018年12月開始籌備，并于2020年6月22日經(jīng)國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)化組織生物技術(shù)委員會(huì)（ISO/TC 276）成員國(guó)投票通過，正式立項(xiàng)。來自德國(guó)、美國(guó)、日本、盧森堡等多國(guó)專家共同參與了該標(biāo)準(zhǔn)的制定。期間，團(tuán)隊(duì)多次組織各國(guó)專家召開線上會(huì)議，對(duì)標(biāo)準(zhǔn)技術(shù)內(nèi)容進(jìn)行討論和交流，并征求匯總相關(guān)國(guó)際組織的意見。歷經(jīng)三年的標(biāo)準(zhǔn)周期，終于2023年5月19日正式發(fā)布。
編輯：李麗