2018年3月上旬circRNA研究報道匯總
本月上旬的circRNA研究文獻(xiàn)共計15篇,涉及脂肪肝、肝炎、高血壓、狼瘡性腎炎、妊娠糖尿病和卵巢子宮癌等12個疾病方向,這些研究為circRNA在各疾病領(lǐng)域的作用機(jī)制提供了很好的前期研究基礎(chǔ)。在circRNA的技術(shù)應(yīng)用方面,來自德國吉森大學(xué)醫(yī)學(xué)院生化所的研究人員構(gòu)建了人工circRNA分子,可以吸附丙肝細(xì)胞中的miR-122,進(jìn)而阻止HCV病毒蛋白形成,緩解丙型肝炎,下面我們一起了解下該項研究的具體內(nèi)容。
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人造circRNA分子阻止丙型肝炎病毒進(jìn)程
論文題目:Functional sequestration of microRNA-122 from Hepatitis C Virus by circular RNA sponges.
雜志:RNA biology
影響因子:3.9分
通訊作者單位:德國吉森大學(xué)
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研究者將丙型肝炎病毒(HCV)引起的肝炎作為研究對象,HCV是一種單鏈RNA病毒,缺乏5’帽子結(jié)構(gòu),可通過高度結(jié)構(gòu)化的內(nèi)部核糖體進(jìn)入位點(diǎn)IRES啟動蛋白翻譯,HCV是肝臟細(xì)胞特異性病毒,已有研究表明HCV的這種嗜肝細(xì)胞特性主要依賴人體內(nèi)的miR-122分子,HCV病毒基因組5’端存在兩個miR-122的結(jié)合位點(diǎn),miR-122可保護(hù)病毒RNA免受Xrn-1的核酸外切降解,增強(qiáng)病毒復(fù)制和病毒蛋白的翻譯,從而促進(jìn)HCV的繁殖。因此miR-122已成為丙型肝炎藥物治療的主要靶標(biāo)之一,基于miR-122的鎖核苷酸LNA藥物已進(jìn)入二期臨床試驗。
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人工circRNA體外設(shè)計合成
由于circRNA的環(huán)形結(jié)構(gòu),不存在5’和3’的游離末端,在細(xì)胞中的穩(wěn)定性比線性分子更強(qiáng),因此研究者考慮將包含miRNA-122結(jié)合位點(diǎn)(串聯(lián)重復(fù))的序列體外人工合成circRNA分子。
圖注:人工構(gòu)建circRNA序列及T4連接酶成環(huán)示意圖(A,B),Nothern blot驗證體外合成的circRNA分子。人工合成的circRNA即存在細(xì)胞質(zhì)也存在于細(xì)胞核中(圖E)。
該人工設(shè)計的circRNA組成序列,主要包含4個部分,含有miR-122結(jié)合位點(diǎn)的8聚體(圖A藍(lán)色區(qū)段),隨機(jī)改組的序列(圖A灰色區(qū)段),紅色區(qū)段的互補(bǔ)配對莖部序列(利于序列成環(huán)),序列前端的T7轉(zhuǎn)錄啟動子序列和酶切位點(diǎn)。將設(shè)計合成好的DNA序列克隆到pCR2.1載體,轉(zhuǎn)錄后得到的RNA序列最后用T4連接酶進(jìn)行連接即可得到合成的circRNA。
CircRNA不僅可以吸附miRNA,還可以吸附結(jié)合蛋白,設(shè)計結(jié)合蛋白的circRNA分子或許更容易實現(xiàn),可以推測的是人工合成的circRNA可通過隔離miRNA分子抑制病毒的復(fù)制,是否也可以隔離有利于病毒擴(kuò)增的蛋白,進(jìn)一步抑制病毒進(jìn)程將是特別有意思研究方向,也為circRNA應(yīng)用與疾病治療打開了一扇新的大門。
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人工circRNA可抑制HCV蛋白翻譯
研究者使用非感染性HCV /螢光素酶報道系統(tǒng),其中HCV多蛋白開放閱讀框(ORF)的主要部分被螢光素酶ORF替代,保留HCV核心蛋白編碼序列的天然起始密碼子和前33nt,維持內(nèi)部核糖體進(jìn)入位點(diǎn)的結(jié)構(gòu)。轉(zhuǎn)染HuH-7.5細(xì)胞后檢測熒光值判斷人工circRNA抑制蛋白翻譯的作用。
圖注:熒光素酶報告實驗顯示人工circRNA可一直HCV病毒的翻譯。
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人工circRNA的作用與優(yōu)勢
????最后研究者也闡述了人工circRNA的其他可能應(yīng)用及優(yōu)勢,為circRNA進(jìn)入疾病治療的研究提供了參考方向。
1)外顯子來源的circRNA定位在細(xì)胞質(zhì),人工circRNA可進(jìn)入細(xì)胞核,可作為染色質(zhì)重塑、轉(zhuǎn)錄調(diào)控和RNA前體剪切的分子工具;
2)目前開發(fā)的miRNA誘餌LNA鎖核苷酸藥物,由于LNA修飾的特性,在人體聚集不可降解,存在肝臟毒性效益,人工circRNA模擬自然circRNA分子存在代謝途徑可避免此效益;
3)人工合成circRNA可以通過多種方法實現(xiàn),除T4連接酶體外連接,還可以通過tRNA的剪接機(jī)制生成或構(gòu)建通用過表達(dá)質(zhì)粒(如吉賽pCD-ciR系列circRNA過表達(dá)載體);
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文獻(xiàn)統(tǒng)計表
參考文獻(xiàn)見上表。
文 | circRNA 吉賽生物
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