2018年3月份下半月circRNA研究報道匯總-肽度TIMEDOO

下旬circRNA相關文獻數(shù)量共計20篇，涉及研究方向較豐富，機制方面研究主要還是環(huán)繞miRNA sponge展開，其中cancer?reaserch雜志發(fā)布的circPRKCI促進肺腺癌發(fā)展的文章，思路清晰、實驗詳盡，非常值得參考，下面我們一起解讀這篇文獻。

circPRKCI促進肺腺癌發(fā)生發(fā)展

論文題目：The circular RNA circPRKCI promotes tumor growth in lung adenocarcinoma

雜志：cancer research
影響因子：8.55

通訊作者單位：南京醫(yī)科大學附屬腫瘤醫(yī)院

肺腺癌LAC是目前最常見的一種實體腫瘤，研究者在前期的研究中，通過circRNA芯片發(fā)現(xiàn)了107個差異表達的circRNAs，通過整合TCGA肺腺癌的CNVs數(shù)據(jù)，聯(lián)合分析發(fā)現(xiàn)一個circPRKCI的circRNA分子，該分子起源于PRKCI基因的（染色體3q26.2區(qū)異常擴增），并通過后續(xù)生物素標記miRNA探針共沉淀等實驗，發(fā)現(xiàn)circPRKCI可吸附miR-545和miR-589后，上調E2F7進而促進肺腺癌的發(fā)展。

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CircPRKCI促進肺腺癌發(fā)展的分子機制示意圖

一、circPRKCI表達水平研究

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圖注:?A,circRNA在5對肺腺癌中的表達熱圖展示;B:circos圖展示circRNA和宿主基因的表達模式，內圈為circRNA，外圈為宿主基因。

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圖注：C圖聯(lián)合TCGA的CNV數(shù)據(jù)篩選基因擴增或缺失區(qū)域的circRNAs；D圖circPRKCI來源于PRKCI15,16號外顯子反向剪接示意圖；E圖RTPCR檢測circPRKCI。

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圖注：LAC肺腺癌細胞中RNase R處理后qPCR檢測circRNA和宿主基因的表達水平，circPRKCI耐受RNA酶消化。

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圖注：circPRKCI在48對肺腺癌患者組織標本中高表達，且與腫瘤級別正相關。

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圖注：E圖生存分析發(fā)現(xiàn)circPRKCI高表達的患者生存期更短；F圖cox多元回歸分析發(fā)現(xiàn)circPRKCI表達是不良預后的獨立預測因素。

二、circPRKCI促進肺腺癌細胞惡性增殖

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圖注：a圖siRNA干擾circPRKCI設計示意圖；b和c圖qPCR檢測siRNA干擾和過表達質粒處理后circPRKCI的表達水平，d、e、f圖克隆形成、EdU和CCK8實驗表明circPRKCI促進SPC-A1細胞增殖；G圖干擾circPRKCI后細胞周期阻滯在G1期；H圖transwell實驗表明circPRKCI促進肺腺癌癌細胞SPC-A1侵襲。

三、circPRKCI吸附miR-545和miR-589上調E2F7表達

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圖注：a、b圖顯示經(jīng)FISH實驗表明circPRKCI主要定位在細胞質；c圖用抗Ago2蛋白抗體RIP實驗表明circPRKCI與Ago2結合；D圖生物素標記?miR-545, miR-589, miR-600, miR-144 and miR-670免疫沉淀后檢測circPRKCI的表達；e圖Ago2 RIP實驗表明Ago2蛋白可顯著富集miR-545和miR-589;F圖siRNA干擾circPRKCI不影響miR-545, miR-589表達水平；g圖miR-545, miR-589不影響circPRKCI的表達；H、i、j、k圖E2F7是miR-545, miR-589的靶基因。

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圖注：熒光素酶報告基因等實驗進一步證明miR-545, miR-589調控E2F7。

四、circPRKCI通過結合miR-545, miR-589促進肺腺癌細胞增殖

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圖注：功能挽救實驗證明circPRKCI通過miRNA發(fā)揮促癌功能。

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五：體內動物實驗證明circPRKCI促進LAC腫瘤形成

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圖注：裸鼠肺腺癌皮下移植模型結果顯示circPRKCI是潛在的治療靶標。

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circRNA文獻匯總表：

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文 | circRNA 吉賽生物

本文為作者授權肽度時界發(fā)布

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