2、網(wǎng)絡藥理學SCI論文研讀分析

3、網(wǎng)絡藥理學的研究思路及技術路線

1）常用中藥數(shù)據(jù)及使用：TCMSP

2）中藥高通量實驗和參考數(shù)據(jù)庫：Herb

3）中醫(yī)藥證候關聯(lián)數(shù)據(jù)庫：SymMap

4）中醫(yī)藥百科全書數(shù)據(jù)庫：ETCM

5、中藥有效成分靶點預測的查詢及獲取

1）化合物與蛋白質(zhì)互作：STITCH

2）中藥有效成分靶點的預測：SwissTargetPrediction

3）基于有效成分結(jié)構(gòu)特征靶點預測：PharmMapper

4）中藥有效成分靶點的獲?。悍聪蛱摂M篩選方法

6、中藥分子機制研究的在線生物信息學分析工具：BATMAN-TCM

實戰(zhàn)

1）人類疾病與基因遺傳變異數(shù)據(jù)庫：OMIM

2）疾病相關的基因與突變位點數(shù)據(jù)庫：DisGeNet

3）人類基因數(shù)據(jù)庫：Genecards

4）治療靶標數(shù)據(jù)庫：TTD

實戰(zhàn)

9、蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡查詢和可視化分析：STRING

10、富集分析數(shù)據(jù)庫：DAVID

11、Metascape功能富集分析和信號通路富集分析

12、富集GO term BP，CC，MF三合一柱狀圖繪制

13、通路氣泡圖的繪制

實戰(zhàn)

1）分析數(shù)據(jù)導入與導出

2）基本拓撲特征計算

3）重要節(jié)點識別

4）網(wǎng)絡拓撲指標含義

5）子網(wǎng)絡提取

6）網(wǎng)絡可視化

7）圖形導出

8）Cytoscape插件的安裝和使用

15、蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫及結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的篩選和獲?。篜DB、Uniport

16、小分子化合物結(jié)構(gòu)信息查詢：Pubchem、Drugbank

17、分子對接

1）對接軟件的介紹及安裝

2）小分子和蛋白結(jié)構(gòu)文件的預處理

3）蛋白活性位點的確定

4）分子對接流程的介紹及實戰(zhàn)

5）分子對接結(jié)果相互作用分析及可視化

實戰(zhàn)