2018年7月上旬circRNA研究報(bào)道匯總-肽度TIMEDOO

歡迎各位來(lái)到“circRNA研究報(bào)道匯總”欄目,本期共收集最新發(fā)布的circRNA文獻(xiàn)12篇,下面我們一起來(lái)看看有哪些新發(fā)現(xiàn)。

1、一種在真核細(xì)胞中進(jìn)行有效和穩(wěn)定的翻譯的工程環(huán)狀RNA

論文標(biāo)題:Engineering circular RNA for potent and stable translation in eukaryotic cells

雜志:Nat commun
影響因子?12.35

通訊作者單位:麻省理工

來(lái)自麻省理工的科學(xué)家根據(jù)circRNA的高穩(wěn)定性、難降解特性,構(gòu)建了一種基于circRNA的體外穩(wěn)定翻譯蛋白(mRNA)的工程系統(tǒng)。mRNA信使RNA在細(xì)胞中的功能非常重要,但不穩(wěn)定,半衰期短,該特性限制了mRNA工程化應(yīng)用,驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該工程circRNA系統(tǒng)可規(guī)避mRNA的這一缺點(diǎn),攜帶mRNA完整序列信息可實(shí)現(xiàn)持續(xù)穩(wěn)定的蛋白表達(dá)。研究者首先設(shè)計(jì)篩選到合理的輔助拼接序列,可在體外插入5kb的mRNA序列,實(shí)現(xiàn)體外真核mRNA的持續(xù)穩(wěn)定表達(dá),液相色譜試驗(yàn)顯示蛋白生成數(shù)量和質(zhì)量穩(wěn)定,該研究表明circRNA是實(shí)現(xiàn)線性mRNA體外穩(wěn)定表達(dá)的一種很有前景的方式。

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圖注:文章中基于circRNA的蛋白表達(dá)系統(tǒng)示意圖

2、circNT5E吸附microRNA-422a促進(jìn)膠質(zhì)瘤發(fā)展

論文標(biāo)題:CircNT5E acts as a sponge of microRNA-422a to promote glioblastoma tumorigenesis

雜志:cancer reasearch
影響因子:9.13分

通訊作者單位:平津醫(yī)院

該研究著眼于膠質(zhì)瘤中非編碼RNA之間的調(diào)控關(guān)系及對(duì)膠質(zhì)瘤發(fā)生發(fā)展的影響,研究者首先發(fā)現(xiàn)一種新的circRNA起源于NT5E基因,命名為circNT5E,可被ADARB2(RNA結(jié)合蛋白)調(diào)控成環(huán),推測(cè)circNT5E可能通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性吸附miRNA-422a發(fā)揮作用。隨后體外體內(nèi)實(shí)驗(yàn)表明,circNT5E可直接結(jié)合miR-422a抑制miR-422a的活性,進(jìn)而促進(jìn)膠質(zhì)瘤細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)移和侵襲。

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圖注:circNT5E促進(jìn)膠質(zhì)瘤發(fā)生發(fā)展分子機(jī)理示意圖

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3、唾液中環(huán)形RNA hsa_circ_0001874和hsa_circ_0001971作為診斷口腔鱗狀細(xì)胞癌的新生物標(biāo)記物的研究

論文標(biāo)題:Salivary Circular RNAs Hsa_Circ_0001874 and Hsa_Circ_0001971 as Novel Biomarkers for the Diagnosis of Oral Squamous Cell Carcinoma

雜志:Cell Physiol Biochem
影響因子?5.5分

通訊作者單位:南昌大學(xué)附屬口腔醫(yī)院

該研究選取OSCC口腔鱗狀細(xì)胞癌為研究對(duì)象,考察circRNA是否可作為OSCC的生物標(biāo)記物。首先研究者采集了3例OSCC病人的唾液和3例健康人唾液,進(jìn)行circRNA芯片篩選,q?RT-PCR對(duì)芯片差異表達(dá)的circRNA進(jìn)行驗(yàn)證,共篩選到12個(gè)上調(diào)和20個(gè)下調(diào)的circRNAs,聯(lián)合病理特征進(jìn)行卡方檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果表明,hsa_circ_0001874與OSCC的TNM分期及腫瘤分期相關(guān),hsa_circ_0001971與TNM分期相關(guān),聯(lián)合hsa_circ_0001874,hsa_circ_0001971的ROC曲線達(dá)0.922((95%?置信區(qū)間,0.883-0.961; P<0.001),很好的診斷特異性和敏感性,并能辨別來(lái)自口腔白斑病的OSCC患者。hsa_circ_0001874,hsa_circ_0001971在OSCC患者術(shù)后相比于術(shù)前顯著降低。該研究第一次從唾液中發(fā)現(xiàn)circRNA可作為OSCC患者的診斷標(biāo)記物。

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圖注:A:q?RT-PCR檢測(cè)90例OSCC和70例OLK(口腔白斑病患者)中hsa_circ_0001874,hsa_circ_0001971表達(dá)水平;B:上述circRNA在OSCC和OLK患者中的ROC曲線分析;C:OSCC和所有對(duì)照(NC和OLK)組中上述circRNA的ROC曲線分析。

4、活動(dòng)性肺結(jié)核患者血漿中circRNA失調(diào)控研究

論文標(biāo)題Dysregulated circRNAs in plasma from active tuberculosis patients

雜志J Cell Mol Med?影響因子4.30分

通訊作者單位:濰坊醫(yī)科大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)學(xué)院

結(jié)核?。═uberculosis,又稱(chēng)TB)為結(jié)核桿菌感染引起的疾病。結(jié)核通常造成肺部感染,也會(huì)感染身體的其他部分。大多數(shù)感染者沒(méi)有癥狀,此型態(tài)感染稱(chēng)為潛伏結(jié)核感染。如果此時(shí)沒(méi)有適當(dāng)治療,10%的潛伏感染患者會(huì)惡化為開(kāi)放性結(jié)核病(Active tuberculosis),致死率為 50%。結(jié)核病是全世界十大死因之一,結(jié)核桿菌易發(fā)生多耐藥性,目前依然是不容忽視的公共衛(wèi)生安全問(wèn)題。由于結(jié)核病潛伏周期長(zhǎng),潛伏期無(wú)明顯臨床表現(xiàn),缺少診斷標(biāo)志物,因此選擇開(kāi)發(fā)結(jié)核病尤其是開(kāi)放性結(jié)核病的分子標(biāo)記物,迫在眉睫。該研究項(xiàng)目前期收集活動(dòng)性TB患者血漿,進(jìn)行circRNA芯片篩查,隨后q?RT-PCR進(jìn)行驗(yàn)證,發(fā)現(xiàn)75個(gè)circRNA在活動(dòng)性TB患者血漿中顯著失調(diào)控,其中hsa_circRNA_103571在活動(dòng)性TB患者血漿中顯著低表達(dá),生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),hsa_circRNA_103571存在于TB相關(guān)的miRNA如miR-29a and miR-16相互作用,可能參與了Ras信號(hào)通路,調(diào)控肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架和T,B細(xì)胞受體信號(hào)通路等。ROC曲線分析結(jié)果也表明hsa_circRNA_103571具備良好的診斷價(jià)值。該circRNA的發(fā)現(xiàn),有望為活動(dòng)性TB患者提供一種全新的診斷標(biāo)志物。

文獻(xiàn)列表:

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文 | circRNA 吉賽生物

本文為作者授權(quán)肽度時(shí)界發(fā)布

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