2024.3.26-29·公共數(shù)據(jù)，挖掘熱點(diǎn)：生物醫(yī)學(xué)公共數(shù)據(jù)深度挖掘及應(yīng)用培訓(xùn)班-肽度TIMEDOO

還在認(rèn)為沒(méi)有實(shí)驗(yàn)就不能發(fā)表論文？

手頭有很多數(shù)據(jù)，不知道該怎么進(jìn)一步挖掘？

還在為不知道如何找靶點(diǎn)而苦惱？

還在為不精通挖掘GEO、TCGA等數(shù)據(jù)庫(kù)而痛苦不堪？

還在為不會(huì)那些高大上的圖表而暗自傷神？

快來(lái)參加北京市計(jì)算中心舉辦的生物醫(yī)學(xué)公共數(shù)據(jù)深度挖掘及應(yīng)用培訓(xùn)班吧！

本次培訓(xùn)對(duì)目前公共數(shù)據(jù)挖掘熱點(diǎn)進(jìn)行系統(tǒng)介紹，提供一次系統(tǒng)了解TCGA、GEO、SRA、ENCODE等數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)產(chǎn)生、分析及挖掘的課程。通過(guò)大量演練操作，幫助科研人員利用這些公共數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘多組學(xué)數(shù)據(jù)，以便為自身科研項(xiàng)目服務(wù)。歡迎報(bào)名參加。

授課對(duì)象：

從事生物醫(yī)學(xué)研究的臨床醫(yī)生、轉(zhuǎn)化研究科研人員；

課題經(jīng)費(fèi)不足，無(wú)法進(jìn)行大規(guī)模測(cè)序，但需要發(fā)表SCI論文的相關(guān)研究人員；

已獲得轉(zhuǎn)錄組、基因組等多組學(xué)數(shù)據(jù)，需要進(jìn)一步挖掘分析人員；

對(duì)生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)分析與挖掘感興趣的其他人員。

培訓(xùn)效果：

短、平、快，為基金申請(qǐng)保駕護(hù)航，發(fā)表paper如虎添翼；

掌握多組學(xué)數(shù)據(jù)分析核心技能，GEO、TCGA、SRA數(shù)據(jù)處理沒(méi)有壓力；

科研繪圖：以一敵百，高端大氣，私人訂制；

一套數(shù)據(jù)多角度演練，更易掌握分析思路。

主辦單位：北京市計(jì)算中心有限公司

協(xié)辦單位：北京市基因測(cè)序與功能分析工程技術(shù)研究中心

云計(jì)算關(guān)鍵技術(shù)與應(yīng)用北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓(xùn)基地

北京市大數(shù)據(jù)教學(xué)實(shí)踐基地

舉 辦 地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號(hào)北科產(chǎn)業(yè)3號(hào)樓；亦可聽(tīng)取線(xiàn)上直播

課程安排：2024年3月26-29日（周二-周五）?上9:30-11:30 下13:30-17:00

時(shí)間 主題 內(nèi)容 備注
第一天 組學(xué)及生物信息學(xué)概述 1、組學(xué)研究概述（基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)及相關(guān)技術(shù)介紹）

2、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及測(cè)序原理

3、生物信息學(xué)背景知識(shí)介紹

 理論
公共數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘熱點(diǎn)介紹 1、人工智能研究在病理切片識(shí)別上的應(yīng)用

2、人工智能多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析

 理論
常用生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)介紹 1、常用生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)介紹：

1）大型綜合數(shù)據(jù)庫(kù)：NCBI、UCSC

2）公共高通量測(cè)序數(shù)據(jù)庫(kù)：SRA

3）公共基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)庫(kù)：GEO

4）公共癌癥多組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)：TCGA

2、各大數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)下載

 理論

+演示
第二天 R語(yǔ)言入門(mén) 1、R語(yǔ)言簡(jiǎn)介

2、R語(yǔ)言安裝及配置

3、R語(yǔ)言數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)

4、R語(yǔ)言數(shù)據(jù)處理

5、R語(yǔ)言繪圖

 理論

+實(shí)戰(zhàn)
基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練（一） 1、差異表達(dá)分析及結(jié)果可視化：

1）edgeR包使用

2）火山圖繪制

3）聚類(lèi)熱圖繪制

2、GO、KEGG功能富集分析及結(jié)果可視化：

1）GO富集分析

2）KEGG富集分析

3）富集分析氣泡圖繪制

 理論

+實(shí)戰(zhàn)
第三天 基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練（二） 生存分析及結(jié)果可視化：

1）生存分析、cox模型基本原理介紹

2）模型評(píng)估基本原理介紹

3）R語(yǔ)言進(jìn)行生存分析、生存曲線(xiàn)繪制

4）R語(yǔ)言單變量、多變量cox模型構(gòu)建

5）R語(yǔ)言條件邏輯回歸模型構(gòu)建

6）R語(yǔ)言ROC曲線(xiàn)評(píng)估模型

7）HR、OR值計(jì)算，模型解釋

 理論

+實(shí)戰(zhàn)
基于公共數(shù)據(jù)的Biomarker挖掘鑒定演練（三） 生物分子網(wǎng)絡(luò)分析及可視化：

1）網(wǎng)絡(luò)簡(jiǎn)介

2）網(wǎng)絡(luò)分析（拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析、關(guān)鍵基因識(shí)別）

3）生物分子網(wǎng)絡(luò)介紹

4）利用string數(shù)據(jù)庫(kù)查詢(xún)基因/蛋白相互作用

a.單個(gè)基因/蛋白生成相互作用網(wǎng)絡(luò)

b.多個(gè)基因/蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)分析

c.調(diào)研靶標(biāo)信息少時(shí)如何拓展

5）利用cytoscape工具構(gòu)建相互作用網(wǎng)絡(luò)并分析

 理論

+實(shí)戰(zhàn)
第四天 多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析演練（一） 1、表觀組高通量數(shù)據(jù)原理

2、甲基化與轉(zhuǎn)錄組整合分析思路

3、表觀組公共數(shù)據(jù)庫(kù)：ENCODE、regulomeDB

 理論
1、甲基化數(shù)據(jù)預(yù)處理

2、差異甲基化位點(diǎn)及區(qū)域識(shí)別

3、差異分析結(jié)果可視化

 實(shí)戰(zhàn)
多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)合分析演練（二） lncRNA-miRNA-mRNA全轉(zhuǎn)錄組整合分析思路演練

1）lncRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù)獲取

2）miRNA靶基因分析

3）lncRNA與mRNA表達(dá)相關(guān)性分析

4）ceRNA網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及結(jié)果可視化

 理論

+實(shí)戰(zhàn)
單細(xì)胞公共數(shù)據(jù)庫(kù)介紹 單細(xì)胞公共數(shù)據(jù)庫(kù)

1）單細(xì)胞在線(xiàn)分析

2）數(shù)據(jù)集下載

 理論

注：內(nèi)容以實(shí)際發(fā)生為準(zhǔn)；若調(diào)，會(huì)提前通知。

【報(bào)名費(fèi)用】

注冊(cè)費(fèi)：4800元/人（含當(dāng)期聽(tīng)課費(fèi)、資料費(fèi)、證書(shū)費(fèi)、考試費(fèi)（如有））。
提供當(dāng)期視頻回放以供復(fù)習(xí)使用（羽林學(xué)院平臺(tái)）。
開(kāi)具增值稅發(fā)票，提供蓋章通知、結(jié)業(yè)證書(shū)等相關(guān)材料。

【報(bào)名優(yōu)惠政策】

1、3人以上團(tuán)體報(bào)名每人可減少300元；

2、4+1團(tuán)報(bào)，可免費(fèi)贈(zèng)送一個(gè)名額；

3、上面優(yōu)惠政策不能同時(shí)享受，只能享受其中一種；

老學(xué)員參加及推薦學(xué)員參加均可額外優(yōu)惠200元。

報(bào)名方式：?通過(guò)客服微信告知姓名+工作單位即可報(bào)名；
報(bào)名微信：vicolee2021
2024.3.26-29·公共數(shù)據(jù)，挖掘熱點(diǎn)：生物醫(yī)學(xué)公共數(shù)據(jù)深度挖掘及應(yīng)用培訓(xùn)班-肽度TIMEDOO