中國科學(xué)院生物物理研究所王曉群研究組、何順民研究組，北京師范大學(xué)吳倩研究組合作構(gòu)建了一個人類和非人靈長類大腦多組學(xué)時空圖譜數(shù)據(jù)庫——MAPbrain，首次實現(xiàn)了聚焦于靈長類腦發(fā)育多組學(xué)數(shù)據(jù)的收錄和整合，揭示了基因表達(dá)調(diào)控隨腦發(fā)育成熟的時空動態(tài)變化。相關(guān)論文10月18日發(fā)表于《核酸研究》。

伴隨著對腦發(fā)育研究的深入，促進個體在不同生命階段實現(xiàn)健康的腦發(fā)育與認(rèn)知發(fā)展，已成為全球科學(xué)家關(guān)注的重要問題。近年來，大量與腦發(fā)育相關(guān)的多組學(xué)數(shù)據(jù)層出不窮，但仍然缺乏一個綜合性的整合腦發(fā)育生物學(xué)多組學(xué)數(shù)據(jù)的專門數(shù)據(jù)資源庫，限制了研究人員從多維度全面揭示腦發(fā)育過程及其影響因素的能力。

MAPbrain整合了來自人類和5種非人靈長類動物的3類組學(xué)數(shù)據(jù)，涵蓋了6個物種，收集了2100多萬個細(xì)胞，并鑒定了161種細(xì)胞類型，覆蓋靈長類大腦的38個腦區(qū)和436個亞區(qū)，跨越了164個不同的發(fā)育時間點。用戶可以通過該數(shù)據(jù)庫實現(xiàn)對所收錄數(shù)據(jù)的交互式訪問，并能夠在跨物種、跨腦區(qū)及跨發(fā)育階段進行數(shù)據(jù)比較。同時，MAPbrain支持用戶對轉(zhuǎn)錄組學(xué)和表觀遺傳組學(xué)數(shù)據(jù)的聯(lián)動搜索和比較。

此外，數(shù)據(jù)庫還提供了1,078,709個與不同發(fā)育階段相關(guān)的特異性基因表達(dá)集，幫助用戶更深入理解特定基因在發(fā)育生物學(xué)中的功能和作用。作為一個持續(xù)更新的開放數(shù)據(jù)共享平臺，MAPbrain為用戶提供了搜索和獲取現(xiàn)有數(shù)據(jù)的便利。

相關(guān)論文信息：

https://doi.org/10.1093/nar/gkae911

來源：中國科學(xué)報